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Las reacciones consisten en agregar un grupo polar de tamaño relativamente grande a los productos
de las reacciones de la Fase I o a los xenobióticos originales que contienen los grupos funcionales
apropiados para ser substratos de las reacciones de conjugación. Los donadores de los grupos polares
tienen que ser compuestos de alta energía, ya que las reacciones de conjugación no son
termodinámicamente favorables.
El resultado que se logra con estas reacciones es un gran incremento de la solubilidad en agua del
xenobiótico.
Aminoacidación.- La reacción consiste en la formación de una unión peptídica entre el grupo amino
de un aminoácido, normalmente glicina, y un carboxilo en el xenobiótico. Obviamente para que esta
reacción se pueda dar es indispensable que el xenobiótico tenga un grupo carboxilo. Estos
conjugados son eliminados en la orina debido a que el sistema de transporte del riñón reconoce al
aminoácido.
Las reacciones de la Fase I activan grupos funcionales, la metilación los enmascara impidiendo que
participen en reacciones de la fase II, por lo tanto, si se metilan los xenobióticos se disminuye la tasa
de eliminación del compuesto.
Como se puede ver, varias de las reacciones de la Fase II requieren de los mismos grupos funcionales,
así que los compuestos que pueden ser modificados por más de una enzima entran en reacciones
que son mutuamente competitivas.
Qué tanto tiene lugar una reacción determinada depende, de la capacidad del tejido para llevar a
cabo la reacción y de la afinidad de la enzima por el substrato. La capacidad está definida por la
cantidad de cofactor presente en el tejido cuando éste es expuesto al xenobiótico.
Por ejemplo, el fenol contiene un grupo hidroxilo y puede ser transformado por una
glucuroniltransferasa o una sulfotransferasa. La capacidad de estas reacciones dependerá de la
concentración celular de UDP glucuronato y PAPS.