TEMARIO DE ESTUDIO PARA EL EXAMEN DE CONOCIMIENTOS

COMO PARTE DEL PROCESO DE ADMISIÓN AL PROGRAMA DE

POSGRADO EN BIOTECNOLOGÍA DE PLANTAS DEL CINVESTAV UNIDAD
IRAPUATO 2009

En el proceso de admisión al posgrado en Biotecnología de Plantas de la

Unidad Irapuato del Cinvestav, se incluye como parte primordial un examen de
conocimientos básicos en las áreas de Biología, Bioquímica, Química y Estadística.
A manera de guía para la preparación de los candidatos en las diferentes áreas
que incluirá dicho examen, a continuación se presentan los temarios generales a
partir de los cuales se elaborarán los reactivos de éste. El examen está
programado para aplicarse el 20 de julio del presente año en las instalaciones de la
Unidad Irapuato, así como en el resto de las Unidades foráneas y en del Distrito
Federal, para lo cual es requisito previo el registro de los candidatos en el sitio de
Internet de la Unidad (www.ira.cinvestav.mx). Los candidatos deberán indicar en
el formato de registro toda la información que se solicita, así como enviar la
documentación que se les requiere. Los candidatos que planeen tomar el examen
en otra Unidad que no sea la de Irapuato, lo deben indicar claramente en el
formato.

TEMARIO DE BIOLOGÍA

1. Bases moleculares de la vida

a. Ácidos nucleicos
b. Transcripción
c. Traducción
d. Replicación
e. DNA recombinante
2. Estructura y función celular
a. Teoría celular
b. Endosimbiosis. Procariotes y eucariotes
c. Estructura general
i. Formas y tamaños celulares
ii. Membrana celular
iii. Núcleo
iv. Pared celular
 d. Componentes celulares: estructura y funciones
i. Núcleo
ii. Vacuolas y vesículas
iii. Retículo endoplasmático
iv. Aparato de Golgi y dictiosoma
v. Lisosomas
vi. Mitocondria
vii. Plástidos
e. Citoesqueleto celular y movilidad celular
f. Ciclo celular
i. División celular: Mitosis
ii. División celular meiosis
iii. Citocinesis
3. Sistemática y biodiversidad
a. Historia de la clasificación
b. Clasificación y la Teoría de la Evolución
c. Sistema binomial de clasificación
i. Jerarquías taxonómicas
ii. Concepto de especie
iii. Jerarquías subespecíficas
iv. Reglas de nomenclatura
v. Nombres científicos vs. nombres comunes
d. Sistema natural de clasificación
i. Filogenia y Taxonomía
ii. Métodos moleculares de clasificación
iii. Actualización del sistema de clasificación
e. Clasificación de Eubacteria
f. Clasificación de Archaea
g. Clasificación de Eukarya
4. Biología Vegetal
a. El estudio de las plantas
b. Distribución geográfica de las plantas
c. Plantas vs. animales
d. Estructura típica de las plantas
e. Órganos de las plantas
i. Hojas: Origen, estructura y función
ii. Tallo: Origen, estructura y función
iii. Raíz: Origen, estructura y función
f. Reproducción en las plantas
i. Reproducción vegetativa
 ii. Reproducción sexual
1. Ventajas de la reproducción sexual
2. Alternancia de generaciones
3. Flor: Origen, estructura y función
4. Polinización
5. Fecundación
6. Desarrollo de la semilla
7. Desarrollo del fruto
8. Diversidad de frutos y semillas
9. Germinación
g. Plantas transgénicas
5. Zoología
a. El campo de la Zoología
b. Animales vs. plantas
6. La Herencia
a. Conceptos premendelianos de la herencia
b. Mendel y su contribución
i. Principio de la segregación en cruzas monohíbridas
ii. Correlación con la meiosis
iii. Definiciones de términos genéticos: alelo, gene, locus,
dominancia etc.
iv. Uso cuadro de Punnet
v. Cruza dihíbrida: principio de segregación independiente
vi. Leyes de Mendel
c. Teoría cromosómica de la herencia
i. Cariotipos
ii. Anomalías cromosómicas
iii. Herencia ligada al sexo
iv. Cuerpos Barr
d. Extensiones del análisis Mendeliano
i. Codominancia
ii. Dominancia incompleta
iii. Alelos múltiples
iv. Interacciones génicas
v. Efectos ambientales
vi. Poligenes
vii. Pleiotropía
viii. Herencia no-mendeliana
e. Ligamiento genético
i. Recombinación durante la meiosis
 ii. Desarrollo de mapas genéticos
7. Ecología
a. Ciclos biogeoquímicos
b. Niveles comunitarios (biósfera, regiones biogeográficas, biomas,
ecosistemas, comunidades).
c. Componentes de un ecosistema (factores bióticos y abióticos,
equilibrio dinámico, depredación y herbivoría, cadenas y redes
tróficas)
d. Hábitat y nicho ecológicos
e. Población
8. Origen de la vida y evolución de los organismos
a. El origen
i. Big Bang y edad de la tierra
ii. Origen de la vida
iii. El mundo RNA
b. Historia de los conceptos evolutivos
c. Selección natural
i. Teoría de Darwin y Wallace
ii. Teoría Sintética
iii. Teoría del Equilibrio Punteado
d. Bases genéticas y moleculares de la evolución
i. Ecuación Hardy-Weinberg
ii. Mutaciones y otras fuentes de variabilidad
iii. Especiación y filogenética molecular
iv. Teoría Neutral de la Evolución
v. Genomas y evolución

TEMARIO DE QUÍMICA ORGÁNICA

1. Bases moleculares de la vida

a. Conceptos básicos: elementos, átomos, neutrones, protones,
electrones (quántica).
b. Tabla periódica. Carbono, Oxigeno y Nitrógeno.
c. Niveles energéticos y configuración electrónica. Principio de
electronegatividad.
d. Orbitales atómicos y orbitales moleculares. Orbitales híbridos: sp,
sp2, sp3
e. Tipos de enlace: iónico, covalente. Puentes de hidrógeno
f. Polaridad de enlaces. Efectos inductivos y polaridad de moléculas
 g. Agua y todas sus propiedades químicas y físicas. Relevancia del agua
para las células vivas.
h. Fuerzas intermoleculares, punto de ebullición, solidificación,
solubilidad.
i. Equilibrio químico. Le Chatelier. Principios termodinámicos.
j. Ácidos y bases. pH y pKa.
k. Reacciones Redox. Estados de oxidación.
l. Avogadro. Peso molecular. Cálculos de molaridades, diluciones, etc.
normalidades, pH, etc
2. Estereoquímica
a. Isomería y estructura molecular.
b. El carbono asimétrico. Quiralidad.
c. Isomería óptica. Enantiometría y Diastereómeros
d. Ejemplos biológicos de isómeros.
3. Grupos funcionales del carbono
a. Nomenclatura IUPAC.
b. Alcanos y Alquenos y compuestos aromáticos. Mesomería.
c. Ejemplos biológicos: ácidos grasos, ceras, etileno, fenol, tirosina, etc.
d. Grupo hidroxilo; Alcoholes. propiedades y reacciones. Deshidratación.
oxidación-reducción. Ejemplos biológicos de hidroxilos.
e. Grupo carbonilo; cetonas y aldehídos; Tautomería ceto-enol;
Reactividad nucleofílica del carbono funcional y reactividad ácida-
electrofílica del carbono alfa. Mecanismo de ataque nucleofilico.
Reacción aldol. Hemicetal y cetal. Ejemplos biológicos de carbonilos.
f. Grupo carboxilo; ácidos orgánicos. pKa. Tipos de reacciones de los
ácidos carboxílicos. Esteres, anhídridos, lactonas, etc. Saponificación,
transesterificación.
g. Grupos amino primarios, secundarios y terciarios. Amidas, Imidas.
Enlace peptídico. (tautomería del enlace peptídico)
h. Moléculas con grupos funcionales múltiples: Azúcares, Aminoácidos.
i. Reacciones químicas de la glicólisis: grupos funcionales
j. Reacciones químicas de la fotosíntesis: grupos funcionales
k. Compuestos heterocíclicos. Bases nitrogenadas, ADN.
l. Reacciones químicas de los ácidos nucleicos. (enlaces de Fósforo).
ATP
4. Espectroscopía y estructura
a. Métodos espectroscópicos: espectro de masas, espectro
electromagnético, UV, VIS y NIR. Rayos X.
b. Espectro de resonancia magnética nuclear.
c. Radioactividad
TEMARIO DE BIOQUÍMICA

1. Bioquímica estructural
a. Lípidos
i. Definición.
1. Interacciones hidrofóbicas
2. Ácidos grasos y triglicéridos
3. Fosfolípidos y glicolípidos
ii. Composición y estructura de los lípidos de reserva y de los
lípidos formadores de membranas.
iii. Esteroles
iv. Terpenos.
b. Carbohidratos
i. Estructura química de los monosacáridos
ii. El enlace glicosídico
iii. Disacáridos: maltosa, sacarosa, etc.
iv. Polisacáridos: almidón, celulosa, fructanos.
c. Aminoácidos y proteínas
i. Los aminoácidos
ii. Propiedades químicas de los diferentes tipos de aminoácidos
iii. El enlace peptídico
iv. Estructura primaria de las proteínas.
v. Estructuras secundarias de las proteínas. Motivos
vi. Estructura terciaria. Dominios
vii. Estructura cuaternaria. Complejos multiproteicos.
viii. Métodos para su estudio
1. Purificación
2. Determinación de su secuencia de aminoácidos
3. Identificación de proteínas separadas por electroforesis
(inmunodetección, espectrometría de masas)
4. Determinación de su estructura tridimensional.
Cristalografía de rayos X y Espectrometría de
resonancia magnética nuclear en disolución.
d. Bases nitrogenadas, nucleótidos y ácidos nucleicos
i. Purinas y pirimidinas
ii. Nucleótidos
iii. Estructura del DNA
iv. Diferentes tipos de RNAs y su estructura
v. Métodos para su estudio
 1. Separación de los diferentes tipos de ácidos nucleicos
2. Purificación
3. Secuenciación
4. Identificación de secuencias por hibridación
2. Metabolismo
a. Fundamentos de la acción enzimática
i. Conceptos fundamentales de enzimología
ii. Principios de cinética enzimática
iii. Inhibición enzimática
iv. Mecanismos de la acción enzimática (ejemplos)
1. Proteasas
2. Anhidrasas carbónicas
3. Endonucleasas de restricción
b. Introducción al metabolismo
i. Panorama del metabolismo
ii. Características de las vías metabólicas
iii. Transformaciones de energía en el metabolismo: principios
termodinámicos
c. Vías metabólicas principales
i. Degradación de azúcares y lípidos
ii. El ciclo del ácido cítrico
d. Fosforilación oxidativa
i. Transporte respiratorio de electrones y protones
ii. Síntesis de ATP
e. Fotosíntesis
i. Absorción de luz
ii. Transporte fotosintético de electrones y protones
iii. Síntesis de ATP (fotofosforilación)
iv. El ciclo de Calvin
v. Fotosíntesis C3, C4 y CAM
f. Introducción al metabolismo biosintético
i. Metabolismo del nitrógeno
ii. Panorama de las síntesis de aminoácidos
iii. Síntesis de ácidos grasos y terpenos
g. Integración metabólica
i. Vías y redes metabólicas: su diversidad
TEMARIO DE ESTADÍSTICA

1. Probabilidad elemental
2. Probabilidad Condicional
3. Teorema de Bayes
4. Distribución Binomial
5. Valor esperado y varianza
6. Error estándar de la media
7. Prueba de t para dos medias
 LITERATURA RECOMENDADA

BIOLOGÍA
Kimball's Biology Pages
http://users.rcn.com/jkimball.ma.ultranet/BiologyPages/

BIOQUIMICA
Berg, J.M. Tymoczko, J.L. & Stryer, L. (2002). Biochemistry 5 Ed. W.H. Freeman
and Company, New York, N.Y

QUÍMICA ORGÁNICA
Robert T. Morrison, Robert N. Boyd, and Robert K. Boyd, (1992) Organic
Chemistry, 6th edition (Benjamin Cummings)

PROBABILIDAD Y ESTADÍSTICA
Mood, A. M., F. A. Graybill and D. C. Boes (1974). Introduction to the Theory of
Statistics, McGraw-Hill International Editions.
Snedecor, G. W. and W. G. Cochran (1967). Metodos Estadisticos. Mexico, Ed.
CECSA.
Sokal, R. R. and F. J. Rohlf (1969). BIOMETRY: The principles and practice of
statistics in biological research. San Francisco, W. H. Freeman and Co.
Spiegel, M. R. (1976). Probabilidad y Estadistica. Mexico, Ed. McGraw-Hill.
Spiegel, R. M. (1970). Estadistica. Mexico, McGraw-Hill.
Steel, R. G. D. and J. H. Torrie (1985). Bioestadistica: Principios y Procedimientos.
Mexico, Mc-Graw-Hill.

OTRAS REFERENCIAS
Buchanan, Gruisem & Jones. (2000) Biochemistry and molecular biology of plants.
Amer. Soc. Plant Physiol. USA.
Donald Voet, J.G. Voet (1995) Biochemistry 2d edición. Wiley & Sons
Lehninger A, Nelson D, Cox M (1994) Biochemistry Ed 4nd. Worth Publishers, Inc.,
New York
Nabors Murray W. Pearson (2006) Introduccion a la Botanica. Edición Educación.
LIBROS Y SITIOS DISPONIBLES EN INTERNET:

Interactive Concepts in Biochemistry Rodney Boyer (Wiley)

http://www.wiley.com/legacy/college/boyer/0470003790/index.htm
Biochemistry Berg, Jeremy M.; Tymoczko, John L.; and Stryer, Lubert. New York: W. H.
Freeman and Co. ; c2002
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=stryer.TOC&depth=2
Molecular Cell Biology Lodish, Harvey; Berk, Arnold; Zipursky, S. Lawrence; Matsudaira,
Paul; Baltimore, David; Darnell, James E. New York: W. H. Freeman & Co. c1999
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mcb.TOC
Links a libros online del NCBI
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?CMD=search&DB=books
Departamento de bioquímica, Medicina, UNAM
http://laguna.fmedic.unam.mx/
Aprende bioquímica, facultad de medicina UNAM
http://laguna.fmedic.unam.mx/~leonor/
Material de apoyo a la docencia en bioquimica. Sociedad Mexicana de Bioquímica, A. C.
http://www.smb.org.mx/text/smb_html_docencia.htm
General, Organic and Biochemistry University of Akron
http://ull.chemistry.uakron.edu/genobc/
Concepts in biochemistry
http://ull.chemistry.uakron.edu/biochem/
Biochemistry concepts
http://hyperphysics.phy-astr.gsu.edu/hbase/organic/biochemcon.html
Chemtutor · Computational Chemistry via the Internet Project · Concepts in Biochemistry
http://www.ziplink.net/users/pik/Chemistry,%20Biochemistry.html
Kimball's Biology Pages
http://users.rcn.com/jkimball.ma.ultranet/BiologyPages/
Electronic Textbook StatSoft
http://www.statsoft.com/textbook/stathome.html
Statistics Solutions, Inc.
http://davidmlane.com/hyperstat/
Google Biostatistical Books OnLine
http://books.google.com.mx/books?q=biostatistical+books+online&ots=DfNMADEgtm&s
a=X&oi=print&ct=title
Biostatistical Genetics and Genetic Epidemiology Autor Robert C. Elston, Jane M. Olson,
Lyle Palmer
http://books.google.com.mx/books?id=HWJzg-
LrnsoC&pg=PR6&ots=4EofcZW0j2&dq=biostatistical+books+online&sig=iKhQrakbiYcF
WX
M-JJd7pzhyWZA#PPP1,M1
Time Series: A Biostatistical Introduction Autor Peter Diggle
http://books.google.com.mx/books?id=Zlz78dwBwl0C&pg=PA11&ots=-
clcc8BDoM&dq=biostatistical+books+online&sig=5_HdKGWAibnz63MXi78kUa7SmlI
The Promise of Biotechnology
http://books.google.com.mx/books?id=x7xPyx4nMy8C&pg=PA44&dq=biology+online&a
s_brr=1&sig=OkqcH-jDyYCbbGhTmyBa_1szVzg#PPP1,M1
Molecular Biology and Physiology Resources
http://tigger.uic.edu/~dbhale/molbio.html
Pedro's BioMolecular Research Tools
http://www.biophys.uni-duesseldorf.de/BioNet/Pedro/research_tools.html

Química
http://www.cem.msu.edu/~reusch/VirtualText/intro1.htm#contnt

Moodle Cinvestav Irapuato:

http://www.ira.cinvestav.mx:86/

Introductory Biology MIT Open Course

http://ocw.mit.edu/OcwWeb/Biology/7-013Spring-2006/CourseHome/index.htm
(también disponible con los profesores)