Genome Engineering

PRéSENTATION CORPORATE 2007

 Sommaire

4 Eléments marquants en 2007

6 Points forts et Potentiel

8 Lettre du Directeur Général

14 Historique

16 Activités et marchés

18 Sources de revenus

Bourse et communication financière

20 Origines scientifiques

21 Portefeuille produits

22 Propriété intellectuelle

23 Stratégie et modèle économique

24 Gouvernance

26 Principaux éléments financiers

 éléments marquants en 2007

Corporate
• Introduction en bourse réussie le 7 février 2007 sur le marché Alternext de NYSE Euronext
via une augmentation de capital par émission d’actions nouvelles qui a permis de lever
plus de 24 millions d‘euros dédiés à l’augmentation des capacités de production, de marketing et ventes
et de recherche et développement.
• La grande majorité des actionnaires historiques et des employés de Cellectis ont souscrit
à l’augmentation de capital.

Leadership renforcé
• Recrutement de 8 personnes en R&D et Business Development.
• Passage de 40 à 48 collaborateurs dont 17 docteurs ès sciences.
• Renforcement du Conseil Scientifique et du Conseil d’Administration avec les nominations
du Pr. Alain Fischer (Hopital Necker, Paris) comme nouveau membre du Conseil
Scientifique ; de M. Alain Godard, ancien Président du directoire d’Aventis CropSciences
et du Pr. Richard C. Mulligan, Professeur de Génétique à Harvard Medical School,
en tant qu’administrateurs indépendants au Conseil d’Administration de la société.

Commercial
• Signature en avril d’une licence commerciale avec Celonic, société allemande de production à façon de
protéines recombinantes. Cette signature marque la réussite des étapes de validation de la technologie
de Cellectis dans une lignée cellulaire de production industrielle.
• Fourniture en mai d’une première méganucléase à spécificité modifiée fabriquée à façon pour Bayer
CropSciences dans le cadre d’une collaboration initiée en 2006. Cette réussite technique démontre
la capacité de Cellectis à délivrer une méganucléase à spécificité modifiée en 9 mois à compter de
l’identification d’une cible génomique.
• Signature en mai d’un accord de licence de recherche avec GlaxoSmithKline dans le domaine de la
recombinaison homologue. Ce type d’accord devrait être étendu à d’autres « Big Pharma » dans les
mois et les années à venir.
• Signature en octobre avec les Laboratoires Servier d’un accord dans le domaine de l’ingénierie cellulaire
• Signature en octobre d’un accord de licence avec la société japonaise Trans Genic, pour l’utilisation de
Cellectis traite des sujets la technologie de recombinaison homologue.
scientifiques complexes et apporte
des solutions simples et innovantes.
Propriété intellectuelle (148 brevets et demandes de brevets) :
Extension du portefeuille :
• Obtention de 8 nouveaux titres dont 3 en Europe et 5 aux Etats-Unis.
(passage de 27 à 35 brevets délivrés en un an)
• Dépôt de 44 nouvelles demandes de brevets.
(passage de 69 à 113 demandes de brevets déposées en un an)

R&D
• Résultats positifs sur cellules de patients (XPC) – septembre.
• Livraison de 2 méganucléases (p53) au consortium européen NetSensor – juillet.
• Livraison d‘une méganucléase ciblant RAG1, responsable d‘une immunodéficience sévère,
au Pr Luigi Notarangelo,Children Hospital Boston – novembre.
• Livraison d‘une méganucléase ciblant IL2RG au Pr Alain Fischer,
Hôpital Necker-Enfants Malades à Paris – août.
• Collaborations avec le CNIO et le CRG (Espagne) – un article soumis et un sous presse.
• Collaboration avec l’hôpital Necker sur un modèle murin – article soumis.
• Publications scientifiques (4) :
- Nucleic Acid Research (2007;35(10):3262-71)
- Current Gene Therapy (2007 Feb;7(1):49-66)
- Journal of Molecular Biology (2007 Aug 3;371(1):49-65)
- Journal of Biological Chemistry (2008 Feb 15;283(7):4364-74)

l Cellectis l Présentation Corporate 2007 l Eléments marquants en 2007 l 4

 AmBITION.
IT‘S IN OuR DNA.
Devenir leader mondial de la
programmation de l’ADN ou ingénierie
du génome.

l Cellectis l Présentation Corporate 2007 l Présentation de Cellectis l 5

 Points forts

• Position dominante au plan international en ingénierie rationnelle du génome, soutenue par une
technologie toujours à la pointe et validée par de nombreuses publications scientifiques (4 en 2007),
ainsi qu’une stratégie de conquête en propriété intellectuelle.

• Propriété intellectuelle unique et politique agressive sur la protection de son portefeuille existant
donne à Cellectis un avantage dans le développement de sa technologie et renforce son avance
et savoir-faire. Au 31 décembre 2007, la Société disposait de droits sur 30 familles de brevets,
représentant 35 brevets délivrés et 113 en cours d’examen en France et à l’étranger
(voir tableau page 22).

• Validation de sa technologie par l’industrie à travers des partenaires mondiaux (GSK, Servier, Bayer
CropSciences, Celonic, Trans Genic, etc...) qui lui donne visibilité et crédibilité sur ses marchés ciblés :
la santé, l‘agriculture biotechnologique, la bioproduction et la recherche.

• Collaborations de recherche avec des institutions académiques renommées au plan international

(INSERM, Institut Gustave Roussy, CNRS, Institut Pasteur, Boston Children’s Hospital,
Harvard Medical Institute, Hôpital Necker Enfants Malades, etc.) dans le domaine de la recherche.

• Portefeuille produits diversifié qui compte aujourd’hui 18 produits en développement avec des
perspectives équilibrées de revenus à court, moyen et long terme.

• Gestion prudente de la trésorerie.

• Équipe dirigeante expérimentée et complémentaire soutenue par une équipe de personnes motivées.

3 différentes méganucléases de
Cellectis, fixées sur leur cible.
Les méganucléases sont des ciseaux
à ADN naturels qui reconnaissent et Potentiel
coupent un fragment d‘ADN de
grande taille unique dans un génome. L’une des forces principale de Cellectis est sa capacité à augmenter la production annuelle de ses
MRS de manière substantielle et par là même ses revenus de manière constante :

• 8 MRS produits en 2006.

• 10 MRS produits en 2007.
• Capacité de 20 en 2008.
• Dépasser la capacité de 20 d’ici 2010.
• L’objectif est que plus de 40 produits différents issus de méganucléases soient utilisés
activement par nos partenaires et clients en 2010.

En 2007, Cellectis a atteint un objectif de production de 10 nouvelles méganucléases. Plus de 18

applications différentes sont ainsi en cours de développement depuis la création de la société. Les
premières méganucléases de Cellectis sont sorties au quatrième trimestre 2005 et des partenariats
ont été initiés en s’appuyant prioritairement sur le portefeuille clients existants. Le premier accord sur
des méganucléases s’est déjà concrétisé par la livraison d’un produit au groupe d’agrochimie, Bayer
Biosciences, et la livraison de trois premières méganucléases à but thérapeutique - une première à
l’équipe de l’INSERM du Professeur Alain Fischer à l’Hôpital Necker Enfants Malades ; une deuxième
à l’équipe du Professeur Luigi Noratangelo du Boston Children’s Hospital et une troisième à l’équipe
du CNRS du Professeur Alain Sarasin de l’Institut Gustave Roussy (IGR). A l’horizon 2010, Cellectis
estime que 40 MRS seront activement utilisés par ses clients et partenaires stratégiques.

Cellectis a signé plus de 48 accords avec des laboratoires pharmaceutiques (GSK, AstraZeneca,
Merck & Co., Wyeth, Shire, Servier etc.) ; des groupes agronomiques (Bayer CropSciences, DuPont
Pioneer HiBred, BASF, Limagrain etc.) ; et des sociétés de biotechnologie (Genentech, Regeneron,
Lexicon Genetics, Celonic, Trans Genic Inc. etc.). Cellectis cible et concentre ses efforts de R&D
sur des marchés à fort potentiel comme celui des maladies monogéniques, celui des infections par
des virus à ADN ou rétrovirus (Herpes, Hépatite B ou VIH), la greffe allogénique et le cancer.

l Cellectis l Présentation Corporate 2007 l Points forts l 6

 DIVERSITY.
IT‘S IN OuR DNA.
quatre marchés cibles à fort potentiel
commercial pour les méganucleases :
la santé, l’agronomie, la recherche et
la bioproduction.

l Cellectis Genome Engineering l Annual Report 2006 l Présentation de Cellectis l 7


Dr. André Choulika,
Directeur Général
l Cellectis l Présentation Corporate 2007
Lettre du Directeur Général
Aujourd’hui, de très nombreuses sources d’informations sur les génomes sont mises à la disposition
des chercheurs, des industriels et des médecins. Des moyens humains et matériels considérables sont
investis pour comprendre le fonctionnement des gènes et des génomes afin d’améliorer notre santé,
notre qualité de vie et notre environnement. Toutefois, de nombreuses maladies restent encore en
attente de réponses thérapeutiques adaptées et le monde est encore à la recherche de nouvelles sources
d’énergie et de matériaux renouvelables dans le respect des écosystèmes. La compréhension du
fonctionnement des génomes et la possibilité de pouvoir y intervenir avec précision pour les réparer
ou les moduler permettront de répondre à bon nombre de ces attentes. La technologie de Cellectis
met en œuvre une science qui a été développée il y a plus de 20 ans à l’Institut Pasteur. Elle est à la
croisée de trois disciplines arrivées à maturité : la biologie avec la recombinaison de l’ADN, la biologie
structurale et la robotique. Les produits que Cellectis dessine et fabrique sont au croisement d’une
nouvelle révolution des biotechnologies, la programmation rationnelle du génome des espèces et de
la chirurgie génomique à but thérapeutique.
2007 a été une année de transformation pour Cellectis qui est passée au stade de société cotée et
a franchi des jalons technologiques majeurs.
• Le 6 février 2007 Cellectis s’est introduite en bourse sur Alternext, un marché de NYSE Euronext.
Cette opération a permis d’augmenter notre capital de 24,4 millions d’euros brut qui vont
permettre d’amplifier notre capacité de production de nouvelles méganucléases, d’accroître notre
effort de recherche et de développement et de renforcer notre activité commerciale.
• Nous avons obtenu les premières preuves de la réparation d’un gène (sur le gène humain XPC) dans
une lignée cellulaire. Les mutations de ce gène sont responsables d’une maladie de la peau plus
connue comme la «maladie des enfants de la lune». Ce travail, réalisé en collaboration avec l’Institut
Gustave Roussy, montre qu’une méganucléase programmée par Cellectis pour cibler le gène XPC
malade, peut induire sa réparation dans une lignée de cellules humaines de peau en culture.
• En délivrant, dans les temps, à la Société Bayer Biosciences une méganucléase à spécificité modifiée
pour une application dans une plante, nous avons franchi un jalon significatif pour notre activité.
Le franchissement de ce premier jalon a ouvert des perspectives d’élargissement de notre collaboration
avec Bayer Biosciences et des voies dans le secteur de l’agriculture biotechnologique
au sens large.
Construire et améliorer notre plateforme de production de méganucléases
Depuis sa création en janvier 2000, Cellectis a concentré ses efforts sur le développement d’une
technologie et son industrialisation en une plateforme qui nous permet de dessiner et de sélectionner
de nouvelles molécules qui induisent la recombinaison ciblée de l’ADN dans des cellules vivantes.
Pour cela, nous avons exploité des technologies qui ont été découvertes et brevetées par des chercheurs
de l’Institut Pasteur. En investissant des moyens humains et matériels significatifs nous avons réussi à
mieux comprendre le fonctionnement des méganucléases et à les universaliser. A la fin de l’année 2007
nous avons doublé notre capacité à fabriquer des méganucléases dirigées contre une cible ADN. Dans le
même temps, nous avons amélioré nos processus de fabrication et ainsi réalisé d’importants gains de
productivité. Même si le délai pour fabriquer une méganucléase avec une nouvelle spécificité pour une
cible ADN reste inchangé (9 mois), nous avons obtenu des résultats spectaculaires sur l’amélioration de
la spécificité et l’efficacité de nos produits. Les molécules que nous produisons ouvrent désormais la voie
à des applications en thérapeutique humaine pour une chirurgie précise du génome.
l Lettre du Directeur Général l 8
 Cellectis est un chef de file mondial dans la recherche et le développement des méganucléases et
l’étude de leurs actions pour reprogrammer le génome des espèces. La preuve de cet ascendant
est la qualité et la fréquence de nos publications scientifiques et le nombre de brevets déposés au
cours de cette dernière année. Toutefois, la portée d’une technologie se mesure aussi par sa diffusion
au sein de la communauté scientifique et le succès de son utilisation. Si en 2006 plus de 60 articles
scientifiques citaient l’usage de méganucléases pour induire de la recombinaison de l’ADN,
on en compte plus de 100 en 2007 et dans des organismes aussi divers que la tomate, la grenouille,
le moustique vecteur du paludisme, les champignons, les mycobactéries ou des lignées de cellules
humaines. Le succès d’une technologie se construit, non seulement par ses concepteurs, mais aussi
par la main de ses utilisateurs pour en faire le standard de la programmation des génomes.

Construire des partenariats industriels forts

L’accroissement des besoins en technologies d’ingénierie rationnelle des génomes ces dernières années
est prouvé par l’intérêt que porte l’industrie à l’approche de Cellectis. Nous avons signé 48 accords
de licences et de partenariats depuis la création de la société avec des sociétés issues du secteur de la
biotechnologie, de la pharmacie ou de l’agro-chimie. Ces sociétés ont utilisé ou utilisent nos techno-
logies pour améliorer leur recherche de produits innovants ou pour mettre au point de nouveaux
produits issus de modifications rationnelles du génome. Cette année nous nous sommes engagés dans
5 collaborations avec Celonic (DE), Glaxo SmithKline (US et UK), Bayer Biosciences (DE et FR),
Servier (FR) et Trans Genic (JP). Ces accords reflètent l’importance de notre technologie dans le monde
et les opportunités qu’elle offre pour créer de la valeur.

Ces accords sont, dans certains cas, des licences d’utilisation de notre technologie pour faire de
la validation de cibles génomiques afin de comprendre le rôle de certains gènes et développer de
nouvelles molécules thérapeutiques. Dans d’autres cas, certains de nos partenaires utilisent nos
technologies pour produire des protéines dans un but industriel et commercial, pour créer de nouvelles
protéines à visées thérapeutiques. Enfin, nos technologies sont aussi utilisées dans certaines de
nos collaborations pour améliorer des espèces de façon maîtrisée et propre en évitant de faire de la
modification aléatoire de gènes et en évitant de transférer de l’ADN étranger. Cellectis n’est pas
une société de service et l’ensemble de nos partenariats sont collaboratifs. Au cours de l’année 2007
Cellectis n’était engagée dans aucun partenariat commercial utilisant des méganucléases à visées
thérapeutiques. Cette technologie prometteuse mais encore très prospective, reste pour l’instant au
stade de la mise au point. Cellectis la développe pour l’instant dans le cadre exclusif de partenariats
académiques et hospitaliers.

La chirurgie du génome par méganucléases, une révolution pour le futur de la médecine

Le potentiel d’utilisation des méganucléases dans une approche thérapeutique est un des axes majeurs
de la stratégie de Cellectis. En effet, ces coupeurs de l’ADN de très grande précision sont programmés
pour ne couper que leur cible. Théoriquement, si une méganucléase n’a pas sa cible ADN dans une
cellule, même si le génome humain fait près de 3 milliards de paires de bases (paires de G, A, T, et C
composant la double hélice de l’ADN), elle restera inactive. En revanche, si sa cible est présente,
elle cassera cette cible avec une grande précision. Aujourd’hui Cellectis développe des méganucléases
pour quatre types d’applications thérapeutiques différentes, (i) la réparation de mutations impliquées
dans des maladies génétiques, (ii) la destruction de l’ADN de certains virus dans les cellules infectées,
(iii) l’inactivation de gènes responsables du rejet de greffe dans des cellules ou des organes avant
transplantation, et enfin, (iv) l’affaiblissement de cellules cancéreuses ou l’induction de leur mort par
l’intervention sur certains gènes impliqués dans la cancérogenèse.

l Cellectis l Présentation Corporate 2007 l Lettre du Directeur Général l 9

 Nous avons publié plusieurs articles scientifiques montrant la capacité de Cellectis à produire de
méganucléases à visées thérapeutiques, comme certains principes de la chirurgie des génomes dans
des journaux à comité de lecture internationaux tels que Nucleic Acid Research, Current Gene Therapy
ou Journal of Molecular Biology. Nous avons délivré plus de six différentes méganucléases dans nos
collaborations de recherche ciblant des gènes impliqués dans le cancer, les maladies des enfants bulle
(SCID), la maladie des enfants de la lune (XP), l’anémie falciforme (SCA) et des outils de recherche et
de développement.

Pour la première fois en science, dans le cadre d’une collaboration que nous avons avec le laboratoire
du Pr. Alain Sarasin de l’unité CNRS-FRE2939 situé à l’Institut Gustave Roussy, la correction d’une
mutation dans une lignée cellulaire isolée à partir d’un patient atteint de Xeroderma pigmentosum (XP)
a été corrigée par chirurgie génomique grâce à une méganucléase. La correction génique induite par
méganucléase apparaît aujourd’hui comme l’alternative aux approches classiques de thérapie génique,
souvent fondées sur des transferts de gènes par des vecteurs viraux. Bien que ces données soient encore
très préliminaires et doivent être reproduites et étudiées de façon plus approfondie, c’est un premier
jalon vers une utilisation thérapeutique du ciblage génique par méganucléases pour traiter les maladies
monogéniques héréditaires.

L’implémentation d’un modèle économique équilibré aux perspectives ambitieuses

La particularité du modèle économique de Cellectis est son inscription dans la durée. La biotechnologie
moderne est née de la capacité de l’homme à modifier le programme génétique. La tendance de cette
industrie est d’aller vers une plus grande maîtrise de l’ingénierie des génomes pour un champ d’applica-
tion bien plus vaste. Le positionnement de Cellectis est clé et central dans cette tendance et recèle
un potentiel de création de valeur considérable. D’une part, il permet de générer des revenus de court
terme grâce aux licences de brevets que nous accordons à nos partenaires, aux collaborations que
nous avons sur nos outils de recherche et de production et aussi à nos collaborations dans l’agriculture
biotechnologique. Les revenus issus de nos licenciés et collaborateurs nous permettent, non seulement,
de générer du chiffre d’affaires, mais aussi, de préserver la valeur de long terme que contient notre
technologie. Nous continuons à augmenter le nombre de nos clients et collaborateurs. En outre, dans le
cadre de ces partenariats, le spectre de certaines de nos collaborations s’est élargi. En 2007, nous avons
eu des collaborations dans le domaine de la bioproduction, de la recherche et de l’agriculture biotech-
nologique. Au cours de cette année nous avons initié la mise au point de notre premier kit à l’usage
des chercheurs en biologie, d’autre produits de la même gamme sont aussi en préparation. Nous avons
investi une part significative de nos ressources pour développer des produits à visée thérapeutique et
continuerons à le faire dans les prochaines années. Nous souhaitons les développer et les valider afin
de pouvoir les porter jusqu’aux patients en partenariat avec l’industrie pharmaceutique. Ce portefeuille
de produits thérapeutiques représentera un actif majeur de Cellectis pour les années futures.

Le 7 février 2007, notre introduction en bourse nous a permis de lever 24,4 millions d’euros et notre
trésorerie à la fin de l’exercice 2007 était d’approximativement 25 millions d’euros. Outre l’enthou-
siasme suscité auprès des investisseurs lors de l’introduction, une très large majorité des salariés de la
société a souscrit à cette augmentation de capital témoignant ainsi de leur confiance dans la durée sur
les perspectives de leur société. Cellectis a, depuis sa création, été une société à la gestion précaution-
neuse de sa trésorerie avec une consommation de capital, propre aux sociétés de biotechnologies,
maîtrisée. Même si nous pensons augmenter notre consommation de capital à court terme pour
atteindre les objectifs que nous nous sommes fixés, nous pensons avoir une trésorerie suffisante pour
construire des actifs de grandes valeurs et atteindre nos objectifs de court et moyen terme.

l Cellectis l Présentation Corporate 2007 l Lettre du Directeur Général l 10

 VISION.
IT‘S IN OuR DNA.
un « couper-coller » de l’ADN présent
dans la nature découvert dans
les années 80 par des chercheurs
de l’Institut Pasteur.

l Cellectis Genome Engineering l Annual Report 2006 l Présentation de Cellectis l 11

 Chef de file sur une technologie de rupture, Cellectis est extrêmement active sur le terrain de la propriété
intellectuelle. Fin 2006, notre portefeuille comptait 96 brevets et demandes de brevets en licence
exclusive de l’Institut Pasteur ou en propre. En un an, nous avons obtenu 8 nouveaux titres de brevets
et déposé 44 nouvelles demandes portant ainsi notre portefeuille à 148 brevets et demandes de brevets.
Cette forte intensité inventive de la part de nos chercheurs est le corollaire d’une science rigoureuse, à
la pointe technologique mais aussi le résultat de la grande créativité de nos chercheurs. Nous défendons
aussi notre liberté d’exploitation en protégeant notre portefeuille contre d’éventuels opposants et nous
nous sommes opposés avec succès aux brevets concurrents que nous estimions être sans mérite au
regard des nôtres.

En 2007, Cellectis a fait évoluer sa gouvernance avec l’arrivée de nouvelles personnalités dans son conseil
d’administration et conseil scientifique. En juillet, le Professeur Richard C. Mulligan, un pionnier mondia-
lement reconnu du développement de nouvelles technologies pour le transfert de gènes et ayant une
longue expérience dans le domaine des biotechnologies, nous a rejoint pour renforcer notre stratégie sur
nos orientations thérapeutiques. En Septembre, à la suite de la démission d’Edmond de Rothschild
Investment Partners de notre conseil d’administration, Alain Godard, ancien Directeur Général d’Aventis
Crop Science, nous a également rejoint pour renforcer notre stratégie dans le secteur de l’agriculture
biotechnologique. Aussi, je souhaite remercier chaleureusement Gilles Nobécourt, représentant
d’Edmond de Rothschild Investment Partners, pour sa participation à notre conseil d’administration et
pour les 5 années de travail qu’il y a effectué. Il a apporté à Cellectis son professionnalisme, son réseau
exceptionnel et sa vision clairvoyante sur l’industrie des biotechnologies. Enfin, le Professeur Alain Fischer
avec lequel nous collaborons depuis plusieurs années est venu renforcer notre conseil scientifique
en y apportant son expertise scientifique et médicale sur les maladies génétiques héréditaires et les
approches de thérapie génique.

A la source d’un changement de paradigme dans l’industrie des biotechnologies

Cellectis, c’est tout d’abord les personnes qui y travaillent. Parmi les 48 salariés de l’entreprise à la
fin de l’exercice 2007, la majorité a été embauchée depuis longtemps et pour certains depuis l’année
de création de la société. C’est grâce, à leur inventivité, au dur travail qu’ils ont fourni au cours de
ces années, à l’excellence de leur esprit d’équipe, à leur adhésion au projet commun et à une vision
commune, sans jamais céder au découragement que nous avons réussi aujourd’hui à créer une rupture
technologique majeure en biotechnologie. Dans les traces des chercheurs de l’Institut Pasteur qui ont
découvert ces technologies, nous avons cru il y a plus de 8 ans dans le potentiel thérapeutique et
commercial de l’ingénierie des génomes et des méganucléases. De nombreux défis restent encore à
relever avant de voir un jour notre approche mise à la disposition des patients souffrant de pathologies
sans réponse thérapeutique adaptée ou que de nouveaux biologiques, issus de l’ingénierie rationnelle
des génomes, ne soient commercialisés. Toutefois, nous avons désormais franchi avec succès cette
année un jalon important vers une nouvelle approche de la médecine moléculaire, la chirurgie génomique,
et ouvert l’accès à un très grand nombre d’applications pour la programmation génétique du vivant
pour des marchés d’une grande diversité et de très fort potentiel.

Enfin, nous souhaitons remercier nos actionnaires pour leur soutien et la confiance qu’ils nous portent.

Très cordialement,

André Choulika
Directeur Général

l Cellectis l Présentation Corporate 2007 l Lettre du Directeur Général l 12

 INNOVATION.
IT‘S IN OuR DNA.
La chirurgie des gènes pour soigner
les désordres génétiques, lutter contre
les infections et améliorer les greffes.

l Cellectis Genome Engineering l Annual Report 2006 l Présentation de Cellectis l 13


Des laboratoires de haute
technologie au sein du Parc Biocitech.
l Cellectis l Présentation Corporate 2007
Historique
Fondée sur une véritable rupture technologique, l’approche innovante de Cellectis ouvre la voie à
une ingénierie fine et précise du génome ou la réécriture de tout organisme vivant.
A l’origine du projet de société, l’association de deux technologies issues des recherches de l’Institut
Pasteur : la recombinaison homologue et les endonucléases introniques. Alors qu’il poursuit ses études
post-doctorales aux Etats Unis, dans le Laboratoire du Pr Richard C. Mulligan à la Harvard Medical
School et dans le département de médecine moléculaire du Boston Children’s Hospital, André Choulika
imagine de fonder une société qui va élaborer des systèmes artificiels pour induire la réparation
de l’ADN ou pour en modifier sa composition à partir de ces deux technologies : les méganucléases
(protéines naturelles coupant l’ADN à un endroit unique et précis dans une cellule vivante) et la
recombinaison homologue (ou le ciblage d’une séquence du génome par une autre en utilisant des
séquences semblables en aval et en amont dudit gène).
En 1999, André Choulika revient en France présenter son projet aux responsables de la valorisation
et au directeur de l’Institut Pasteur, détenteur des brevets. Après avoir gagné le concours national
d’aide à la création d’entreprise, il s’associe à David Sourdive, jeune chercheur comme lui et, ensemble,
ils fondent Cellectis en tant que Spin-off de l’Institut Pasteur.
Cellectis est une authentique société de biotechnologie, spécialisée dans une approche très innovante,
tant au plan technologique qu’au niveau de son modèle économique. La société, qui vise à se position-
ner comme leader mondial de la programmation de l’ADN, conçoit et commercialise une nouvelle classe
de produits, les MRS (systèmes de recombinaison par méganucléase) permettant une ingénierie fine et
précise de tout génome d’organismes vivants.
Le MRS de Cellectis, ou couper/coller de l’ADN, représente une véritable rupture technologique dans
le monde des biotechnologies.
En effet, depuis les années 70, l’essentiel des applications industrielles sont faites par l’insertion de gènes
au hasard (ex : protéines thérapeutiques, thérapie cellulaire, thérapie génique), alors que la technologie
de Cellectis est précise, efficace et puissante. La conception et le développement de méganucléases dont
la spécificité est unique pour un gène donné, permet de modifier la séquence d’un gène, de le moduler
ou de le réparer précisément dans n’importe quel organisme vivant ou cellule.
Cellectis intervient sur les génomes à l’aide de méganucléases seules pour détruire un ADN infectieux
(désinfection d‘une cellulle par destruction de l‘ADN du virus) ou inactiver un gène (cancer). En outre,
elle développe des systèmes de recombinaison par méganucléases ou MRS (pour Meganuclease Recombi-
nation System), produit composé de deux éléments : des «ciseaux à ADN» (méganucléase) et d’une
matrice ADN permettant de transmettre de l’information génétique dans un chromosome dans n’importe
quel organisme vivant (humain ou animal, plante, microorganisme). Le MRS entre dans les cellules
pour cibler l’ADN des chromosomes afin d’y substituer un gène par un autre, ou portion de gène, de
façon précise et maîtrisée de le corriger ou simplement pour y insérer de l’ADN ou d’en supprimer.
Le savoir faire spécifique de Cellectis et l’arrivée de ces nouvelles technologies sur le marché ouvrent de
nouveaux champs d’applications et d’exploitation des connaissances acquises au cours des 30 dernières
années en biologie et plus particulièrement en génomique.
l Historique l 14
 FuTuRE.
IT‘S IN OuR DNA.
un portefeuille de brevets mature
aux revendications larges qui offre
aujourd‘hui des opportunités de
collaborations, des revenus et
préserve la compétitivité de demain.

l Cellectis Genome Engineering l Annual Report 2006 l Présentation de Cellectis l 15


Santé.
Agriculture biotechnologique.
Production de biologiques.
Recherche.
l Cellectis l Présentation Corporate 2007
Activités et marchés
Depuis sa création, et jusqu’en 2006, Cellectis a vendu des contrats de sous licence des technologies
de l’Institut Pasteur et a signé plus de 48 accords avec des laboratoires pharmaceutiques (Glaxo
SmithKline, AstraZeneca, Merck & Co., Wyeth, Shire, Servier etc.) ; des groupes agronomiques
(Bayer CropSciences, DuPont Pioneer Hi-Bred, BASF, Limagrain etc.) ; et des sociétés de biotechnologie
(Genentech, Regeneron, Lexicon Genetics, Celonic, Trans Genic Inc. etc.). Au cours de cette période,
Cellectis a mis au point sa propre technologie, fondée sur le changement de la spécificité des
méganucléases pour des cibles d’ADN différentes. La mise au point de cette nouvelle plateforme
technologique a permis à la société de passer à un modèle de développement de produits reposant sur
de nouvelles méganucléases et la vente de MRS depuis 2006. Les MRS fabriqués par Cellectis sont et
seront vendus à des clients industriels qui les mettront en œuvre dans les quatre principaux marchés
que Cellectis a choisi de viser :
• La santé / méganucléases thérapeutiques – le domaine d’intervention le plus important de Cellectis
où chaque nouvelle méganucléase produite agit soit pour corriger un gène déficient pour soigner
la maladie et non en traiter ses effets, soit pour supprimer de l’ADN qui perturbe le bon fonctionnement
de la cellule comme l’ADN du génome de certains virus. Les méganucléases permettent de soigner
des maladies pour lesquelles les approches thérapeutiques traditionnelles apportent des solutions
partielles ou inadaptées. De plus, elles peuvent être utilisées pour induire une cassure dans une cible
ADN, modifier l’information génétique à cet endroit précis pour inactiver un élément génétique et
induire un effet thérapeutique. L’approche de Cellectis est de cibler la cause génétique des maladies et
de les traiter de manière «chirurgicale». C’est une approche tout à fait innovante et révolutionnaire.
A titre d’exemple Cellectis développe actuellement des MRS ciblant les déficits combinés immunitaires
sévères (SCID) dont un en collaboration avec le Pr. Alain Fischer de l’hôpital Necker depuis 2005 pour
le traitement des «enfants bulles» (X-SCID). Des produits novateurs sont en cours de développement
comme par exemple des antiviraux touchant l’hépatite B ou des produits pour la transplantation de
cellules ou d’organes.
• L’agriculture biotechnologique – marché évalué à 8 milliards de dollars en 2007 – les méganucléases
qui permettent d’éviter l’insertion d’un gène étranger dans les végétaux et peuvent par exemple
supprimer un élément allergique sont d’un intérêt capital. Des opportunités très attractives se
présentent actuellement à Cellectis tant dans le domaine alimentaire que dans celui, émergent,
de la bio-énergie et des bio-fuels.
• La production de biologiques – marché mondial estimé à 1,7 milliards de dollars pour 2007 –
La précision dans le ciblage et la simplicité d’utilisation sont deux atouts majeurs pour les applications
industrielles de la technologie de Cellectis. C’est un marché très compétitif avec des étapes coûteuses
et les MRS de Cellectis vont permettre d’améliorer le processus en apportant performance, prédictibilité
et stabilité. Ici, les MRS sont intégrées dans le processus industriel (modèle IT) et permettent une
intervention pouvant aller jusqu’à l’amélioration de la qualité intrinsèque du produit final.
• La recherche (réactifs de recherche) – un marché en constante demande d’innovations et qui fixe les
standards de l’industrie de demain. Ce marché, estimé en 2007 à 8 milliards d’euros a deux atouts
majeurs : sa rentabilité de court terme et sa propension à populariser l’usage de méganucléases au sein
des laboratoires académiques et industriels, afin de permettre à Cellectis de jeter les bases d’un standard
mondial de la programmation de l’ADN.
l Activités et marchés l 16
 EXCELLENCE.
IT‘S IN OuR DNA.
Investir sur la qualité et la performance
de nos produits et pérenniser notre
avance technologique par l‘accélération
de notre recherche collaborative sur des
applications très diverses.

l Cellectis Genome Engineering l Annual Report 2006 l Présentation de Cellectis l 17

 Sources de revenus

Aujourd’hui, Cellectis débute dans la commercialisation de ses propres produits, lesquels, à moyen
terme, génèreront la majeure partie de ses revenus. Cellectis détient un portefeuille de 18 méganucléases
à diverses étapes de développement. Ses efforts de R&D se concentrent sur le développement
de méganucleases nouvelles visant des marchés à fort potentiel comme celui des antiviraux
de nouvelle génération les maladies génétiques, certains cancers et enfin les produits destinés à la
greffe allogénique de tissus.

Les revenus des méganucléases se caractérisent par la signature d’une licence d’accès à la technologie
(« upfront ») ; de paiements annuels pour le maintien de la propriété intellectuelle (« annual fees ») ;
de paiements lors de franchissements de jalons techniques/développement (« milestones ») ; ainsi que
de paiements de redevances sur ventes de produits finis (« royalties »).

Bourse et communication financière

L’année 2007 a été marquée par l’introduction en bourse réussie de Cellectis sur le marché
Alternext de NYSE Euronext. Cellectis a déjà mis en place un programme régulier de communication
financière fondé sur les notions de transparence et de régularité de l’information à travers :

• Des communiqués de presse en français et en anglais.

• Des rencontres individuelles et collectives (lors de conférences financières, de road shows, de petits-
déjeuners, ou de conférences téléphoniques) en France et à l’étranger avec des analystes financiers,
des gérants de fonds, des actionnaires individuels (notamment lors du salon Actionnaria à Paris) et
des journalistes de la presse économique et financière.

• D’un site internet en français et en anglais avec toutes les informations corporate disponibles et une
rubrique dédiée à ses investisseurs.

Qualité, traçabilité et exigence sont à • D’une présentation corporate en français et en anglais.

la base de la recherche de Cellectis.

Structure du capital en 2007

Odysee Venture 6%

Fondateurs, Personnel & Dirigeants 19% 8%

LCF Rothschild 6%

AGF Private Equity 12% Institut Pasteur 5,5%

Bankinvest 16,5%
Kaminvest 12%

Flottant 23%

l Cellectis l Présentation Corporate 2007 l Sources de revenus et communication financière l 18

 VALuES.
IT‘S IN OuR DNA.
Cellectis a l‘ambition d‘apporter de
nouvelles générations d‘antiviraux qui
détruisent le génome ADN de certains
virus en les clivant de façon très spécifique.

l Cellectis Genome Engineering l Annual Report 2006 l Présentation de Cellectis l 19


L‘excellence de l‘esprit d‘équipe
et l‘adhésion au projet commun font
la force de Cellectis.
l Cellectis l Présentation Corporate 2007
Origines scientifiques
L’idée fondatrice de la Société vient du constat suivant : l’exploitation thérapeutique et industrielle des
données codées par les génomes des organismes vivants n’atteindra sa pleine puissance que lorsque l’on
saura précisément reprogrammer leur ADN de façon rationnelle, fine et précise. Cellectis conçoit
un système artificiel induisant la réparation naturelle de l’ADN, capable de réaliser un « couper-coller »
sur tout gène choisi a priori.
Cellectis est la première société au monde à exploiter, à des fins commerciales, une technologie
permettant d’intervenir in vivo, avec précision, sur l’ADN de génomes d’origines très diverses. Pour la
première fois, grâce à la technologie de Cellectis, on peut corriger un gène défectueux in situ, sans
endommager le reste du génome et sans adjonction de gènes étrangers souvent imprécis et mal tolérés.
L’ADN est un programme qui code les fonctions de tout organisme vivant. Les premiers travaux de
reprogrammation de cellules vivantes, initiés dans les années 1970, ont lancé la révolution des biotech-
nologies. Cependant, les grandes applications de cette découverte reposent encore à ce jour sur une
insertion au hasard de séquences d’ADN dans des génomes d’organismes vivants. C’est le cas de la
thérapie génique, de la production de protéines thérapeutiques telles l’insuline (premier médicament
biotechnologique approuvé en 1982), l’hormone de croissance ou l’érythropoïétine (EPO), protéine
thérapeutique la plus vendue au monde et ayant représenté près de 10 milliards de dollars de vente en
2005 (source : Arthur D. Little).
L’insertion aléatoire de matériel génétique est actuellement le principal obstacle au développement de
la thérapie génique et entraîne un certain nombre de conséquences néfastes. Depuis l’an 2000, l’ensem-
ble de la séquence du génome humain est connu et disponible. Depuis le franchissement de ce jalon
important dans l’histoire des avancées scientifiques de notre temps, une accélération du déchiffrage de
nombreux génomes a permis de mettre à disposition des chercheurs des données considérables sur les
programmes génétiques de nombreuses espèces, ainsi que la compréhension de nombreuses maladies.
Toutefois, l’accès à ces informations, pour les corriger ou les exploiter, reste encore très limité.
En 2000, le projet de la société consistait à élaborer un système artificiel pour induire la réparation
de l’ADN ou pour en modifier sa composition en associant deux technologies fondamentales de
l’Institut Pasteur : les méganucléases (protéines naturelles coupant l’ADN à un endroit unique et précis
dans une cellule vivante) et la recombinaison homologue (ou le ciblage d’une séquence du génome
par une autre en utilisant des séquences semblables en aval et en amont dudit gène).
Ces deux technologies historiques seules ne permettaient la réalisation que d’un nombre limité
d’applications – d’une part, la précision de ciblage de la recombinaison homologue, très peu efficace,
restait d’un usage limité à un nombre réduit d’espèces (souris, levure, mousse, etc...) et au monde
académique. D’autre part, les méganucléases naturelles, qui s’appuyaient sur une liste limitée de
protéines, ne pouvaient couper qu’un nombre réduit de cibles d’ADN prédéterminées et, par consé-
quent, les chances de se trouver dans une cible d’intérêt étaient quasi nulles. Cellectis a développé la
première technologie in vivo d’ingénierie rationnelle des génomes applicable à l’échelle industrielle
(MRS ou Meganuclease Recombination System/Systèmes de Recombinaison par Méganucléase), qui
permet de couper l’ADN à tout endroit souhaité et défini à l’avance dans un génome donné.
Six années ont été nécessaires à Cellectis pour passer du concept à la commercialisation de ses produits
et développer sa plate-forme sur une technologie propriétaire.
Aujourd’hui, Cellectis a une position dominante au plan international en ingénierie rationnelle du
génome, de part son portefeuille produit diversifié et en augmentation constante, soutenue par une
technologie toujours à la pointe et validée par de nombreuses publications scientifiques (4 en 2007),
ainsi qu’une stratégie optimale en propriété intellectuelle : 8 nouveaux brevets délivrés et 44 nouvelles
demandes déposées en la seule année 2007 pour un portefeuille portant sur 30 familles de brevets.
l Origines scientifiques l 20
 Portefeuille produits

Le portefeuille de méganucléases thérapeutiques comporte des produits de preuve de concept pour

traiter des maladies orphelines. Ces produits ont été sélectionnés car ils sont susceptibles d‘apporter
des solutions à des affections sans solution thérapeutique satisfaisante pour les malades. En outre,
ils offrent la possibilité de traiter les cellules cibles hors du corps du patient (traitement ex vivo) pour
faciliter l‘accès du MRS au gène et vérifier l‘exactitude de la réparation de l‘ADN post-chirurgie
génomique. Ces produits permettront le franchissement des premiers jalons dans l‘application des
méganucléases thérapeutiques pour des maladies touchant un plus grand nombre de patients.
Cellectis développe des produits pour soigner certaines anémies héréditaires (anémie falciforme et
thalassémies), les infections latentes par des virus à ADN persistant (hépatite B), des produits contre
certaines formes de cancers et des produits qui permettent de reprogrammer l‘ADN d‘un greffon
pour réduire son incompatibilité avec le receveur.

En agriculture biotechnologique, les méganucléases suppriment le côté aléatoire de la transgénèse et

respecte l‘intégrité des génomes. De nombreuses méganucléases peuvent êtres conçues et vendues
pour une même espèce de plante. Chacun de ces produits, par son application, contribue à améliorer
un trait agronomique spécifique de la plante : capacité à être digérée, utilisation pour la fabrication
de biocarburant et dégradation de la biomasse résultante, réduction de la sensibilité à divers traite-
ments industriels pour la transformation en produit alimentaire, fabrication de biofibres nouvelles et
enfin respect des contraintes liées à l‘épuisement de ressources naturelles et à la pollution.

Les méganucléases permettent de reprogrammer un génome de façon maîtrisée et rationnelle.

Par conséquent, ce sont des outils très utiles pour les chercheurs qui travaillent sur la compréhension
du fonctionnement des gènes et des génomes. Cellectis développe pour les chercheurs en biologie
des kits de recherche prêts à l‘utilisation pour des opérations de modifications génétiques précises.

La production industrielle de protéines thérapeutiques utilise les méganucléases de Cellectis pour

le développement de certaines de leurs lignées de production de biologiques. Leur utilisation
représente une économie de temps et de coût dans la mise en place d‘un procédé de production d‘une
protéine thérapeutique. Cellectis commercialise ces produits auprès de sociétés pharmaceutiques et
de biotechnologies.

Dévéloppement Thérapeutique 2007 2008 2009 2010

Maladies Génétiques Cancer de la Peau
Immunodéficience
Anémie Falciforme
Antiviraux Hépatite B
Autres affections Transplantation Allogenique
Cancer
Conception du MRS Test In Vitro Phase Pré Clinique Phase Clinique I/II

Autres dévéloppements 2007 2008 2009 2010

Kits de Recherches Ciblage CHO
Constitutif Souris
Constitutif CHO
Constitutif Humain
BioProduction Métabolisme CHO
Plantes Cibles confidentielles
Conception du MRS Test In Vitro Ventes de Licences

ll Cellectis l Présentation
CellectisGenome CorporateAnnual
Engineering l Portefeuille
l 2007 Report 2006 l produits l de Cellectis
Présentation l 21 21
 Propriété intellectuelle

Au 31 décembre 2007, Cellectis disposait de droits sur 30 familles de brevets, représentant 35 brevets
accordés (dont 33 appartiennent à l’Institut Pasteur) et 113 en cours d’examen (dont 64 déposés par
l’Institut Pasteur et 49 par Cellectis), en France et à l’étranger. Le tableau ci-dessous détaille le nombre
de brevets accordés ainsi que les demandes, par pays ou zone géographique :

Familles de Brevets Brevets délivrés Demandes en

et Demandes de Brevets cours d’examen

Pays 31 décembre 2007 ∆ 2006 31 décembre 2007 ∆ 2006

Recombinaison homologue Europe 34 +2 2 =

États-Unis 3 = 3 +1

Autres 2
5 = 0 =

Méganucléases Europe 1 +1 10(25) 1

+2

États-Unis 18 +5 18(26) 1
+9

Autres3 0 = 57 +23

Autres Europe 24 = 5 +2

États-Unis 1 = 11 +7

Autres 3
2 = 7 =

Total pour 30 familles de brevets 35 +8 113(51) 1

+44

1 : valeur incluant les Demandes Internationales PCT désignant notamment l’Europe et les USA.
2 : Brevets au Japon et à Singapour.
3 : Demandes de Brevet au Canada, Australie, Japon, Chine et Demandes Internationales PCT.
4 : valeur incluant les brevets européens et français issus des Demandes prioritaires françaises.

En juin 2007, l’Office Européen des Brevets («OEB») rejette le recours formé par la Johns Hopkins
University concernant son brevet européen, licencié à Sangamo Biosciences, Inc. («Sangamo»), brevet qui
avait été révoqué en mai 2005 par la Division d’Opposition. Le brevet No EP 0682699 intitulé « Domaines
Fonctionnels dans l’Endonucléase de Restriction de Flavobacterium Okeanokoites » avait été délivré le
7 mai 2003 et constituait la base des brevets en phase régionale en France, en Allemagne, en Grande-
Bretagne, en Irlande et en Suisse. Les revendications accordées du brevet couvraient les technologies
utilisées dans le cadre des programmes de Sangamo dans le domaine de la recombinaison ciblée et de la
correction génique.

Cellectis a choisi de protéger sa technologie, ses produits, son savoir-faire et ses données en mettant
en place également des accords de confidentialité avec ses collaborateurs, ses consultants, certains de ses
sous-traitants, ses partenaires et ses licenciés.

l Cellectis l Présentation Corporate 2007 l Propriété intellectuelle l 22

 Stratégie et modèle éCONOMIQUE

Pour réaliser son ambition de devenir le leader mondial de l’ingénierie génomique et la référence
mondiale de la chirurgie génomique, Cellectis a défini et mis en place une stratégie claire qui consiste
à concentrer ses efforts dans son domaine d’excellence : la conception et la fabrication de systèmes
de programmation génomique.

Cellectis met en œuvre sa stratégie à travers :

• la signature d’accords commerciaux dans ses quatre domaines d’application ciblés :

la santé, la biotechnologie, l’agronomie et la recherche.

• la diffusion active de sa technologie comme outil de recherche auprès des plus grands laboratoires
académiques et industriels.

• priorité mise sur les méganucléases thérapeutiques pour soigner les maladies génétiques orphelines,
traiter certaines infections virales, développer de nouveaux produits contre le cancer et enfin des
produits pour la greffe allogénique.

• la commercialisation de produits de recherche vendus sur étagère en priorité (produits conçus et

fabriqués par Cellectis et commercialisés à large échelle vers des laboratoires de recherche industriels et
académiques pour générer des revenus récurrents de court terme).

• le renforcement des partenariats privilégiés en agronomie mis en place avec certains grands comptes.

• et enfin la pérennisation de sa position concurrentielle en continuant d’enrichir son portefeuille de

brevets et en augmentant son avance technologique par son savoir faire.

Les fonds que la société a levés lors de son introduction en bourse en février 2007 sont et seront utilisés pour :

• accroître la capacité de production actuelle et atteindre une production annuelle de 20 MRS d’ici 2008.

• renforcer les équipes de vente, marketing et communication.

• intensifier ses efforts de recherche et développement portant à la fois sur l’ingénierie des méganucléases,
la recombinaison homologue et sur le processus de fabrication de MRS.

Objectifs 2007 et bornes atteintes au 31 décembre 2007

Objectif à l’IPO délivrés au 31 décembre 2007

Contrats 5 à 7 en agro et bioproduction 5 - Celonic (avril), GSK (mai), Servier (octobre),
Trans Genic (octobre) et Bayer (novembre)
Livraison MRS 1 à 3 MRS livrés 1 MRS à Bayer CropSciences
1 MRS thérapeutique livré 3 - Un premier MRS thérapeutique à l’équipe
du Pr. A. Fischer (INSERM/Hôpital Necker), un
deuxième à l’équipe du Pr A. Sarasin (CNRS/IGR)
et un troisième à l’équipe du Pr. L. Notarangello
Boston Children’s Hospital (USA).

Résultats Résultats de réparation de gènes dans des Résultats positifs sur cellules de patients (XPC)
cellules de patients
MRS conçus 10 MRS 18 MRS au total en portefeuille

l Cellectis l Présentation Corporate 2007 l Stratégie et modèle économique l 23

 Équipe dirigeante Gouvernance au 31 décembre 2007
André Choulika, docteur ès sciences, fondateur de
la Société. Il est l’un des pionniers pour l’analyse
et les applications des méganucléases visant à
modifier les génomes complexes. Il a obtenu son
doctorat en science dans le domaine de la virologie
moléculaire à l’université Pierre et Marie Curie -
Paris VI, avant d’entreprendre des études post-
Dr. André Choulika,
Directeur Général
David Sourdive, docteur és sciences, co-fondateur
de la Société. Après un doctorat à l’Institut
Pasteur en virologie moléculaire, il rejoint un des
laboratoires de pointe en immunologie anti-
virale à l’université d’Emory (Atlanta, Etats-Unis
d’Amérique) où ses travaux portent sur la
Dr. David Sourdive,
Vice Président, Corporate Development
Marc Le Bozec, était jusqu’en septembre 2006
directeur des opérations de la société Alfact
Innovation (Paris, France). Il dispose de plus de
10 ans d’expérience dans le secteur des biotechno-
logies en tant que consultant (Arthur D. Little,
Marc Le Bozec,
Directeur Financier
Frédéric Pâques, docteur ès sciences, a rejoint la
Société en octobre 2001 en tant que directeur de
la recherche et développement puis comme
directeur scientifique depuis juin 2002. Frédéric
Pâques est un expert renommé mondialement
dans le domaine des mécanismes de la recombinai-
son de l’ADN. Ancien élève de l’Ecole Normale
Dr. Fréderic Pâques,
Directeur Scientifique
Conseil d’administration
Christian Policard, PhD, Président
Martin Bitsch, M.D., Administrateur représentant KamInvest
André Choulika, PhD, Administrateur
Alain Godard, Administrateur indépendant
Raffy Kazandjian, Administrateur indépendant
Thierry Laugel, PhD, Administrateur représentant AGF
Richard C. Mulligan, PhD, Administrateur indépendant
David Sourdive, PhD, Administrateur
Thomas Tscherning, M.D., Administrateur représentant BankInvest
Alain Guédon, Censeur représentant l’Institut Pasteur
l Cellectis l Présentation Corporate 2007 l Gouvernance l 24
doctorales dans le département de génétique à la
Harvard Medical School. Au sein du service de
médecine moléculaire du Boston Children’s
Hospital, il a mis au point les premières approches
de l’application des méganucléases à la thérapeu-
tique humaine. Il a également suivi une formation
d’HEC (Challenge +).
mémoire immunologique. Avant de fonder la
Société, il a été directeur du laboratoire des
biotechnologies du Centre d’études du Bouchet /
DGA (Ministère de la défense) entre 1998 et
1999. Polytechnicien, il a également suivi une
formation d’HEC (Challenge +).
bureau de Paris), puis comme fondateur et
président directeur général de la société BioProtein
Technologies (France), une entreprise dédiée à la
production de protéines recombinantes dans le lait
d’animaux transgéniques. Il est diplômé d’HEC.
Supérieure (Ulm), il a passé son doctorat à
l’université de Paris XI en 1994 avant d’entreprendre
des études post-doctorales à l’université Brandeis
(Waltham, Ma, Etats-Unis d’Amérique) où il a
mené des travaux majeurs sur la recombinaison de
l’ADN dans la levure. A son retour en France, il a
travaillé comme chercheur au CNRS.
Conseil scientifique
François Jacob, M.D.,
Président d’honneur et Prix Nobel
Rodney J. Rothstein, PhD,
Président
Frederick W. Alt, PhD
Bernard Dujon, PhD
Alain Fischer, M.D.
James E. Haber, PhD
Denis Pompon, PhD
Luis Serrano, PhD
 CREATIVITY.
IT‘S IN OuR DNA.
une équipe motivée et forte de
48 collaborateurs dont 17 docteurs ès
science. un management expérimenté
et complémentaire. une forte adhésion
au projet d‘entreprise.

l l Présentation
Cellectis Genome Engineering l Présentation
Corporate 2007 l Présentation
Corporate 2006 l Présentation
de Cellectis l de Cellectis l 25
 Principaux éléments financiers

Une augmentation des charges Compte de résultat

d’exploitation (+27%) parallèle Pour l’exercice 2007 selon les normes IFRS incluant une comparaison avec l’exercice 2006.
à celles des ventes (+22%). 2007 2006
Montants exprimés en milliers d’euros 12 mois 12 mois Variation

Chiffre d‘affaires 1 448 1 188 22%

Autres produits de l‘activité 1 365 1 291
Produits des activités ordinaires 2 813 2 480 13%
Achats consommés (1 013) (577) 76%
Charges de personnel (2 934) (2 226) 32%
Autres charges opérationelles (3 433) (2 975) 15%
Impôts et taxes (185) (197) -6%
Dotations aux amortissements nettes des reprises (383) (390) -2%
Dotations aux provisions nettes des reprises (202) (28) 616%
Résultat opérationnel courant (5 337) (3 914) 36%
Autres produits et charges opérationnels non courants 5 (0)
Résultat opérationnel (5 332) (3 914) 36%
Produits de trésorerie et d’équivalents de trésorerie 573 174 229%
Coût de l‘endettement financier brut (20) (213) -91%
Coût de l‘endettement financier net 553 (38)
Autres produits et charges financiers (2) (2) v
Impôts sur le résultat 1793 1 531 17%
Résultat net des activités poursuivies (2 988) (2 423) 23%
Résultat net (2 988) (2 423) 23%

Produits des activités ordinaires

Le chiffre d’affaires croît de 22% entre 2006 et 2007 grâce :
• Au premier contrat de fourniture d’une mégnucléase à spécificité modifiée (Bayer Biosciences),
suivi d’une seconde commande.
• A la signature de quatre nouveaux contrats (Celonic, GSK, Servier et Trans Genic).

Les autres produits sont essentiellement liés à des financements publics, qui croissent de 5% sur la même
période (notamment grâce à deux aides de l’Union Européenne). En 2007, Cellectis a obtenu une nouvelle
aide de l’Agence Nationale de la Recherche (ANR), dont les effets seront visibles à partir de 2008.

Sur un an, les produits des activités ordinaires s’accroissent de 13% (de 2,48 millions d’euros en 2006
à 2,81 millions d’euros en 2007).

l Cellectis l Présentation Corporate 2007 l Principaux éléments financiers l 26

 Charges opérationnelles
Les achats consommés sont essentiellement constitués de consommables de laboratoire utilisés dans
les activités de recherche. Ils augmentent significativement entre 2006 et 2007, principalement en
raison d’une augmentation de 127% des achats de produits chimiques (passant de 196k en 2006
à 445k en 2007). Plus généralement, Cellectis réalise de plus en plus de travaux en aval de la
plate-forme de production de méganucléases (à titre illustratif, des travaux de biologie cellulaire visant
à confirmer l’innocuité et l’efficacité des méganucléases) expliquant la hausse de 464k des achats
consommés de 2006 à 2007.

Les charges liées au personnel augmentent de plus de 30% sur la période considérée, en raison
de l’augmentation du nombre de salariés (voir plus haut) essentiellement recrutés en R&D.

Les autres charges augmentent de plus de 15% entre 2006 et 2007 (passant de 2,975 millions
d’euros en 2006 à 3,433 millions d’euros en 2007). Les écarts les plus significatifs portent sur :

1. La mise en place d’un plan systématique de leasing de gros équipements de laboratoire portant
sur un montant total d’1,5 million d’euros.

2. Une augmentation de 96% des charges locatives (passant de 287k en 2006 à 567k en 2007)
liée à l’application du loyer normal (après une période incluant des dégrèvements du bailleur) et à la
location de surfaces supplémentaires.

3. Un accroissement de l’appel à la sous-traitance lié à une augmentation de l’activité de R&D

(+21k pour Millegen, passant de 348k en 2006 à 369k en 2007 ; 29k facturés par APPLERA,
sous-traitance initiée en 2007).

4. Les redevances dues à l’Institut Pasteur progressent moins rapidement que le chiffre d’affaires
(+7% vs. +22%) car le taux applicable aux ventes de la technologie propre à Cellectis est inférieur à
celui applicable aux revenus de sous-licence de la technologie initiale de l’Institut Pasteur.

5. Les frais de mission ont augmenté de 45k entre 2006 et 2007 en raison de l’intense activité commerciale.

Parallèlement, certaines lignes de dépenses reculent comme c’est le cas pour les frais de publicité,
qui se sont contractés de 100k€ entre 2006 et 2007. En effet, l’essentiel des frais de publicité enregistrés
en 2006 sont relatifs à l’introduction en bourse.

Les provisions augmentent de 175k, essentiellement en raison de la dépréciation de travaux

d’aménagement des laboratoires actuellement occupés par Cellectis (pour un montant total de l’ordre
de 200k€). En effet, Cellectis a signé fin 2007 un nouveau bail entraînant courant 2008 la libération
des locaux actuellement occupés, sans possibilité de récupération des montants immobilisés.

l Cellectis l Présentation Corporate 2007 l Principaux éléments financiers l 27

 Bilan
Selon les normes IFRS pour l’exercice 2007 incluant une comparaison avec l’exercice 2006.

Montants exprimés en milliers d’euros 31 décembre 2007 31 décembre 2006 Variation

Actif
Immobilistions incorporelles nettes 9 17 -47%
Valeurs brutes 2 622 3 047 -14%
Amortissements et pertes de valeur (1 607) (1 260) 28%
Immobilisations corporelles nettes 1 015 1 787 -43%
Actifs financiers non courants 68 68 -0%
Actifs d‘impôts différés 6 550 4 985 31%
Total des actifs non courants 7 642 6 857 11%
Stocks 119 155 -23%
Clients et comptes rattachés 434 685 37%
Actifs d‘impôts exigibles 2 314 2 132 9%
Autres actifs courants 1 244 920 35%
Trésorerie et équivalents de trésorerie 25 197 4 971 407%
Total des actifs courants 29 308 8 864 231%
Total de l‘actif 36 950 15 721 135%
Passif v
Capital social 461 254
Primes et réserves 32 392 6 240 419%
Résultat de l’exercice (2 988) (2 423) 23%
Total des capitaux propres 29 865 4 071 634%
Provisions pour engagments envers les salariés 26 20
Autres passifs financiers 1 446 6 460 -78%
Total des passifs non courants 1 472 6 480 -77%
Provisions pour risques et charges 69 69 0%
Fournisseurs et comptes rattachés 4 558 4 412 3%
Autres passifs courants 986 690 43%
Total des passifs courants 5 613 5 171 99%
Total du passif 36 950 15 721 135%

Actif
Les immobilisations corporelles nettes décroissent de plus de 40% entre fin 2006 et fin 2007, principale-
ment en raison (i) du « lease back » effectué sur des équipements de laboratoire pour un montant
de l’ordre de 300k et (ii) de la dépréciation du montant des travaux d’aménagement immobilisé (voir plus
haut) pour un total supérieur à 200k.

Les actifs d’impôts différés ont augmenté d’environ 1,5 million d’euros entre fin 2006 et fin 2007. Cet
écart important s’explique par le report à nouveau, dont la déductibilité n’est pas limitée dans le temps.

La trésorerie passe de 5 millions d’euros fin 2006 à plus de 25 millions d’euros fin 2007 grâce à
l’augmentation de capital effectuée à l’occasion de l’introduction en bourse en février 2007 (dont le
montant net était de l’ordre de 22,2 millions d’euros).

Passif
L’écart entre les fonds propres à fin 2006 et ceux à fin 2007 est le résultat, pour l’essentiel,
de l’augmentation de capital effectuée à l’occasion de l’introduction en bourse.

Les autres passifs financiers se contractent de 5 millions d‘euros sur la même période, principalement
du fait du remboursement des obligations remboursables en actions émises en mai 2005, remboursement
effectué à l’occasion de l’introduction en bourse au prix de 10,25€ par action (cours d’introduction).

l Cellectis l Présentation Corporate 2007 l Principaux éléments financiers l 28

 Flux de trésorerie
Selon les normes IFRS pour l’exercice 2007 incluant une comparaison avec l’exercice 2006.

Montants exprimés en milliers d’euros 2007 2006

Résultat net (2 988) (2 423)

Amortissements et provisions 585 419
Variation de la juste valeur des instuments financiers (11) 203
Résultat des cessions d‘actifs immobilisés (319)
Variation des impôts différés (1 593) (1 318)
Charges liées aux paiements sur base d‘actions 241 51
Marge brute d‘autofinancement avant variation du besoin en fonds de roulement (4 086) (3 068)
(Augmentation) / diminution des créances clients et comptes rattachés 252 687
(Diminution) / augmentation des dettes fournisseurs et comptes rattachés 145 965
Variation de la dette nette d‘impôts sur les résultats (182) (732)
Variation nette des autres actifs et passifs liés à l‘activité 14 (243)
Variation du besoin en fonds de roulement lié à l‘activité 230 677
Flux net de trésorerie lié A l‘Activité (3 857) (2 391)
Acquisitions d‘immobilisations incorporelles (6)
Acquisitions d‘immobilisations corporelles (95) v (479)
Produits de cession d‘actifs corporels et incorporels 319
Flux net de trésorerie lié aux opérations d‘investissement 217 (479)
Augmentation des passifs financiers à long terme 550 200
Remboursements de passifs financiers à long terme (5 410) (36)
Encaissements provenants de l‘émission d‘instruments de capitaux propres 28 724 26
Flux net de trésorerie lié aux opérations de financement 23 864 191

Variation de la trésorerie 20 225 (2 679)

Trésorerie nette à l‘ouverture 4 971 7 650
Trésorerie nette à la clôture 25 197 4 971
Augmentation (Diminution) de la trésorerie 20 225 (2 679)

L’augmentation de la trésorerie au cours de l’exercice 2007 est de l’ordre de 20 millions d’euros

correspondant d‘une part à une utilisation de l’ordre de 4 millions d’euros liée à l’activité de Cellectis
(incluant la perte nette de l’année de l’ordre de 3 millions d’euros) et d‘autre part à un accroissement
de l’ordre de 24 millions d’euros essentiellement dû au montant de l’augmentation de capital effectuée
lors de l’introduction en bourse (montant brut de 24,4 millions d’euros).

l Cellectis l Présentation Corporate 2007 l Principaux éléments financiers l 29

 © Cellectis SA, 2008

Rédaction :
Caroline Carmagnol (AlizeRP) et Céline Toral

Couverture :
Ramon Martinez (Compression et photographie)

Photos :
Karim Daher / Cédric Porchez (portraits page 24)

Conception Graphique :
Valentina Herrmann / Reto Zollinger

Impression :
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