Avances en el estudio del riboswitch

A partir de descubrir (aprender) que el ARN no tiene una única función, nos cuestionamos cuáles
serían sus diferentes funciones centrándonos en aquellas presentes en las bacterias y su propósito
o relación con nuestro entorno.

La búsqueda de los genes y procariotas en los que actúan los reguladores transcripcionales es un
campo que ha evolucionado en los últimos años, entre los primeros que se estudiaron, están los
que reconocen la vitamina B12. En el artículo que leímos “Riboswitch regulates RNA”, se habla de
unas proteínas de unión a ARN y ARN no codificantes en el control de la expresión genética
mediante la unión de fuerzas, en estos estudios realizados se ha descubierto que los genes
metabólicos son bien expresados cuando dos nutrientes se presentan; la etanol amina sustrato y
la vitamina B12, un cofactor esencial para enzimas en la vía catabólica.

Pero ahora con distintas formas de identificación como los micro-arreglos de ADN (Dufva, 2009), la
secuenciación de ARNm (metatranscriptómica) (Wilhelm and Landry, 2009) y los estudios de
inmuno-precipitación de la cromatina (ChIP) (Pillai and Chellappan, 2009) nos podemos dar otra
idea de las aplicaciones que tiene la regulación del RNA, por ejemplo empezamos viendo que las
bacterias tienen grandes formas de adaptación a diferentes ecosistemas gracias a que tienen la
capacidad de utilizar lo que está a su alcance reduciendo al máximo el desperdicio de RNA y de
proteínas en procesos innecesarios, lo cual les permite responder de forma eficiente a distintos y
variados medios, pero, ¿qué función permite esta adaptación? Bueno, se debe a la base-RNA, la
regulación de esta base está controlada por otras, los riboswitches son partes de RNA detectores
de metabolitos capaces de regular parte de la transcripción, es necesario tener los genes que se
encuentran en el genoma bacteriano y así ellos están al mando de un promotor, cuando nos
referimos a un promotor, hablamos de un operon que ejerce una regulación de su propia
expresión por medio de los sustratos con los que interaccionan las proteínas codificadas por sus
genes. Pero estudios más recientes usan series temporales para la identificación de estos
operones para saber cuáles responden a perturbaciones específicas, para esto se compara la
respuesta celular mediante micro-arreglos de ADN de un grupo control con un grupo sometido a
dicha alteración físico-químico en su ambiente. Si el ARN es aislado de una muestra que ha sido
sometido a esta alteración, se podrá saber qué respuesta dan a estos estímulos.