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G u
: a ligação pepitídica é quebrada e uma ligação éster é formada
entre o carbono de carbonila e a enzima.
G u
: a ligação éster é hidrolisada e a enzima não-acilada é
regenerada.
As enzimas serino
proteases empregam a catálise ácido
básica geral e a catálise
covalente para a sua ação. As serino
proteases são um grupo de enzimas proteolíticas
que incluem a ÷
, e são assim
chamadas por utilizar um único resíduo serina ativada no sítio ativo. As
serino
proteases utilizam o grupo
CH2
H da serina como um nucleof
lico para
hidrolisar cataliticamente ligações pept
dicas. Formam um intermediário covalente
acil
enzima, no qual o grupo carboxila do substrato é esterificado com a hidroxila da
serina 195 (catálise covalente). caráter nucleófilo da
H é bastante acentuado pela
histidina 57, que recebe um próton da serina (catálise ácido-básica geral). A histidina
resultante com carga positiva é estabilizada pela interação eletrostática com a carga
negativa do aspartato 102. A segunda etapa, o intermediário acil
enzima é deacilado
pelo reverso das etapas anteriores.
ü ü
centro ativo de uma enzima é a região que se liga aos substratos (e ao grupamento
prostético, se houver algum), e contém os radicais de aminoácidos que participam
diretamente na geração e quebra de ligações. Estes radicais são chamados de
grupamentos catalíticos. Embora as enzimas difiram amplamente em estrutura,
especificidade e modo de catálise, podem ser feitas algumas generalizações referentes
aos seus centros ativos:
1. centro ativo ocupa uma parte relativamente pequena do volume total de uma
enzima. A maioria dos radicais de aminoácidos em uma enzima não está em contato
com o substratos. Praticamente todas as enzimas são feitas de mais de 100 aminoácidos,
o que lhes dá uma massa maior do que 10 KDa e um diâmetro de mais de 25Å.
reflete a necessidade da superestrutura ter os grupos reativos
posicionados de modo correto e de manter o local ativo formado. u seja, justifica-se
pela manutenção de uma estrutura muito precisa com reentrâncias de forma apropriada e
grupos reativos localizados em posições exatas para a ocorrência da catálise.
2. centro ativo é uma entidade tridimensional formada por grupamentos que vêm de
diferentes partes da seqüência linear podem interagir mais fortemente do que os
adjacentes na seqüência.