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TRABAJO DE BIOQUIMICA

FASE 4 - ABP DE ÁCIDOS NUCLEICOS

GLORIA PATRICIA CANON

201101_4

TUTOR ALBERTO GARCÍA

FECHA

05 DE OCTUBRE DE 2018
ACTIVIDADES A DESARROLLAR

a) Situación problema: Ácidos nucleicos Metilación del ADN


b) Situación problema: Enzima Primera parte: La inhibición enzimática
Segunda parte: Cinética enzimática

1. Metilación enzimática del ADN para la formación de 5-metilcitosina


2. Relación Metilación del ADN y modificaciones epigénicas
3. Enfermedades que tiene su origen por la metilación del ADN.

 ALTERACION DEL ADN POR VIRUS:

Se determina que la afectación de virus al ADN produce mutaciones


“técnicamente llamado” las cuales nos expresa que.

Una mutación es el cambio en la secuencia de un nucleótido o en la


organización del ADN (genotipo) de un ser vivo,que produce una variación
en las características de este y que no necesariamente se transmite a la
descendencia. Se presenta de manera espontánea y súbita o por la acción
de mutáremos. Este cambio estará presente en una pequeña proporción de
la población (variante) o del organismo (mutación). La unidad genética
capaz de mutar es el gen, la unidad de información hereditaria que forma
parte del ADN.

En los seres pluricelulares, las mutaciones solo pueden ser heredadas


cuando afectan a las células reproductivas. Una consecuencia de las
mutaciones puede ser, por ejemplo, una enfermedad genética. Sin
embargo, aunque a corto plazo pueden parecer perjudiciales, las
mutaciones son esenciales para nuestra existencia a largo plazo. Sin
mutación no habría cambio, y sin cambio la vida no podría evolucionar.

Esta se divide en:


Mutaciones morfológicas

Afectan a la morfología del individuo, a su distribución corporal. Modifican el


color o la forma de cualquier órgano de un animal o de una planta. Suelen
producir malformaciones. Un ejemplo de una mutación que produce
malformaciones en humanos es aquella que determina
la neurofibromatosis. Esta es una enfermedad hereditaria, relativamente
frecuente (1 en 3.000 individuos), producida por una mutación en
el cromosoma 17 y que tiene una penetrancia del 100 %
y expresividadvariable. Sus manifestaciones principales son la presencia
de neurofibromas, glioma del nervio óptico, manchas cutáneas de color café
con leche, hamartomas del iris, alteraciones óseas (displasia del esfenoide,
adelgazamiento de la cortical de huesos largos). Con frecuencia hay retardo
mental y macrocefalia

Mutaciones letales y deletéreas

Son las que afectan la supervivencia de los individuos, ocasionándoles la


muerte antes de alcanzar la madurez sexual. Cuando la mutación no
produce la muerte, sino una disminución de la capacidad del individuo para
sobrevivir y/o reproducirse, se dice que la mutación es deletérea. Este tipo
de mutaciones suelen producirse por cambios inesperados en genes que
son esenciales o imprescindibles para la supervivencia del individuo. En
general las mutaciones letales son recesivas, es decir, se manifiestan
solamente en homocigosis o bien, en hemicigosis para aquellos genes
ligados al cromosoma X en humanos, por ejemplo.

Mutaciones condicionales

Las mutaciones condicionales (incluidas las condicionalmente letales) son


muy útiles para estudiar aquellos genes esenciales para la bacteria. En
estos mutantes hay que distinguir dos tipos de condiciones:
condiciones restrictivas (también llamadas no-permisivas): son aquellas
condiciones ambientales bajo las cuales el individuo pierde la viabilidad, o
su fenotipo se ve alterado, debido a que el producto afectado por la
mutación pierde su actividad biológica.

Condiciones permisivas: son aquellas bajo las cuales el producto del gen
mutado es aún funcional.

Mutaciones bioquímicas o nutritivas

Son los cambios que generan una pérdida o un cambio de alguna función
bioquímica como, por ejemplo, la actividad de una determinada enzima. Se
detectan ya que el organismo que presenta esta mutación no puede crecer
o proliferar en un medio de cultivo por ejemplo, a no ser que se le
suministre un compuesto determinado. Los microorganismos constituyen un
material de elección para estudiar este tipo de mutaciones ya que las cepas
silvestres solo necesitan para crecer un medio compuesto por sales
inorgánicas y una fuente de energía como la glucosa. Ese tipo de medio se
denomina mínimo y las cepas que crecen en él se dicen prototróficas.
Cualquier cepa mutante para un gen que produce una enzima perteneciente
a una vía metabólica determinada, requerirá que se suplemente el medio de
cultivo mínimo con el producto final de la vía o ruta metabólica que se
encuentra alterada. Esa cepa se llama auxotrófica y presenta una mutación
bioquímica o nutritiva.

Mutaciones de pérdida de función

Las mutaciones suelen determinar que la función del gen en cuestión no se


pueda llevar a cabo correctamente, por lo que desaparece alguna función
del organismo que la presenta. Este tipo de mutaciones, las que suelen ser
recesivas, se denominan mutaciones de pérdida de función. Un ejemplo es
la mutación del gen hTPH2 que produce la enzima triptófano hidroxilasa en
humanos. Esta enzima está involucrada en la producción de serotonina en
el cerebro. Una mutación (G1463A) de hTPH2 determina aproximadamente
un 80 % de pérdida de función de la enzima, lo que se traduce en una
disminución en la producción de serotonina y se manifiesta en un tipo
de depresión llamada depresión unipolar.

Mutaciones de ganancia de función

Cuando ocurre un cambio en el ADN, lo más normal es que corrompa algún


proceso normal del ser vivo. Sin embargo, existen raras ocasiones donde
una mutación puede producir una nueva función en el gen, generando un
fenotipo nuevo. Si ese gen mantiene la función original, o si se trata de un
gen duplicado, puede dar lugar a un primer paso en la evolución. Un caso
es la resistencia a antibióticos desarrollada por algunas bacterias (por eso
no es recomendable abusar de algunos antibióticos, ya que finalmente el
organismo patógeno irá evolucionando y el antibiótico no le hará ningún
efecto).

Enfermedades causadas por mutacion.

 Fibrosis quística

La fibrosis quística está producida por una mutación en el gen que codifica
la proteína CFTR. La alteración de dicha proteína provoca que las
secreciones producidas por el cuerpo humano sean más espesas de lo
habitual.

Esto origina varios problemas, como la acumulación de moco en las vías


respiratorias, produciendo inflamaciones e infecciones que pueden destruir
el tejido pulmonar. Es una enfermedad potencialmente mortal que requiere
cuidados continuos. Se estima que 1 de cada 5.000 nacidos vivos en
nuestro país sufren la enfermedad.

 Enfermedad de Huntington

La enfermedad de Huntington o Corea de Huntintong se debe a una


mutación en el gen de la huntingtina, una proteína que se cree que tendría
un papel en el almacenamiento de la memoria a largo plazo.

La mutación hace que la huntingtina se acumule en las células nerviosas,


produciendo su degeneración progresiva. Los síntomas incluyen
movimientos incontrolados (corea), dificultad para tragar, cambios de
conducta; dificultades para mantener el equilibrio y caminar; fallos en
memoria, el habla y pérdida cognitiva.

 Síndrome de Down

El síndrome de Down es una anomalía cromosómica que afecta a 1 de


cada 1.000 recién nacidos aproximadamente. Consiste en la aparición de
una copia extra del cromosoma 21.

Las mujeres de mayor edad tienen más probabilidades de dar a luz a un


hijo con Down. Las personas con síndrome de Down sufren retrasos en el
desarrollo, malformaciones cardiacas y del sistema digestivo y tienen una
apariencia externa característica.

 Distrofia muscular de Duchenne

La distrofia muscular de Duchenne se produce por una mutación en el gen


de la distrofina, una proteína de las células musculares. La enfermedad
provoca un debilitamiento progresivo de los músculos, acompañado de
debilidad. Los síntomas se inician antes de los 6 años, y la mayoría de los
afectados están en una silla de ruedas a los 12 años.
 Anemia falciforme

La anemia falciforme o anemia drepanocítica se debe a una mutación en el


gen de la globina Beta, de la Hemoglobina.Los glóbulos rojos se deforman
como consecuencia de la mutación, y no pueden transportar correctamente
el oxígeno.

Recursos tomados de:

Bioquímica estructural: conceptos y tests (2a. ed.) Páginas: 178 a la 182

https://bibliotecavirtual.unad.edu.co:2538/lib/unadsp/detail.action?
docID=3194252#

Torres, G.(2011)Modulo de bioquímica. Universidad Nacional Abierta y a distancia


UNAD Pp 90-111. Recuperado de

http://repository.unad.edu.co/bitstream/10596/9281/1/201103_Modulo_bioquimica_
1_2013%20_final_45_leccione_WORD.pdf

García Jerez, A. ( 15,12,2015). Unidad 2 - Ácidos Nucleicos. [Archivo de video].


Recuperado de http://hdl.handle.net/10596/9756

Nombre
del Resumen
estudiant
e
Relación Metilación del ADN y modificaciones epigénicas
Es uno de los mecanismos implicados en la regulación de la
Estudiant expresión génica en mamíferos, también la maquinaria implicada
e 1. comprende diferentes proteínas reguladoras incluyendo a las
Gloria ADN metiltransferasas, es un proceso por el cual se añaden los
Patricia grupos metilo al ADN que modifica la función y actúa para reprimir
Cañón la transcripción cuando se encuentra con el gen promotor.
La metilación del ADN generalmente actúa para reprimir
la transcripción génica. La metilación del ADN es esencial para el
desarrollo normal y se asocia con una serie de procesos claves.

Analice: En términos bioquímicos que implica la metilación del ADN se produce en


las bases de citosina del ADN eucariótico, que se convierten en 5-metilcitosina por
las enzimas ADN metiltransferasa (DNMT).

Estudiante 1. La unión del grupo metilo se realiza en la 5” posición del


Gloria Patricia anillo pirimidínico de las citosinas del ADN con respecto
Cañón coca al gen que es el que tiene la información hereditaria,
este proceso hace que los nucleosomas se unan y
desactiven o activen e impidan el correcto
funcionamiento de las células esto se produce en el
desarrollo embrionario.

Analice. Por qué la metilación del ADN es de vital importancia para mantener el
silenciamiento génico en el desarrollo normal, la impronta genómica y la
inactivación del cromosoma X. En contraste, alteraciones en ella están implicadas
en algunas enfermedades humanas, especialmente aquéllas relacionadas con
defectos en el desarrollo y el proceso neoplásico.
Estudiante 1. Cuando hay un mal proceso de la metilación (imprintin o
Gloria Patricia huella genética) puede producir modificaciones o no
Cañón Coca permite la compactación de la cromatina que están
presentes en las colas de las histonas (proteínas), estas
tienen carga positiva y el ADN carga negativa lo cual
hacen que siga la cadena Cuando encontramos
patrones anormales de estas podemos deducir que son
un rango de cáncer

Analice. Por qué los aspectos moleculares de la metilación del ADN y su


participación en el desarrollo normal, el cáncer y en algunas patologías humanas
en las que los mecanismos epigenéticos han sido implicados. Los cambios en los
patrones de metilación podrán ser empleados como marcadores en cáncer y el
estado potencialmente reversible de este proceso constituye un blanco ideal para
crear estrategias terapéuticas que impliquen la reactivación o el re-silenciamiento
de genes específicos.
Estudiante 1. Los diversos tumores producen cambios en los perfiles
Gloria Patricia Cañón epigenicos donde se produce una reprogramación y
Coca altera su expresión genética que pueden replicarse y
hacer metástasis en otras células.
Las alteraciones epigenéticas pueden ser reversibles ya
que pueden tener tratamiento medicamentoso como los
inhibidores de las DNMTs o HDACs, permitiendo el
restablecimiento de los niveles de expresión génica
normales,
Las alteraciones epigenéticas globales en el cáncer,
corresponden principalmente a la hipermetilación de los
promotores de los genes supresores tumorales,
hipometilación global del DNA, junto con la sobre
expresión y actividad de las histonas-deacetilasas.

Identifique ¿Cuál es la función principal del ADN?, ¿Por qué se dice que contiene
la información de los seres vivos?

Replicación: El ADN es el encargado de llevar la información genética y debe ser


capaz de hacer copias de sí mismo de una forma casi libre de errores. El ADN es
una molécula de doble cadena, donde una Adenina en una hebra siempre coincide
con una Timina en la otra hebra, y una Citosina siempre coincide con una
Guanina. Cuando el ADN se replica, las dos hebras de ADN se separan y se
construye un nuevo par de hebras complementarias que se utilizarán en el modelo
de la cadena existente para construir una copia exacta.

Codificación: Uno de los papeles del ADN es la construcción de las proteínas


adecuadas para cada célula. El ADN realiza este papel porque contiene secciones
de tres bases que dirigen la formación de proteínas. Cada base contiene la
información que dirige el montaje de un aminoácido en una proteína.
Gestión celular: Cada célula tiene exactamente el mismo material genético, pero
diferentes células se desarrollan de diferentes formas. En un proceso llamado
diferenciación algunas células se acumulan las proteínas adecuadas para
convertirse en células hepáticas, y otros se convierten en células de la piel,
etc. Además, las células deben cambiar la forma en que operan al cambiar las
condiciones. Esto se consigue gracias al ADN, que envía señales que encienden y
apagan la producción de las proteínas implicadas en cada proceso.

La capacidad de mutar: Los cambios genéticos en una especie con el paso del
tiempo solo pueden suceder si el ADN es capaz de mutar. El ADN puede mutar en
varios puntos. Algunas mutaciones se transmitirán a la descendencia y podrán
provocar un cambio evolutivo.

*Aclare los siguientes términos:

Cromatina: El material genético de la célula eucariota está organizado en una


estructura compleja compuesta de ADN y proteínas localizada en un
compartimento especializado, el núcleo. Esta estructura se ha denominado
cromatina.

Cromosoma: Es una estructura en el interior de la célula que contiene la


información genética.

Gen: El gen es la unidad física básica de la herencia.

ADN: Material genético en el que se encuentran las instrucciones que determinan


todas las características y funciones de un organismo.

¿Cuál es la diferencia entre ellos?

El ADN es la molécula pura, la cromatina es el ADN más histonas y el cromosoma


es toda la hebra de ADN condensada con cromatinas, topoisomerasas,
centrómero y diversas proteínas más, que forman un cuerpo en forma de hilo.

Analice:
Consulte sobre las mutaciones y que estructura afecta en la molécula del ácido
desoxirribonucleico ADN.

Estudiante 1. Las mutaciones son alteraciones de la secuencia de


Gloria Patricia Cañón ADN. Si uno piensa en la información del ADN como una
Coca serie de oraciones, las mutaciones son fallos
ortográficos en las palabras que conforman la oración. A
veces las mutaciones no tienen consecuencias, como
una palabra con ciertos fallos ortográficos cuyo
significado aun es aún entendible. En otros casos las
mutaciones tienen ramificaciones más fuertes, como una
oración cuyo significado ha cambiado por completo.

2.De los procesos endógenos describa como pueden influir en las alteraciones
bioquímica del ácido desoxirribonucleico ADN, e igual consulte sobre los factores
externos tanto físicos, químicos o de otro tipo.

3. Identifique cual es la función principal del desoxirribonucleico ADN, ¿Por qué se

Estudiante 1. Existen varios procesos que afectan el ADN como lo


Gloria Patricia Cañón mencionado anteriormente, ciertos procesos endógenos
Coca son capaces de generar cambios en eñ ADN o producir
mutaciones.

dice que contiene la información de los seres vivos? Aclare los siguientes
términos. Cromatina, cromosoma, gen y ADN, cual es la diferencia entre ellos.
Estudiante 1. Se conoce como la molécula principal para formar vida,
Gloria Patricia Cañón esta contiene cadenas de información genética pasada
Coca por generaciones o heredada, esta información se
denomina genes, los cuales a su vez pueden hacer
paquetes de cadenas formando los llamados
cromosomas.

Cinética enzimática

El grupo realizara el siguiente ejercicio:

En experimentos de laboratorio, se utilizaron dos decarboxilasas (A y B) obtenidas


de diferente microorganismo (ver tabla). Decida cual enzima demuestra un mayor
coeficiente de especificidad, (Vmax/ Km), recuerde que entre mayor sea el valor
del coeficiente de especificidad más específica es la enzima por el substrato.

Enzima A Enzima A
[S] Vo [S] Vo
50 27 44 29
100 28 96 32
160 33 154 33
190 35 185 36
210 42 210 40
240 43 238 43
290 45 290 46
300 49 300 51
400 52 400 58
500 60 500 63
720 73 720 73
800 80 800 81
1000 87 980 87
y=mx +b

1 1
V0
=m
( )
[ S]
+b

y2 − y1
m= ( x2 −x1 )
m= ( 0.11494 −0.037037 0.077903
0.001−0.02 )= −0.019 =−4.1001
1 1
V0
=−4.1001
[ 0.001 ](+b
)
1
=−4.1001∗1.000+b
V0

b=0.11494−4.1001=4.215

1 1
V0
=4.1001
( )
[S]
+ 4.215
1 Km 1 1
=
( ) +
V 0 V max [ S ] V max

1
=4.215
V max

1
V max =
4.215

V max =0.2372

Km
=4.1001
V max

Km
=4.1001
0.2372

Km=1

y=mx +b
1 1
V0
=m
( )
[ S]
+b

y2 − y1
m= ( x2 −x1 )

m= ( 0.011494
0.00102−0.02272 ) −0.0217
−0.03448 −0.022986
= =1.0592

1 1
V0
=1.0592
( )
[ S]
+b

0.011494=1.0592∗0.00102+ b

b=0.011494−0.001=0.0104

1 1
V0
=1.0592
( )
[ S]
+0.0104

1 Km 1 1
=
( )
+
V 0 V max [ S ] V max

1
=0.0104
V max

1
V max =
0.0104

V max =96.1

Km
=1.0592
V max

Km
=1.0592
96.1

Km=101

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