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BIOQUÍMICA
PAPIME PE 202210
I. Introducción.
Una célula viva es una estructura dinámica que crece, se mueve, sintetiza
macromoléculas complejas y traslada selectivamente sustancias dentro y fuera de
la célula o entre compartimientos. Toda ésta actividad requiere energía, por lo que
cada célula y cada organismo deben obtenerla de sus alrededores y gastarla de la
manera más eficaz posible. (Mathews, 2002)
Por ejemplo: las plantas obtienen la energía de la luz solar; los animales utilizan la
energía almacenada en las pantas o en otros animales de los que se alimentan
(cadena trófica). El procesamiento de esta energía mediante el mayor
aprovechamiento para poder realizar las funciones que una célula u organismo
debe llevar a cabo es una gran parte del tema en el que se centra la Bioquímica,
debido al papel que desempeña la energía en la vida, resulta de suma importancia
el estudio de la Bioenergética, que es el análisis cuantitativo de la forma en que
los organismos adquieren y utilizan la energía, siendo la bioenergética
considerada una parte especial de la ciencia general de las transformaciones
energéticas o Termodinámicas. (Mathews, 2002)
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A) Energía.
La energía se define como la capacidad para realizar un trabajo. Los diversos tipos
de energía pueden ser cambiables, (a excepción de la energía calórica)
convirtiéndose completamente a calor. En los organismos vivos que permanecen a
temperatura constante; es necesario considerar dos clases de energía, las cuales
son: (Rico, 2011)
Recuerda que las calorías son unidades de medida de la energía. (Rico, 2011)
B) Trabajo.
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Leyes de la termodinámica.
1ra. Ley:
La energía total de un sistema, incluido su entorno, permanece constante,
constituyendo también la Ley de la conservación de la energía.
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Animal obeso
Tomado de dpa.fvet.edu
2da. Ley:
La entropía total de un sistema debe aumentar cuando un proceso ocurre
espontáneamente, por entropía se entiende el grado del desorden o aleatoriedad
del sistema; dicha entropía alcanza su máximo nivel en un sistema que se
aproxima al equilibrio verdadero.
Bajo condiciones de temperatura y presión constantes, la relación del cambio en la
energía libre (ΔG) de un sistema que reacciona y la entropía (ΔS), se expresa de
la siguiente manera:
ΔG = ΔH - T ΔS
Considerando que ΔH es entalpia (calor)
Cuando ΔG es negativa, la reacción procede de manera espontánea con pérdida
de energía libre, a lo cual se le conoce como reacción exergónica.
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Se mueve el recipiente y se
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3ra. Ley:
Reacciones de síntesis
Contracción muscular
Transporte activo
Estos procesos vitales, obtienen energía mediante un acoplamiento con otras
reacciones, por ejemplo:
Para que un metabolito “A” cambie a metabolito “B” se produce una liberación de
energía libre; ésta se acopla a otra reacción en la cual la energía libre se necesita
para convertir el metabolito “C” en el metabolito “D”, lo cual nos ejemplifica los
términos químicos normales “exotérmico” y “endotérmico” o exergónico y
endergónico ya sea a la pérdida o ganancia respectivamente de energía libre.
(Muray, 2001)
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La unidad trifosfato del ATP, presenta 4 cargas negativas, estas cargas se repelen
mutuamente al estar muy próximas. Al hidrolizarse el ATP, la repulsión entre ellas
se reduce, el agua se puede unir más eficazmente al ADP y Pi que a la porción
fosfoanhidro del ATP, con lo cual el ADP y el Pi se estabilizan. (Rico, 2011)
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En una célula típica, cada molécula de ATP se consume dentro del minuto de
haber sido formada.
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Por ello, los grandes procesos metabólicos, se dividen en pequeñas etapas que
requieren o liberan cantidades "discretas" de energía, energía que por su magnitud
puede ser utilizada por otras reacciones. Por esta razón en el metabolismo, la
oxidación de la glucosa se divide en varios procesos: Glucólisis, Oxidación del
piruvato, Ciclo tricarboxílico, Cadena respiratoria y Fosforilación oxidativa. (Rico,
2011)
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F) Enlace Macroérgico
Para conservar los procesos vitales, todos los organismos deben obtener
suministros de energía libre a partir de su ambiente, es por eso que se clasifican
de la siguiente manera: (Rico, 2011)
- Los organismos autótrofos: acoplan su metabolismo a procesos
exergónicos sencillos del entorno, estos organismos se alimentan así
mismos, por ejemplo: las plantas verdes se sirven de la energía de la luz
solar. (Rico, 2011)
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V. Cadenas Tróficas
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Luz solar
(Energía)
Liberan
Calor
-Luz
Productores Nutrientes
(Plantas) Inorgánicos -Agua
-Minerales
Liberan
Calor
ECOSISTEMA
Consumidores 1os (herbívoros)
Lo regresan al
Liberan sustrato
Calor
Consumidores 2os (Carnívoros)
Liberan
Calor
Consumidores 3os (carroñeros) Desintegradores
(microorganismos)
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combina con el oxígeno para formar dióxido de carbono (CO 2). Este proceso libera
energía, la que es usada por el organismo, en forma de calor. (Rico, 2011)
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Ésta segunda etapa termina con la mayor parte de los alimentos convertidos en
Acetil coenzima A y un par de alfa cetoácidos. (Rico, 2011)
En esta etapa se libera una cantidad pequeña pero importante de energía libre
recuperable y sustratos para que sean ingresados a vías que formen ATP. (Rico,
2011)
ETAPA III: "Consta del ciclo del ácido cítrico y la fosforilación oxidativa", vías
comunes en la degradación de las moléculas oxidables. Aquí se advierte una mayor
economía de los mecanismos metabólicos. Todos los productos del período III son
canalizados a un mecanismo llamado Acido Tricarboxílico o de Krebs, el cual es una
sucesión de reacciones que liberan en forma de CO2 los átomos de carbono de los
metabolitos que ingresan al tiempo que ceden pares de los átomos de hidrógeno a la
cadena oxidativa para formar agua y la formación de ATP (energía). (Rico, 2011)
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El ATP es la conexión entre los sistemas que producen energía y los que la utilizan,
mediante la oxidación de combustibles metabólicos, como glúcidos, lípidos o
proteínas, se puede obtener energía. La proporción de cada uno de estos
combustibles metabólicos que se puede utilizar como fuente de energía depende del
tejido y del estado nutricional y hormonal del organismo; por ejemplo, el eritrocito
maduro y el cerebro adulto en estado alimentado utilizan solamente glúcido como
combustible metabólico, mientras que el hígado de un mamífero diabético o en
ayunas metaboliza principalmente lípidos. La energía se puede consumir durante la
realización de diversas funciones ligadas a energía (trabajo), como se muestran en
el siguiente esquema. Donde podemos ver que el hígado y el páncreas están
implicados fundamentalmente en funciones biosintéticas y de trabajo secretor,
mientras que el músculo cardiaco y el esquelético están implicados en la conversión
de energía metabólica en energía mecánica durante el proceso de la contracción
muscular, para el movimiento. (Devlín, 1999)
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ATP
Termogénesis
ADP + Pi
El esquema anterior una vez más nos muestra que el vínculo esencial entre las
vías de producción y de utilización de energía se mantiene mediante el nucleósido
trifosfato adenosina 5´-trifosfato (ATP). El ATP es un nucleótido de purina
(Adenina) en el cual el anillo de Adenina está unido por enlace glucosídico a la D-
ribosa. En la posición 5 de la porción de ribosa están esterificados tres grupos
fosforilo en forma de lo que se denomina enlaces fosfoanhídrido. Los dos grupos
de fosfato terminales, que están implicados en la unión anhídrido del ácido
fosfórico, se denominan enlaces ricos en energía o de alta energía (enlace
macroérgico). La síntesis del ATP como resultado de procesos catabólicos o el
consumo de ATP en algún tipo de función celular ligada a energía implica
alternativamente la formación e hidrólisis, o transferencia, el grupo fosfato terminal
del ATP. La forma fisiológica del nucleótido está quelada con un catión metálico
divalente tal como el magnesio. El ADP también puede quelar magnesio, pero la
afinidad del catión metálico por el ADP es considerablemente menor que por el
ATP. Aunque los compuestos más utilizados en los procesos de conservación o de
producción de energía son los nucleótidos de Adenina, existen, no obstante,
diversos trifosfatos, entre ellos el ATP, relacionados con la transferencia de
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Los procesos metabólicos que tienen lugar en la mitocondria son los siguientes:
2 CO2
3 NADH + 3H+
1 FADH2
1 GTP, que se transformará en ATP
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REACCIÓN DESCRIPCIÓN
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A. Reacciones de óxido-reducción.
AH2 + B ↔ A + BH2
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Las formas oxidadas y reducidas de los compuestos o grupos que operan en las
reacciones de oxidación-reducción se denominan pares redox. La facilidad con la
que un dador de electrónico determinado (reductor) cede sus electrones a un
aceptor electrónico (oxidante) se expresa cuantitativamente como potencial de
oxidación-reducción del sistema. El potencial de oxidación-reducción se mide en
voltios como la fuerza electromotriz (fem) de una semicélula de referencia.
(Devlín, 1999)
El destino final del Acetil CoA producido en las diversas vías catabólicas
generadoras de energía es su oxidación completa en una serie cíclica de
reacciones oxidativas denominada ciclo de los Ácidos Tricarboxílicos (TCA). Este
ciclo metabólico también se conoce como ciclo del ácido cítrico o ciclo de Krebs, la
localización primaria de las enzimas del ciclo de Krebs es la mitocondria, ya que el
complejo multienzimático de la piruvato deshidrogenasa y la secuencia de la β-
oxidación de los ácidos grasos, las dos fuentes principales para la generación de
Acetil CoA, están localizadas en el compartimiento mitocondrial. Además, una de
las funciones primordiales del ciclo de Krebs es generar equivalentes de
reducción, los cuales se utilizan para producir energía, es decir, ATP, en la
secuencia del transporte electrónico-fosforilación oxidativa. (Devlín, 1999)
- Dos CO2,
- Un enlace fosfato de alta energía (en forma de GTP) y
- Cuatro equivalentes de reducción (tres NADH y un FAGDH2) (Devlín, 1999)
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Ciclo de Krebs
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La etapa inicial del ciclo está catalizada por la enzima citrato sintasa. Ésta es una
reacción altamente exergónica que dirige los grupos acetilo hacia la formación de
citrato, es decir, hacia la oxidación, en el ciclo de Krebs. La reacción de la citrato
sintasa implica la condensación del acetilo con la función α-ceto del ácido
dicarboxílico oxalacético. La citrato sintasa es una enzima que se encuentra en la
matriz mitocondrial y puede reaccionar con monofluoroacetil CoA para formar
monofluorocitrato, que es un potente inhibidor de la siguiente etapa del ciclo, la
reacción de la Aconitasa. El citrato se convierte en Isocitrato en la reacción de la
Aconitasa, esta reacción supone la generación de un intermedio ligado a la
enzima, el cis-aconitato. Aunque la reacción de la Aconitasa no requiere
cofactores, sí requiere ion ferroso (Fe2+) en su mecanismo catalítico. Hay pruebas
de que este Fe2+ puede estar implicado en un centro ferrosulfurado, que es un
componente esencial de la actividad hidratasa de la Aconitasa. (Devlín, 1999)
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El carácter de alto contenido energético del enlace tioéster del Succinil CoA se
conserva en una reacción de fosforilación a nivel de sustrato en el paso del ciclo.
La reacción de la Succinil CoA sintetasa o Succinato tioquinasa convierte el
Succinil CoA en Succinato, e implica en los tejidos de mamíferos la fosforilación de
GDP a GTP, ésta reacción es fácilmente reversible y el mecanismo catalítico
implica como intermediario a la enzima-Succinil fosfato. (Devlín, 1999)
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C. Fosforilación oxidativa.
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Mecanismos:
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Se han resuelto varias cuestiones relativas a los detalles del mecanismo mediante
el cual tiene lugar este importante proceso bioquímico. Estas cuestiones están
relacionadas con el mecanismo mediante el cual los protones son bombeados
fuera de la matriz mitocondrial durante el transporte electrónico, la estequiometria
de protones translocados por ATP sintetizado y el mecanismo por el que los
protones vuelven a ser bombeados hacia la matriz a través de la F 1F0-ATPasa.
(Devlín, 1999)
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Bibliografía
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