Tugas Critical Journal Review

Mata Kuliah: Biologi Molekuler

SLOWING BACTERIAL TRANSLATION SPEED ENHANCES

EUKARYOTIC PROTEIN FOLDING EFFICIENCY

Dosen Pengampu:
Dr. FAUZIYAH HARAHAP, M.Si

Oleh:

Tio Silvia Silitonga

4163141050

Kelas Biologi Dik D 2016

JURUSAN BIOLOGI

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

UNIVERSITAS NEGERI MEDAN

2019
Identitas Jurnal:

Judul Jurnal : Slowing Bacterial Translation Speed Enhances Eukaryotic Protein Folding
Efficiency.
Penulis : Efraín Siller, Diane C. DeZwaan, John F. Anderson, Brian C. Freeman dan
Jose M. Barral
Tahun Terbit: 2010
Jenis Jurnal : Journal Molecular
Volume : 396
Halaman : 1310 – 1318

Ringkasan Jurnal:
Mekanisme pelipatan protein de novo berbeda secara signifikan di antara keduanya bakteri
dan eukariota, sebagaimana dibuktikan oleh hasil penelitian yang buruk yang sering diamati
protein eukariotik asli pada produksi rekombinan pada sistem bakteri. Laju sintesis polipeptida
lebih cepat pada bakteri daripada pada eukariota, tetapi efek variasi umum pada tingkat
terjemahan efisiensi pelipatan protein sebagian besar tetap belum diteliti. Dengan menggunakan
sampel Sel Escherichia coli dengan ribosom mutan yang kecepatan terjemahannya dapat
dimodulasi, peneliti menunjukkan di sini bahwa mengurangi tingkat perpanjangan polipeptida
menyebabkan peningkatan lipatan protein beragam asal eukariotik. Hasil ini menunjukkan
bahwa pada eukariota, pelipatan protein memerlukan perlambatan tingkat terjemahan.
Sebaliknya, pelipatan bakteri tampaknya tidak dapat dipisahkan dari sintesis protein,
menjelaskan temuan peneliti yang digeneralisasikan pengurangan kecepatan terjemahan tidak
berdampak buruk pada lipatan proteom bakteri endogen. Pemanfaatan strategi ini telah
memungkinkan produksi protein multidomain eukariotik asli itu sebelumnya tidak dapat dicapai
dalam sistem bakteri dan mungkin merupakan alternatif umum untuk produksi rekombinan
rawan agregasi protein.
Dalam studi ini, peneliti memulai untuk meneliti apakah tingkat perpanjangan polipeptida
bakteri yang cepat ribosom dapat bertanggung jawab, setidaknya sebagian, untuk kapasitas E.
coli yang buruk untuk memperbanyak protein dari eukariotik, biasanya diterjemahkan pada
bagian yang jauh kecepatan lebih lambat dari ribosom eukariotik. Peneliti telah menemukan
bahwa memang mengurangi polipeptida bakteri tingkat perpanjangan ke tingkat yang serupa
dengan tingkat eukaryotes mempromosikan pelipatan beragam perangkat protein heterolog.
Bagaimana terjemahannya lebih lambat, mendukung pelipatan protein eukariotik yang benar? Itu
jalur lipat protein eukariotik berkembang dikonteks dari tarif terjemahan yang lebih lambat.
Namun, ketika protein eukariotik muncul dari bakteri ribosom dengan kecepatan lebih tinggi,
rantai yang lebih baru lahir terkena kemungkinan konformasi yang lebih besar, beberapa di
antaranya dapat mengakibatkan spesies yang gagal melipat itu awalnya tidak pernah dipilih.
Lebih lambat Munculnya dari ribosom mungkin sementara batasi jumlah konformasi yang salah
itu rantai yang baru lahir memanjang dapat mengadopsi. Selain itu pelengkap pendamping dari
sitosol bakteri mungkin tidak kompatibel dengan rezim pelipatan protein eukariotik tertentu.
Beragam metodologi sebelumnya berusaha untuk meningkatkan hasil terlipat dengan benar
protein eukariotik rawan agregasi yang diproduksi di sistem bakteri, dengan berbagai tingkat
keberhasilan. Sebuah Pendekatan yang banyak digunakan adalah menurunkan suhu selama
periode induksi, yang telah terbukti bermanfaat untuk beragam protein. Namun, hasil lipat
sejumlah besar protein tampaknya tidak membaik bahkan saat induksi suhu serendah 18°C.
Mungkin perilaku yang berbeda ini menjelaskan, setidaknya sebagian, pada tingkat yang
berbeda-beda dengan mana penurunan suhu mempengaruhi seluler proses dan parameter,
termasuk sintesis protein dan tingkat lipat, serta hidrofobik interaksi. Untuk protein yang salah
lipat bahkan berkurang suhu, efek menguntungkan dari penurunan suhu (mis., tingkat terjemahan
yang lebih lambat dan penurunan interaksi hidrofobik) mungkin ditutupi oleh efek buruk (mis.,
reduksi yang kuat dalam tingkat lipat intrinsik dan aktivitas biokimia pendamping molekul).
Karena strategi yang diuraikan dalam penelitian ini menargetkan kecepatan terjemahan secara
eksklusif, semua proses seluler lainnya dipertahankan konstan. Dengan demikian, muncul rantai
yang baru lahir perlahan-lahan dari ribosom mungkin mendapat manfaat dari tidak berubah tarif
lipat dan bantuan pendamping penuh. Di kasus di mana efek buruk dari suhu rendah tidak
memiliki dampak besar pada properti lipat protein yang diproduksi, mengurangi terjemahan rate
selanjutnya dapat meningkatkan hasil lipatnya. Demikian pula, pemanfaatan ribosom SmP
mungkin bermanfaat untuk produksi protein yang derezim lipat novo tergantung pada ekspresi
berlebih atau suplementasi dengan pendamping molekuler, 3strategi yang, dengan sendirinya,
sejauh ini hanya terbuktikeberhasilan terbatas.
Singkatnya, peneliti menemukan penurunan itu tingkat terjemahan dalam bakteri per se
mempromosikan melipat beragam protein eukariotik asal. Peneliti menemukan bahwa tingkat
sintesis protein berkurang, menyebabkan tidak ada efek merugikan pada pelipatan protein
rekombinan. Terjemahan lebih lambat tidak menyebabkan salah lipatan protein endogen atau
aktivasi respon stres bakteri. Peneliti percaya bahwa temuan mereka menyediakan strategi umum
untuk produksi protein rekombinan yang tidak bergantung pada manipulasi individu dari urutan
pengkodean atau pada pengenalan faktor-faktor aksesori spesifik.