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L-DKP

Alifaticos (Gly, L-ala, L-Val, L-Leu, L-Ile, L-Pro)

Asp101: C9 de 6a (L-Pro) con CG de Asp101 a 3.58.

His142: H4 de N de 1a (Gly) interacción por puente de Hidrogeno con NE2 de His142 a 2.83 A, los
demás aa no interaccionan por puente de Hidrogeno.

His143: H4 de N de 1a y 2a (Gly y Ala) interacción por puente de Hidrogeno con NE2 de His143 a
2.10 y 2.29 A.

C5 de 3a, 4a, 5a con CD2 de His143 a 3.24, 3.40, 3.21 A.

Gly151: C5 con CE1 y C2 (C=O) de 1a con CE1 y CD2 de Gly151 respectivamente a 3.89 y 3.62 A y
C5 de 6a (L-pro) con CA a 3.88 A, C3 de 4a con CA de Gly151 a 3.41 A. hidrofobicas

C7 de 2a con C (C=O) de Gly151 a 3.89 A. hidrofobicas

H1 de (NH) de 1a (glicina) y H4 de N de 3a, 4a,5a (L-Val, L-leu, L-Ile) por puente de hidrogeno con
O (C=O) de Gly151 cp a 1.83 A, 3.02, 2.95, 2.34 A.

Phe152: C6 (C=O) DE 1a (gly) con CD1 de Phe152 a 3.74 A, C5 y C7 de 2a con CD1 de Phe152 a 3.41
y 3.6 A.

C3 de 3a (L-val) , 4a (L-leu) y 5a (L-Ile)con CE1, CD1 Y CD1 respectivamente de Phe152 a 3.27, 3.17
y 3.60 A. C2 (C=O) de 6a (L-Pro) con CE1 a 3.27 A.

His180: H4 de 1a, H1 de 2a (L-ala),3a (L-val) y 4a (L-Leu) con ND1 de His180 a 3.04, 2.72, 2.24, 2.45
A.

C6 (C=O) de 2a (L-ala)y 5a (L-Ile), C2 (C=O) de 3a (L-Val) y 4a (L-Leu), C9 de 6a (L-Pro) con CE1 de


His180 a 3.16, 3.60, 3.04, 3.13 y 3.65 A.

C5 de 1a (Gly) con CG de His180 a 3.04 A.

Phe208: C7 de 3a (L-Val) , C7 y C8 DE 4a (L-Leu), C10 de 5a (L-Ile), C5 de 6a (L-Pro) con CE1 de


Phe208 a 3.47, 3.28, 3.34, 3.57, 3.36 A.

C9 de 3a y de 4a (L-Val y L-Leu), C7 de 5a (L-Ile) con CD1 de Phe208 a 3.08 y 3.58, 3.82 A.

C8 de 5a (L-Ile) y C9 de 6a (L-Pro) con CG de Phe208 a 3.43 y 3.42 A.

C9 de 5a (L-Ile) y C8 de 6a (L-Pro) con CG de Phe208 a 3.71 y 3.83 A.

C8 de 6a (L-Pro) con CZ de Phe208 a 3.93 A.


Met274: C7 con CE a Met274 a 3.83 A

Gly304: O6 (C=O) de 2a (L-Ala) y de 4a (L-Leu) con HN de Gly304 a 2.73 y 2.69 A.

Tyr306: O2 (C=O) 2a (L-Ala) , N1 de 2a, 3a y 4a (L-Ala, L-Val, L-Leu) con HH (OH) de Tyr306 a 2.49,
2.39, 2.53 y 2.30 A.

H4 de 4a (L-Leu), H1 (NH) de 5a y de 6a ( L-Ile y L-Pro) con OH de Tyr306 a 2.29, 2.25, 2.10 y 2.10
A.

C6 (C=O) de 2a (L-Val) y 4a (Leu) con CE1 y CZ de Tyr306 a 3.59 y 3.48 A.

Zn: N4 de 1a (Gly), N1 de 2a (L-Ala) y 3a (L-Val) con Zn a 1.95, 2.36, 2.15 A

O2 (C=O) de 2a con Zn a 1.90 A

O6 (C=O) de 3a, 4a, 5a y 6a con Zn a 2.04, 1.94, 2.19 y 3.26 A

7a, 8a y 16a (aromáticos)


H-10 de 16a por puente de hidrógeno con OD1=C (cl) de Asp101 a 2.42 Å.

H-4 (NH) de 7a por puente de hidrógeno con NE2 de His142 a 2.15 Å

H-1 (NH) de 8a por puente de hidrógeno con NE2 de His142 a 2.27 Å

H-4 (NH) de 7a por puente de hidrógeno con NE2 de His143 a 2.72 Å

H-1 (NH) de 8a por puente de hidrógeno con NE2 de His143 a 2.76 Å

C-5 de 16a con CD2 de His143 a 3.36 Å.

H-4(NH) de 16a, 8a y 7a por puente de hidrógeno con O (C=O) (cp) de Gly151 a


3.05, 1.91 y 1.90 Å

C-7 de 7a y C-9 DE 16a interacción hidrofóbica con CA (cp) de Gly151 a 3.43 y 2.96
Å.

C-8 DE 7a interacción π-π con CD1 de Phe152 a 3.76 Å.

C-9 DE 7a y 8a interacción π-π con CE1 de Phe152 a 3.54 y 3.37 Å.

C-7 DE 8a interacción Hidrofóbica con CD1 de Phe152 a 3.17 Å.

C-3 DE 16a interacción Hidrofóbica con CE1 de Phe152 a 3.37 Å.


C-9 de 7a y C9` de 8a interacción π-π con CE1 (cl) de His180 a 3.68 Å.

H-1 de 16a por puente de hidrógeno con ND1 de His180 a 2.33 Å.

C-9` de 7a interacción π-π con CD1 (cl) de Phe208 a 3.53 Å.

C-9` de 7a y C-16 de 16a interacción π-π con CD1 (cl) de Phe208 a 3.53 y 3.37 Å.

C-9` y C-10` de 8a interacción π-π con CD1 y CE1 (cl) de Phe208 a 3.49 Y 3.63 Å.

C-9 de 16a interacción π-π con CZ (cl) de Phe208 a 3.58 Å

C-8 de 16a interacción π-π con CE1 (cl) de Phe208 a 3.28 Å

C-15 de 16a interacción Hidrofóbica con CB (cl) de Phe208 a 3.60 Å

O-6 (C=O) de 7a y 8a por puente de hidrógeno con H2E2 (cl) de Gln263 a 2.48 y
2.47 Å

C-9 de 7a con CE (cl) de Met274 a 3.33 Å.

H-4 (NH) de 8a por puente de hidrogeno con SD de Met274 a 2.77 Å

O-6 (C=O) de 7a, 8a y 16a por puente de hidrógeno con HN de Gly304 a 2.33,
2.27 y 2.90 Å

H-4 de 16a por puente de hidrógeno con OH (cl) de Tyr306 a 2.20 Å.

N-1 de 7a, 8a y 16a con Zn2+ a 2.57, 2.51 y 2.10 Å

O-2 (C=O) de 7a y 8a con Zn2+ a 3.11 y 3.16 Å

O-6 (C=O) de 16a con Zn2+ a 2.01 Å

10a y 12a (azufre)

H-1 de 10a por puente de hidrógeno con NE2 (cl) de His142 a 2.25 Å (O=CNH N).

C-6 de 12a interacción hidrofóbica con CδD2 (cl) de His142 a 3.51 Å (O=C CH=N).
H-1 de 10a por puente de hidrógeno con NE2 (cl) de His143 a 2.80 Å (O=CNH N).

C-5 de 12a interacción Hidrofóbica con CδD2 (cl) de His143 a 3.60 Å (C CH=N).

El átomo de hidrógeno H-4 del ligando 10a actúa como donares por puente de
hidrógeno con el átomo de oxígeno O de (cp) de Gly151 a distancias de 1.88 (NH
O=C) Å

10a interacciona a través de C-7 con CδD1 (cl) de Phe152 a 3.16 Å (C C=C).

12a interacciona a través de C-3 con CδD1 (cl) de Phe152 a 3.50 Å (C C=C).

12a interacciona a través de C-10 con CεE1 (cl) de Phe152 a 3.77 Å (C C=C)

H-8 de 10a interacciona con NE2 (cl) de His180 a 2.83 Å (SH N=C)

12a interacciona a través de C-8 con CεE1 (cl) de His180 a 3.83 Å (C C=N)

C-7 de 12a interacción hidrofóbica con CεE1 (cl) de Phe208 a 3.74 Å (C C=C).

O-6 de 10a y 12a interaccionan por puente de hidrogeno con H2E2 (cl) Gln263 a
una distancia de 2.48 y 2.64 Å (C=O HNC=O).

O-6 de 10a y 12a interaccionan por puente de hidrogeno con H2E2 (cl) Gln263 a
una distancia de 2.48 y 2.64 Å (C=O HNC=O).

O-6 de 10a interacciona por puente de hidrogeno con HN (cp) de Gly304 a una
distancia de 2.33 Å (C=O HN).

N-1 de 10a interacciona por puente de hidrogeno con N (cp) Gly304 a una
distancia de 2.99 Å (O=CHN HN).

C-3 de 10a interacción hidrofóbica con CZ (cl) de Tyr306 a 3.99 Å (C C=C).

H-4 de 12a por puente de hidrógeno con OH (cl) de Tyr306 a 2.36 Å (NH OH).

C-2 de 10a con Zn a 3.14 Å (O=C Zn2+).

10a y 12a interacciona por medio de N-1 a 2.45 y 2.27 Å (O=CHN Zn2+).

12a interacciona por medio de O-2 a 1.89 Å (O=CHN Zn2+).


10b y 12b (azufre)

C-6 de 10b interacción hidrofóbica con CδD2 (cl) de His143 a 3.69 Å (O=C CH=N).

C-3 de 10b interacción hidrofóbica con CδD2 (cl) de His142 y 143 a 3.22 y 3.29 Å (C
CH=N).

El átomo de hidrógeno H-1 del ligando 10b actúa como donador por puente de
hidrógeno con el átomo de oxígeno O de (cp) de Gly151 a distancia de 2.06 (O=CNH
O=C) Å.

El átomo de hidrógeno H-4 del ligando 12b actúa como donador por puente de
hidrógeno con el átomo de oxígeno O de (cp) de Gly151 a distancia de 2.48 (NH
O=C) Å

10b interacciona a través de C-3 con CεE1 (cl) de Phe152 a 3.32 Å (C C=C).

12b interacciona a través de C-7 con CδD1 (cl) de Phe152 a 3.22 Å (C C=C).

C-5 de 10b y C-10 de 12b interaccionan con CεE1 (cl) de His180 a 3.02 y 3.69 Å (C
C=N).

C-8 de 12b interacciona con CεE1 (cl) de Phe208 a 3.34 Å (C C=C).

O-6 de 12b interacciona por puente de hidrogeno con H2E2 y H1E2 (cl) Gln263 a
una distancia de 2.28 y 2.84 Å (C=O HNC=O).

O-6 de 12b interacciona por puente de hidrogeno con HN (cp) Gly304 a una
distancia de 2.14 Å (C=O HN).

H-4 de 10b por puente de hidrógeno con OH (cl) de Tyr306 a 2.03 Å (NH OH).

O-2 de 12b por puente de hidrógeno con HHO (cl) de Tyr306 a 2.27 Å (C=O
HO).

N-1 de 12b por puente de hidrógeno con HHO (cl) de Tyr306 a 2.43 Å (HN HO).

C-10 de 12b interacción hidrofóbica con CE1 (cl) de Tyr306 a 3.81 Å (C C=C).
10b interacciona por medio de O-6 a 3.22 Å (C=O Zn2+).

12b interacciona por medio de O-2 y N-1 a 1.90 (C=O Zn2+) y 2.41 (O=CHN
Zn2+) Å.
7b, 8b y 16b (aromáticos)
C-11 de 7b y C-10 de 8b interacción π-π con CD2 de His142 a 3.97 y 3.29 Å.

C-5 DE 16a interacción Hidrofóbica con CE1 y CD1 de His142 a 3.85 Å.

C-8 de 7b y C-9´ de 8b interacción π-π con CD2 de His143 a 3.41 Å.

C-7 de 16b interacción Hidrofóbica con CD2 de His143 a 3.79 Å.

H-4 (NH) de 16b por puente de hidrógeno con NE2 de His143 a 1.80 Å

H-12 (OH) de 8b por puente de hidrógeno con NH de His142 a 2.89 Å

OH-12 de 8b por puente de hidrógeno con HN de His142 a 2.20 Å

C-5 de 8b y C-15 de 16b interacción Hidrofóbica con CA (cp) de Gly151 a 3.01 y


3.33 Å.

C-3 de 7b y 8b interacción Hidrofóbica con CE1 de Phe152 a 3.48 y 3.63 Å.

C-16 de 16b interacción π-π con CE1 de Phe152 a 3.90 Å.

C-9´de 7b y 8b, C-8 de 16b interacción π-π con CD1 de Phe152 a 3.44, 3.98 y 3.62
Å.

C-9 de 7b interacción Hidrofóbica con CB (cl) de His180 a 3.70 Å.

C-7 de 8b interacción Hidrofóbica con CE1 (cl) de His180 a 3.21 Å.

C-5 y de 7b interacción Hidrofóbica con CD1 (cl) de Phe208 a 3.37 Å.


C-7 de 7b y C-5 de 8binteracción Hidrofóbica con CE1 (cl) de Phe208 a 3.37 y 3.35
Å.

C-15 de 16b interacción π-π con CE1 (cl) de Phe208 a 3.43 Å

C-14, C-15 y C-16 de 16b interacción π-π con CE2 CZ y CD1 (cl) de Phe208 a 3.62,
3.56 y 3.84 Å.

O6 (C=O) de 16b por puente de hidrógeno con H1E2 y H2E2 (cl) de Gln263 a 2.89 y
2.10 Å

H-1 de 7b y H-10 de NH por puente de hidrogeno con SD de Met274 a 2.58 y 2.56


Å.

O-6 (C=O) de 16a por puente de hidrogeno con HN de Gly304 a 2.13 Å.

C-8 de 16a interacción Hidrofóbica con CE1 (cl) de Tyr306 a 3.89 Å.

H-4 de 16b con Zn2+ a 2.74 Å

9a y 11a (hidroxilico)

C-6 de 9a y C-5 de 11a interacción hidrofóbica con CδD2 (cl) de His143 a 3.26 (O=C
C=C) y 3.45 (C C=C) Å.

H-1 de 9a y H-4 de 11a por puente de hidrógeno con O de (cp) de Gly151 a 1.79
(O=CNH O=C) y 2.96 (NH O=C) Å.

C-3 de 11a con CεE1 (cl) de Phe152 a 3.42 Å (C C=C).

C-2 de 9a con CδD1 (cl) de Phe152 a 3.94 Å (O=C C=C).

C-3 de 9a con CεE1 (cl) de His180 a 3.11 Å (C C=C).

H-8 de 11a por puente de hidrógeno con NE2 (cl) de His180 a 2.17 Å (OH N=C).

C-9 de 11a con CγG (cl) de Phe207 a 3.40 Å (C C=C).

C-2 de 9a interacción hidrofóbica con CεE1 y CδD1 (cl) de Phe208 a 3.60 y 3.81 Å
(O=C C=C).
C-5 de 11a interacción hidrofóbica con CεE1 (cl) de Phe208 a 3.15 Å (C C=C).

H-8 de 9a por puente de hidrógeno con NE2 (cl) de Gln263 a 2.81 Å.

H-4 de 9a por puente de hidrógeno con SD (cl) de Met274 a 2.85 Å.

H-4 de 9a por puente de hidrógeno con OH (cl) de Tyr306 a 1.88 Å.

N-4 de 9a por puente de hidrógeno con HH (cl) de Tyr306 a 2.70 Å.

H-1 de 11a por puente de hidrógeno con OH (cl) de Tyr306 a 2.10 Å.

N-4 de 11a por puente de hidrógeno con HH (cl) de Tyr306 a 2.77 Å.

N-4 de 9a con Zn2+ a 3.10 Å

O-6 de 11a con Zn2+ a 2.82 Å.

9b y 11b (hidroxilico)

H-8 de 11b por puente de hidrógeno con OD1=C (cl) de Asp101 a 2.31 Å.

H-1 de 9b por puente de hidrógeno con NE2 (cl) de His143 a 3.16 Å (O=CNH N=C)

C-5 de 11b interacción hidrofóbica con CδD2 (cl) de His143 a 3.30 Å (C C=C).

H-1 de 9b y H-4 de 11b por puente de hidrógeno con O de (cp) de Gly151 a 1.99
(O=CNH O=C) y 2.82 (NH O=C) Å.

C-2 de 9b y 11b con CδD1 (cl) de Phe152 a 3.59 y 4.0 Å (O=C C=C).

C-3 de 9b con CεE1 (cl) de Phe152 a 3.59 Å (C C=C).

C-7 de 9b, C-5 y C-6 de 11b con CεE1 (cl) de His180 a 3.17 (C C=C), 3.92 (C
C=C) y 3.81 (O=C C=C) Å.

C-2 de 9b y C-3 de 11b interacción hidrofóbica con CεE1 (cl) de Phe208 a 3.80 (O=C
C=C) y 3.88 Å (C C=C).

C-7 de 9b y C-3 de 11b interacción hidrofóbica con CδD1 (cl) de Phe208 a 3.77 y
3.64 Å (C C=C).

C-3 de 11b interacción hidrofóbica con CδD2 (cl) de Phe208 a 3.78 Å (C C=C).
H-4 de 9b y H-1 de 11b por puente de hidrógeno con OH (cl) de Tyr306 a 1.95
(HN OH) y 2.16 (O=CHN OH) Å.

O-6 de 11b por puente de hidrógeno con HH (cl) de Tyr306 a 2.31 Å.

C-5 de 11b interacción hidrofóbica con Cz (cl) de Tyr306 a 3.73 Å (C C=C).

O-6 de 9b y 11b con Zn2+ a 3.47 y 2.34 Å.

13a, 17a y 18a (básicos)


H-11A y H-11B de 13a interaccionan por puente de hidrógeno con OD1=C (cl) de
Asp101 a 1.97 y 2.13 Å (NH O=C) respectivamente.

H-13 y N-13 de 18a interaccionan por puente de hidrógeno con HN y N (cl) de His142
a 2.35 (C=NH HN) y 2.82 Å (C=NH NH) respectivamente.

C-11 de 18a interacción hidrofóbica con CδD2 (cl) de His142 a 3.20 (C C=C) Å.

C-9 de 18a interacción hidrofóbica con CδD2 (cl) de His143 a 3.71 Å (C C=C).

C-10 de 17a interacción π-π con CδD2 (cl) de His142 a 3.51 Å (C=C C=C).

C-10 de 17a interacción π-π con CδD2 (cl) de His143 a 3.36 Å (C=C C=C).

C-9 de 18a interacción hidrofóbica con CδD2 (cl) de His143 a 3.71 Å (C C=C)

C-5 de 13a interacción hidrofóbica con CδD2 (cl) de His143 a 3.28 Å (C C=C)

H-4(NH) de 13a, H-9 de 17a y H-10 (NH) de 18a por puente de hidrógeno con O
(C=O) (cp) de Gly151 a 2.99, 2.05 y 2.40 Å

C-10 de 13a con CA (cp) de Gly151 a 3.61 Å

C-3 de 13a, 17a y C-8 de 18a con CD1 (cl) de Phe152 a 3.12, 3.45 y 3.61 Å

El átomo H-1 del grupo O=CNHC=O de 13a presenta interacción por puente de
hidrogeno con ND1 (cl) de His180 a 2.32 Å (O=CNH N=C).

C-5 de 17a y C-7 de 18a interacción hidrofóbica con CδE1 (cl) de His180 a 3.23 y
3.43 Å (C C=C)

C-7 de 17a interacción hidrofóbica con CG (cl) de His180 a 3.80 Å (C C=C)


C-7 de 13a, C-2 (C=O) de 17a y C-5 de 18a interacción hidrofóbica con CE1 (cl) de
Phe208 a 3.39, 3.63 y 3.64 Å (C C=C).

C-8 de 13a, C-6 (C=O) de 17a y C-3 de 18a interacción hidrofóbica con CD1 (cl) de
Phe208 a 3.12, 3.90 y 3.35 Å (C C=C).

C-6 (C=O) de 18a interacción hidrofóbica con CG (cl) de Phe208 a 4.0 Å (C C=C).

O-6 (C=O) de 13a y N-11 de 17a por puente de hidrógeno con HN de Gly304 a
2.94 Å (C=O HN) y 2.98 Å (C=N HN).

C-5 y C-7 de 17a interacción hidrofóbica con CE1 (cl) de Met274 a 3.62 Å (C C=C).

H-12 y N-12 de 18a por puente de hidrógeno con NE2 y H2E2 (cl) de Gln263 a 2.42
(NH NH) y 2.67 Å (HN NH).

H-4 y N-1 de 13a por puente de hidrógeno con OH y HHO (cl) de Tyr306 a 2.25 (HN
OH) y 2.40 (O=CHN OH) Å.

O-6 y N-1 de 13a con Zn2+ a 1.96 (C=O Zn2+) y 2.08 Å (O=CHN Zn2+)
respectivamente.

13b, 17b y 18b (básicos)


H-11A y H-11B de 13b interaccionan por puente de hidrógeno con OD1=C (cl) de
Asp101 a 2.16 y 1.92 Å (NH O=C) respectivamente.

C-10 de 18b interacción hidrofóbica con CB (cl) de Asp101 a 3.2 (C C) Å.

C-5 de 13b y 18b interacción hidrofóbica con CδD2 (cl) de His142 a 3.21 Å (C
C=C).

C-10 de 17b interacción π-π con CδD2 (cl) de His142 a 3.36 Å (N=C C=C).

C-8 de 13b y C-3 de 18b interacción hidrofóbica con CδD2 (cl) de His143 a 3.90 y
3.31 Å (C C=C).

C-12 de 17b interacción π-π con CδD2 (cl) de His143 a 3.26 Å (C=C C=C).

El átomo de hidrógeno H-4 de los ligandos 13b y 18b actúa como donador por
puente de hidrógeno con el átomo de oxígeno O de (cp) de Gly151 a distancia de
2.49 y 2.47 Å (NH O=C).

C-8 de 13b y C-5 de 17b interaccionan con CA (cp) de Gly151 a 3.20 y 2.99 Å
respectivamente (C C).
C-7 de 13b y de 18b, C-3 de 17b interaccionan con CδD1 (cl) de Phe152 a 3.18, 3.34
y 3.68 Å (C C=C).

H-10 y H-12Ade 18b interaccionan con NE2 (cl) de His180 a 2.11 y 2.10 Å (NH
N=C).

17b interacciona a través de C-7 con CεE1 (cl) de His180 a 3.40 Å (C C=N).

C-9 de 13b, C-5 de 17b y C-8 de 18b con CεE1 (cl) de Phe208 a 3.73, 3.22 y 3.33
Å (C C=C).

O-6 de 18b y 13b con H2E2 (cl) Gln263 a 2.27 Å (C=O HNC=O).

O-6 de 13b con H1E2 (cl) Gln263 a 2.82 Å (C=O HNC=O).

18b interacciona a través de H-12 con SD (cl) de Met274 a 3.11 Å (NH S).

O-6 de 13b interacciona con el átomo de hidrógeno del grupo HN de Gly304 a 2.19
Å respectivamente (C=O HN).

N-1 y H-1 de 13b y de 18b interaccionan con el átomo de hidrógeno del grupo HN
y con el átomo de nitrógeno de NH (cp) de Gly304 a 2.57 y 2.39 Å para 13 b; y de
2.54 y 2.35 Å para 18b (O=CHN HN) (O=CNH NH).

N-9 y H-9 de 17b interaccionan con el átomo de hidrógeno del grupo HN y con el
átomo de nitrógeno de NH (cp) de Gly304 a 2.53 (O=CHN HN) y 2.71 Å (O=CNH
NH).

El átomo de nitrógeno N-1 de 13b y de 18b interaccionan con HH de Tyr306 a 2.45


Å (O=CHN HO).

El átomo de nitrógeno N-9 de 17b interaccionan con HH de Tyr306 a 2.86 Å (HN


HO).

C-2 de 17b con CE1 (cl) de Tyr306 a 3.80 Å (C=O C=C).

O-2 de 13b y 18b interaccionan con HHO (cl) de Tyr306 a 2.71 y 2.25 Å (C=O
HO).
Por último; se describen las interacciones polares, las cuales son por medio de O-2
de 13b y de 18b con Zn2+ a 1.91 y 1.90 Å (C=O Zn2+), de N-1 de 13b y 18b con
Zn2+ a 2.42 Å (O=CHN Zn2+) y H-9 de 17b a 2.65 Å (NH Zn2+).

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