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GENICA
L’orientamento dei
frammenti omologhi
opposto uguale
a b c a b c
a a a b c
b b
c c a b c
c b a a b c
a b c
a b c
RICOMBINAZIONE Avviene in corrispondenza
SITO SPECIFICA di brevi regioni omologhe
Caratterizzate da Integrazione di
sequenze particolari genomi virali
Trasposizione
Integrazione di
cassette geniche
In una popolazione batterica le mutazioni casuali
!
avvengono con frequenza bassa ma costante
(10-7 10-11 / n bp)
In contrapposizione al
TRASFERIMENTO VERTICALE
donatore
A
RES
T
Scambio di geni
metabolici
E
disseminazione
di geni di virulenza VIR
degradazione
Le possibili strategie con cui materiale genetico passa da
un batterio all’altro sono tre:
1-TRASFORMAZIONE
2-CONIUGAZIONE
3-TRASDUZIONE
IL TRASFERIMENTO E’ MEDIATO
IL MATERIALE GENICO PASSA PER CONTATTO
DA BATTERIOFAGI
DIRETTO TRA UN BATTERIO E L’ ALTRO
CARATTERISTICHE COMUNI
ALLE TRE STRATEGIE
Il trasferimento è POLARE
(DonatoreRicevente)
Questa regola cade se
l’esogenote è un plasmide
Il prodotto del
trasferimento è un
MEROZIGOTE
TRASFORMAZIONE
Fenomeno scoperto da Griffith 1928 su
Pneumococcus
DNA estratto e + R
purificato da “S”
Diverse specie
ambientali Haemophilus
Neisseria
Il DNA esterno viene internalizzato nella cellula ospite, integrato
nella regione omologa del cromosoma e trasmesso alla progenie
Didermi
Haemophilus Monodermi
Neisseria Streptococcus
Bacillus
Diverse specie ambientali
la competenza è regolata e si manifesta in condizioni
ambientali particolari o in una fase di crescita specifica
si replica e
Si integra nel cromosoma
si esprime
(ricombinazione omologa) e si esprime
COMPETENZA ARTIFICIALE
CaCl2 elettrici
(elettroporazione)
chimici
(Cloruro di calcio o rubidio)
I PLASMIDI
O O
ma può conferire un
vantaggio selettivo in
O O
particolari condizioni
ambientali
Plasmidi di virulenza: aumentano Plasmidi Col: codificano batteriocine
l’efficienza dei patogeni (antagonizzanti contro cellule della
stessa specie o di specie affini)
Plasmidi R: codificano
enzimi capaci di distruggere Plasmidi metabolici: codificano
o modificare gli antibiotici enzimi capaci di degradare
composti aromatici, pesticidi,
zuccheri…
INCOMPATIBILITÀ I plasmidi regolano la
propria replicazione
hok
sok
ccdA ccdB
72 AA 101 AA
S D I IS3
G Elementi
H gd
Regione Tra
F
Trasponibili
IS3
C
B IS2
F
K
E 94 Kb
L Regione
A silente
J
Stabilizzazione della
oriT inc, rep coppia coniugativa
Regione della Regione tra
replicazione
sintesi e assemblaggio
Regolazione del del pilo coniugativo (pilo
trasferimento F)
F-
ponte coniugativo
Viene trasferito un
filamento singolo di F
F+
F+ FF--
F+
F+
HFR
F+
non è definitiva; in una popolazione
esistono cellule Hfr e cellule F+
Il trasferimento comincia da OriT e si svolge come
per F, ma prosegue con i geni del cromosoma
HFR
F-
OriT
F-
F
HFR F-
OriT
F
In genere questo NON accade e nel
ricevente passano solo geni cromosomici
HFR
F--
Il ricevente rimane F-
Nel passaggio HfrF+, il processo di escissione
di F è normalmente preciso
lac F ’
F-
Il donatore resta F’
Il ricevente diventa F’
H M M M
GENERALIZZATA SPECIALIZZATA
Escissione corretta
Il fago si escinde senza modificare nè il proprio
genoma nè quello del batterio
Il sito di riconoscimento
è ibrido
“gal ” si integra stabilmente nel genoma virale
gal-
gal+
L’efficienza di trasduzione aumenta in presenza di
un fago temperato (fago helper)
helper
TRASDUZIONE ABORTIVA
a+
x a-
x
Solo il 10-30% del DNA trasdotto si integra,
ma la parte non integrata può formare dei
diploidi parziali e esprimersi per qualche
generazione
TRASPOSIZIONE
E’ LO SCAMBIO DI MATERIALE GENETICO TRA REPLICONI DIVERSI
Cromosoma Plasmide
Cromosoma
Gli elementi trasponibili sono sequenze che hanno la capacità di spostarsi e di
integrarsi con una ricombinazione sito specifica, in corrispondenza di siti bersaglio
768 bp
IS
promotore
IS
IR IR IR IR
REPLICATIVO CONSERVATIVO
(Es Tn3) (es. Tn10)
Conservativo: trasposizione semplice (taglia e cuci)
GT ACGT TA
AT GTCA TG
trasposone B
A la trasposasi D
A 5’
taglia i filamenti C 3’ 3’
5’ B
in modo sfalsato
C
bersaglio D
Forche replicative
2
Donatore
restaurato I filamenti si legano formando
un COINTEGRATO
A D
Ricevente con
RISOLUZIONE C B
trasposone e siti
bersaglio duplicati ricombinazione
INTEGRONI:
Pant
5’-CS 3’-CS
Pant X
Pant
È POSSIBILE IL
PASSAGGIO DI
PRODOTTI