TECNOLOGICO DE ESTUDIOS SUPERIORES TIANGUISTENCO Divicin de Ingeniera Mecanica.

Carrera: Ingeniera Ambiental

Asignatura: Bioqumica

Docente: Ing. Quim Ninive Rosas Gutierrez

Alumna: Susana Trejo Salcedo

Grupo: 5301

Semestre: Septiembre - Febrero

Unidad 1 Fundamentos de la Bioqumica

1.1. Fundamentos.

La Bioqumica es una ciencia que estudia la composicin qumica de los seres vivos, especialmente las protenas, carbohidratos, lpidos y cidos nucleicos, adems de otras pequeas molculas presentes en las clulas y las reacciones qumicas que sufren estos compuestos (metabolismo) que les permiten obtener energa (catabolismo) y generar biomolculas propias (anabolismo). La bioqumica se basa en el concepto de que todo ser vivo contiene carbono y en general las molculas biolgicas estn compuestas principalmente de carbono, hidrgeno, oxgeno, nitrgeno, fsforo y azufre. Es la ciencia que estudia la base qumica de la vida: las molculas que componen las clulas y los tejidos, que catalizan las reacciones qumicas del metabolismo celular como la digestin, la fotosntesis y la inmunidad, entre otras muchas cosas.

1.1.1. Antecedentes. La Bioqumica es una ciencia que estudia la composicin qumica de los seres vivos, especialmente las protenas, carbohidratos, lpidos y cidos nucleicos, adems de otras pequeas molculas presentes en las clulas y las reacciones qumicas que sufren estos compuestos (metabolismo) que les permiten obtener energa (catabolismo) y generar biomolculas propias (anabolismo). La bioqumica se basa en el concepto de que todo ser vivo contiene carbono y en general las molculas biolgicas estn compuestas principalmente de carbono, hidrgeno, oxgeno, nitrgeno, fsforo y azufre. Es la ciencia que estudia la base qumica de la vida: las molculas que componen las clulas y los tejidos, que catalizan las reacciones qumicas del metabolismo celular como la digestin, la fotosntesis y la inmunidad, entre otras muchas cosas. En 1833, Anselme Payen asla la primera enzima, la diastasa, aunque se desconoca su funcionalidad y el mecanismo subyacente. En 1840, Justus von Liebig, mejor las tcnicas de anlisis qumico orgnico y concluy que las plantas necesitaban nitrgeno y dixido de carbono en su alimentacin. A mediados del siglo XIX, Louis Pasteur, demostr los fenmenos de isomera qumica existente entre las molculas de cido tartrico provenientes de los seres vivos y las sintetizadas qumicamente en el laboratorio. Tambin estudi el fenmeno de la fermentacin y descubri que intervenan ciertas levaduras, y por tanto no era exclusivamente un fenmeno qumico como se haba defendido hasta ahora (entre ellos el propio Liebig), as Pasteur escribi: "la fermentacin del alcohol es un acto relacionado con la vida y la organizacin de las clulas de las levaduras, y no con la muerte y la putrefaccin de las clulas" 1. Adems desarroll un mtodo de esterilizacin de la leche, el vino y la cerveza (pasteurizacin) y contribuy enormemente a refutar la idea de la generacin espontnea de los seres vivos. En 1878 el fisilogo Wilhelm Khne acu el trmino enzima para referirse a los componentes biolgicos desconocidos que producan la fermentacin. La palabra enzima fue usada despus para referirse a sustancias inertes tales como la pepsina.
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En 1869 se descubre la nuclena y se observa que es una sustancia muy rica en fsforo. Dos aos ms tarde, Albrecht Kossel concluye que la nuclena es rica en protenas y contiene las bases pricas Adenina y Guanina y las pirimidnicas Citosina y Timina. En 1889 se asla los dos componentes mayoritarios de la nuclena:-Protenas (70%) -Sustancia de carcter cido: cido nucleicos (30%) En 1897 Eduard Buchner comenz a estudiar la capacidad de los extractos de levadura para fermentar azcar a pesar de la ausencia de clulas vivientes de levadura. En una serie de experimentos en la Universidad Humboldt de Berln, encontr que el azcar era fermentado inclusive cuando no haba elementos vivos en los cultivos de clulas de levaduras 2. Llam a la enzima que causa la fermentacin de la sacarosa, zimasa. Al demostrar que las enzimas podran funcionar fuera de una clula viva, el siguiente paso fue demostrar cul era la naturaleza bioqumica de esos biocatalizadores. El debate fue extenso, muchos como el bioqumico alemn Richard Willsttter discernan en que la protena fuera el catalizador enzimtico, hasta que en 1926, James B. Sumner demostr que la enzima ureasa era una protena pura y la cristaliz. La conclusin de que las protenas puras podan ser enzimas fue definitivamente probada en torno a 1930 por John Howard Northrop y Wendell Meredith Stanley, quienes trabajaron con diversas enzimas digestivas como la pepsina, la tripsina y la quimotripsina. En 1903, Mijal Tswett, incia los estudios de cromatografa para separacin de pigmentos. En torno a 1915 Gustav Embden y Otto Meyerhof realizan sus estudios sobre la glucolisis. En 1920 se descubre que en las clulas hay DNA y RNA y que difieren en el azcar que forma parte de su composicin: desoxirribosa o ribosa. El DNA reside en el ncleo. Unos aos ms tarde, se descubre que en los espermatozoides hay fundamentalmente DNA y protenas, y posteriormente Feulgen descubre que hay ADN en los cromosomas con su tincin especfica para este compuesto. En 1925 Theodor Svedberg demuestra que las protenas son macromolculas y desarrolla la tcnica de ultracentrifugacin analtica. En 1928, Alexander Fleming descubre la penicilina y desarrolla estudios sobre la lisozima. Richard Willsttter (entorno 1910) estudia la clorofila y comprueba la similitud que hay con la hemoglobina. Posteriormente Hans Fischer en torno a 1930, investiga la qumica de las porfirinas de las que derivan la clorofila o el grupo porfirnco de la hemoglobina. Consigui sintetizar hemina y bilirrubina. Paralelamente Heinrich Otto Wieland formula teoras sobre las deshidrogenaciones y explica la constitucin de muchos otros productos de naturaleza compleja, como la pteridina, las hormonas sexuales o los cidos biliares. En la dcada de 1940, Melvin Calvin concluye el estudio del ciclo de Calvin en la fotosntesis. En torno a 1945 Gerty Cori, Carl Cori, y Bernardo Houssay completan sus estudios sobre el Ciclo de Cori. En 1953 James Watson y Francis Crick, gracias a los estudios previos con cristalografa de rayos X de DNA de Rosalind Franklin y Maurice Wilkins, y los estudios de Erwin Chargaff sobre apareamiento de bases nitrogenadas, deducen la estructura de doble hlice del DNA. En 1957, Matthew Meselson y Franklin Stahl demuestran que la replicacin del DNA es semiconservativa.

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En la segunda mitad del siglo XX, comienza la autntica revolucin de la bioqumica y la biologa molecular moderna especialmente gracias al desarrollo de las tcnicas experimentales ms bsicas como la cromatografa, la centrifugacin, la electroforesis, las tcnicas radioisotpicas y la microscopa electrnica, y las ms complejas tcnicas como la cristalografa de rayos X, la resonancia magntica nuclear, la PCR (Kary Mullis), el desarrollo de la inmunotcnicas Desde 1950 a 1975 , se conocen en profundidad y detalle aspectos del metabolismo celular inimaginables hasta ahora (fosforilacin oxidativa (Peter Dennis Mitchell), ciclo de la urea y ciclo de Krebs (Hans Krebs), as como otras rutas metablicas), se produce toda una revolucin en el estudio de los genes y su expresin; se descifra el cdigo gentico (Francis Crick, Severo Ochoa, Har Gobind Khorana, Robert W. Holley y Marshall Warren Nirenberg), se descubren las enzimas de restriccin (finales de 1960, Werner Arber, Daniel Nathans y Hamilton Smith), la DNA ligasa (en 1972, Mertz y Davis) y finalmente en 1973 Stanley Cohen y Herbert Boyer producen el primer ser vivo recombinante, nace as la ingeniera gentica, convertida en una herramienta poderossima con la que se supera la frontera entre especies y con la que podemos obtener un beneficio hasta ahora impensable De 1975 hasta principios del siglo XXI, comienza a secuenciarse el DNA (Allan Maxam, Walter Gilbert y Frederick Sanger), comienzan a crearse las primeras industrias biotecnolgicas (Genentech), se aumenta la creacin de frmacos y vacunas ms eficaces, se eleva el inters por las inmunologa y las clulas madres y se descubre la enzima telomerasa (Elizabeth Blackburn y Carol Greider). En 1989 se utiliza la biorremedicacin a gran escala en el derrame del petrolero Exxon Valdez en Alaska. Se clonan los primeros seres vivos, se secuencia el DNA de decenas de especies y se publica el genoma completo del hombre (Craig Venter, Celera Genomics y Proyecto Genoma Humano), se resuelven decenas de miles de estructuras proteicas y se publican en PDB, as como genes, en GenBank. Comienza el desarrollo de la bioinformtica y la computacin de sistemas complejos, que se constituyen como herramientas muy poderosas en el estudio de los sistemas biolgicos. Se crea el primer cromosoma artificial y se logra la primera bacteria con genoma sinttico (2007, 2009, Craig Venter). Se fabrican las nucleasas de dedos de Zinc. Se inducen artificialmente clulas, que inicialmente no eran pluripotenciales, a clulas madre pluripotenciales (Shin'ya Yamanaka). Comienzan a darse los primeros pasos en terapia gnica.
1.1.2. Ciencias Auxiliares Entre las ramas fundamentales de la Bioqumica, que son aquellas donde se recogen y estudian los conceptos bsicos, podemos citar: y Biologa celular: (citologa) es una rea de la biologa que se dedica al estudio de la morfologa y fisiologa de las clulas procariotas y eucariotas. Trata de conocer los orgnulos celulares, su composicin bioqumica y su funcin en el contexto celular tanto en estados fisiolgicos como patolgicos. Es esencial en esta rea conocer los procesos intrnsecos a la vida celular durante el ciclo celular, como la nutricin, la respiracin, la sntesis de componentes, los mecanismos de defensa, la divisin celular y la muerte celular. Tambin se deben conocer los mecanismos de comunicacin de clulas (especialmente en organismos pluricelulares) o las uniones Pgina 4

intercelulares. Es un rea esencialmente de observacin y experimentacin en cultivos celulares, que, frecuentemente, tienen como objetivo la identificacin y separacin de poblaciones celulares y el reconocimiento de orgnulos celulares. Qumica orgnica: es un rea de la qumica que se encarga del estudio de los compuestos orgnicos, es decir, aquellos que tienen enlaces covalentes carbonocarbono o carbono-hidrgeno. Se trata de una ciencia ntimamente relacionada con la bioqumica, pues en la bioqumica la mayora de compuestos biolgicos participa el carbono. As deben saber estructura, conocimientos sobre enlace qumico, interacciones moleculares. Gentica molecular e ingeniera gentica: es un rea de la bioqumica y la biologa molecular que estudia los genes, su herencia y su expresin. Molecularmente, se dedica al estudio del DNA y del RNA principalmente, y utiliza herramientas y tcnicas potentes en su estudio, tales como la PCR y sus variantes, los secuenciadores masivos, los kits comerciales de extraccin de DNA y RNA, procesos de transcripcin-traduccin in vitro e in vivo, enzimas de restriccin, DNA ligasas. Inmunologa: rea de la biologa, la cual se interesa por la reaccin del organismo frente a otros organismos como las bacterias y virus. Todo esto tomando en cuenta la reaccin y funcionamiento del sistema inmune de los seres vivos. Es esencial en esta rea el desarrollo de los estudios de produccin y comportamiento de los anticuerpos. Virologa: rea de la biologa, que se dedica al estudio de los biosistemas ms elementales: los virus. Tanto en su clasificacin y reconocimiento, como en su funcionamiento y estructura molecular. Pretende reconocer dianas para la actuacin de posibles de frmacos y vacunas que eviten su directa o preventivamente su expansin. Farmacologa: rea de la bioqumica que estudia cmo afectan o benefician ciertas sustancias qumicas al funcionamiento celular en el organismo. Se pretende generar racionalmente sustancias menos invasivas y ms eficaces contra dianas biomoleculares concretas. En bioqumica es esencial una de sus rama, la enzimologa que estudia el comportamiento bioqumico de las enzimas (protenas) que son biocatalizadores. En este sentido, pretende conocer el comportamiento cintico qumico de ciertas reacciones metablicas, los mecanismos de catlisis y los procesos de actuacin de las enzimas, as como su modificacin. Enzimologa: rea de la bioqumica muy ligada a la farmacologa. Estudia el comportamiento de los catalizadores biolgicos o enzimas, como son algunas protenas y ciertos RNA catalticos. As se cuestiona los mecanismos de catlisis, los procesos de interaccin de las enzimas-sustraro, los estados de transicin catalticos, las actividades enzimticas, la cintica de la reaccin,... todo ello desde un punto de vista bioqumico. Estudia y trata de comprender los elementos esenciales del centro activo y de aquellos que no participan, as como los efectos catalticos que ocurren en la modificacin de dichos elementos; en este sentido, utilizan frecuentemente tcnicas como la mutagnesis dirigidas.

1.1.3. Actualidades
La Bioqumica y la Biologa Molecular es una de las reas ms vigorosas y productivas del desarrollo cientfico en la actualidad, con numerosas e importantes aplicaciones en diversas reas de gran inters social que van desde la Salud hasta la Alimentacin, el Medio Ambiente o la Produccin Industrial. Desde finales del siglo XX, la Bioqumica y la Biologa Molecular estn experimentando una profunda revolucin, asociada a la secuenciacin sistemtica del genoma, humano y de otros organismos, iniciando lo que se ha dado en llamar la era post-genmica. En el siglo XXI, los grandes retos estn situados en la conversin de toda la informacin disponible en un autntico y profundo conocimiento de la organizacin y funcin de los organismos vivos a escala celular y molecular, para, simultneamente, aplicar dicho Pgina 5

conocimiento al desarrollo de nuevas terapias, productos y servicios. El desarrollo de la denominada Biologa Molecular de Sistemas ser, sin duda, crucial para dicha conversin de la informacin en conocimiento, as como para sentar las bases de una mejor intervencin y manipulacin de los procesos moleculares en los organismos vivos. En este contexto, la Biomedicina Molecular, dirigida a avanzar en el conocimiento de los procesos moleculares responsables de la aparicin de enfermedades, constituye una de las reas de mayor proyeccin futura dentro del mbito de la Bioqumica y Biologa Molecular. 1.2. Bases molculares 1.2.1. Proteinas La palabra protena proviene del griego protos, que significa "lo primero o lo ms importante". Las protenas son los materiales que desempean un mayor nmero de funciones en las clulas de todos los seres vivos. Por un lado, forman parte de la estructura bsica de los tejidos (msculos, tendones, piel, uas, etc.) y, por otro, desempean funciones metablicas y reguladoras (asimilacin de nutrientes, transporte de oxgeno y de grasas en la sangre, inactivacin de materiales txicos o peligrosos, etc.). Tambin son los elementos que definen la identidad de cada ser vivo, ya que son la base de la estructura del cdigo gentico (ADN) y de los sistemas de reconocimiento de organismos extraos en el sistema inmunitario. Las protenas de todos los seres vivos estn determinadas mayoritariamente por su gentica (con excepcin de algunos pptidos antimicrobianos de sntesis no ribosomal), es decir, la informacin gentica determina en gran medida qu protenas tiene una clula, un tejido y un organismo. Las protenas se sintetizan dependiendo de cmo se encuentren regulados los genes que las codifican. Por lo tanto, son susceptibles a seales o factores externos. El conjunto de las protenas expresadas en una circunstancia determinada es denominado proteoma.

1.2.1.1.

Amonoacidos (estructura, clasificacion, propiedades, estereokimika y metodos de obtencion).

Qu es un aminoacido? Los aminocidos son biomolculas formadas por (C) Carbono, (H) Hidrogeno, (O) Oxgeno y (S) Azufre. Estos, son la nica fuente aprovechable de nitrgeno para el ser humano, adems son elementos fundamentales para la sntesis de las protenas, y son precursores de otros compuestos nitrogenados. Un aminocido es una molcula orgnica con un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxlico (-COOH; cido). Los aminocidos ms frecuentes y de mayor inters son aquellos que forman parte de las protenas. Dos aminocidos se combinan en una reaccin de condensacin que libera agua formando un enlace peptdico. Estos dos "residuos" aminoacdicos forman un dipptido. Si se une un tercer aminocido se forma un tripptido y as, sucesivamente, para formar un polipptido. Esta reaccin ocurre de manera natural en los ribosomas, tanto los que estn libres en el citosol como los asociados al retculo endoplasmtico.

Estructura general de un aminocido

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La estructura general de un aminocido se establece por la presencia de un carbono central alfa unido a: un grupo carboxilo (rojo en la figura), un grupo amino (verde), un hidrgeno (en negro) y la cadena lateral (azul), como se muetra en la figura 1:

Figura 1 estructura de un amino acido "R" representa la cadena lateral, especfica para cada aminocido. Tcnicamente hablando, se los denomina alfa-aminocidos, debido a que el grupo amino (NH2) se encuentra a un tomo de distancia del grupo carboxilo (COOH). Como dichos grupos funcionales poseen H en sus estructuras qumicas, son grupos susceptibles a los cambios de pH; por eso, al pH de la clula prcticamente ningn aminocido se encuentra de esa forma, sino que se encuentra ionizado.

Figura 2 Los cambios de un a.a. se puede ver con claridad en la figuara 2 que muestra cuando un a.a. se toma como cation, cuando se mantiene estable osease cuando esta neutro y tambien se observa cuando se encuetra como anion. y

Clasificacin

Dado que los aminocidos comunes en las protenas difieren entre si por la cadena lateral, su clasificacin obedece a las propiedades qumica de la cadena lateral, esta puede clasificarse segun su polaridad y/o carga a pH neutro, el tipo de estructura qumica, su reactividad y los elementos presentes y por su habilidad para formar enlaces de hidrgeno. La siguiente tabla presenta a los aminocidos y sus propiedades y en la pgina complementaria puede observarse su estructura tridimensional.

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Tabla 1 Estructura tridimencional de los aminoacidos.

Nombre Caracter de la cadena lateral aliftica aliftica aliftica aliftica aliftica aliftica aromtica heterocclo aromtico Nitrgeno armatico -OH fenlico tioeter Grupo reactivo polaridad Forma puentes de H no no no no no no no

Glicina Alanina Valina Leucina Isoleucina Prolina Fenilalanina

apolar apolar apolar apolar apolar apolar apolar

Triptofano

apolar

acepta

Tirosina

aromtica

apolar ionizable apolar polar ionizable polar sin carga polar sin carga polar sin carga polar sin carga polar ionizable polar ionizable polar ionizable polar ionizable

acepta y dona acepta acepta y dona acepta y dona acepta y dona acepta y dona acepta y dona acepta y dona acepta y dona acepta y dona acepta y dona

Metionina

aliftica

Cisteina

aliftica

tiol

Serina

aliftica

alcohol primario alcohol secundario

Treonina

aliftica

Asparagina

aliftica

amida

Glutamina

aliftica

amida

Asprtico

aliftica

cido carboxlco cido carboxlco

Glutmico

aliftica

Histidina

heterocclo aliftico

imidazol

Lisina

aliftica

amino

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 Segn las propiedades de su cadena

Figura 3 Otra forma de clasificar los aminocidos de acuerdo a su cadena lateral. Los aminocidos se clasifican habitualmente segn las propiedades de su cadena lateral: y Neutros polares, polares o hidrfilos : Serina (Ser, S), Treonina (Thr, T), Asparagina (Asn, N), Glutamina (Gln, Q) y Tirosina (Tyr, Y). y Neutros no polares, apolares o hidrfobos: Glicina (Gly, G), Alanina (Ala, A), Valina (Val, V), Leucina (Leu, L), Isoleucina (Ile, I), Cistena (Cys, C), Metionina (Met, M), Prolina (Pro, P), Fenilalanina (Phe, F) y Triptfano (Trp, W). y Con carga negativa, o cidos: cido asprtico (Asp, D) y cido glutmico (Glu, E). y Con carga positiva, o bsicos: Lisina (Lys, K), Arginina (Arg, R) e Histidina (His, H). y Aromticos: Fenilalanina (Phe, F), Tirosina (Tyr, Y) y Triptfano (Trp, W) (ya incluidos en los grupos neutros polares y neutros no polares).  Segn su obtencin A los aminocidos que necesitan ser ingeridos por el cuerpo se los llama esenciales; la carencia de estos aminocidos en la dieta limita el desarrollo del organismo, ya que no es posible reponer las clulas de los tejidos que mueren o crear tejidos nuevos, en el caso del crecimiento. Para el ser humano, los aminocidos esenciales son:
y y y y y y y y y y

Valina (Val) Leucina (Leu) Treonina (Thr) Lisina (Lys) Triptfano (Trp) Histidina (His) * Fenilalanina (Phe) Isoleucina (Ile) Arginina (Arg) * Metionina (Met)

A los aminocidos que pueden ser sintetizados por el cuerpo se los conoce como no esenciales y son:
y y

Alanina (Ala) Prolina (Pro) Pgina 9

y y y y y y y y

Glicina (Gly) Serina (Ser) Cistena (Cys) ** Asparagina (Asn) Glutamina (Gln) Tirosina (Tyr) ** cido asprtico (Asp) cido glutmico (Glu)

Estas clasificaciones varan segn la especie. Se han aislado cepas de bacterias con requerimientos diferenciales de cada tipo de aminocido. Los datos actuales en cuanto a nmero de aminocidos y de enzimas ARNt sintetasas se contradicen hasta el momento, puesto que se ha comprobado que existen 22 aminocidos distintos que intervienen en la composicin de las cadenas polipeptdicas y que las enzimas ARNt sintetasas no son siempre exclusivas para cada aminocido. El aminocido nmero 21 es la Selenocistena que aparece en eucariotas y procariotas y el nmero 22 la Pirrolisina, que aparece slo en arqueas (o arqueobacterias).

Propiedades

cido-bsicas: Comportamiento de cualquier aminocido cuando se ioniza. Cualquier aminocido puede comportarse como cido y como base, se denominan sustancias anfteras. Cuando una molcula presenta carga neta cero est en su punto isoelctrico. Si un aminocido tiene un punto isoelctrico de 6,1 su carga neta ser cero cuando el pH sea 6,1. Los aminocidos y las protenas se comportan como sustancias tampn. pticas: Todos los aminocidos excepto la glicina tienen el carbono alfa asimtrico, lo que les confiere actividad ptica; esto es, sus disoluciones desvan el plano de polarizacin cuando un rayo de luz polarizada las atraviesa. Si el desvo del plano de polarizacin es hacia la derecha (en sentido horario), el compuesto se denomina dextrgiro, mientras que si se desva a la izquierda (sentido antihorario) se denomina levgiro. Un aminocido puede en principio existir en sus dos formas enantiomricas (una dextrgira y otra levgira), pero en la naturaleza lo habitual es encontrar slo una de ellas. Estructuralmente, las dos posibles formas enantiomricas de cada aminocido se denominan configuracin D o L dependiendo de la orientacin relativa en el espacio de los 4 grupos distintos unidos al carbono alfa. El hecho de que sea dextrgiro no quiere decir que tenga configuracin D.Todos los aminoacidos proteicos son L-aminoacidos. Qumicas: Las que afectan al grupo carboxilo, como la descarboxilacin, etc Las que afectan al grupo amino, como la desaminacin. Las que afectan al grupo R.

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1.2.1.2.

Pptidos (estructura, nomenclatura, sintesis e importancia)

Los pptidos son un tipo de molculas formadas por la unin de varios aminocidos mediante enlaces peptdicos, o enlace triple con una conjugacion de ADN (cido desoxirribonucleico) Los pptidos, al igual que las protenas, estn presentes en la naturaleza y son responsables por un gran nmero de funciones, muchas de las cuales todava no se conocen. La unin de un bajo nmero de aminocidos da lugar a un pptido:
y y y

Oligopptido: menos de 10 aminocidos. Polipptido: ms de 10 aminocidos. Protena: ms de 100 aminocidos. Las protenas con una sola cadena polipeptdica se denominan protenas monomricas, mientras que las compuestas de ms de una cadena polipeptdica se conocen como protenas multimricas.

Los pptidos se diferencian de las protenas en que son ms pequeos (tienen menos de diez mil o doce mil Daltons) y que las protenas pueden estr formadas por la nin de varios polipptidos y a veces grupos prostticos. Un ejemplo de polipptido es la insulina, compuesta de 55 aminocidos y conocida como una hormona de acuerdo a la funcin que tiene en el organismo de los seres humanos. El enlace peptdico es un enlace covalente entre el grupo amino (NH2) de un aminocido y el grupo carboxilo (COOH) de otro aminocido. Los pptidos y las protenas estn formados por la unin de aminocidos mediante enlaces peptdicos. El enlace peptdico implica la prdida de una molcula de agua y la formacin de un enlace covalente CO-NH. Es, en realidad, un enlace amida sustituido. Podemos seguir aadiendo aminocidos al pptido, pero siempre en el extremo COOH terminal. Para nombrar el pptido se empieza por el NH2 terminal por acuerdo. Si el primer aminocido de nuestro pptido fuera alanina y el segundo serina tendramos el pptido alanil-serina. y Sintesis de Pptidos

El mtodo ms sencillo para sintetizar pptidos es la polimerizacion de un aminocido. El homopolmero resultante es una mezcla de pptidos que se diferencian en la longitud de la cadena. Estos homopolmeros no se encuentran en la naturaleza, pero los de origen sinttico han servido para comprender algunas de las propiedades fsicas y espectrales de las protenas. El primer producto que resulta de la condensacin de los aminocidos es un dipptido. Los grupos amino y carboxilo terminales estn situados ahora de tal manera que pueden interactuar para formar una diamida cclica de seis miembros. Se ha visto anteriormente que las reacciones intramoleculares en que se forman anillos de cinco y seis miembros son frecuentemente mucho mas rpidos que sus anlogos intermoleculares. Asi, cuando se calienta la glicina, se obtiene el dimero ciclico 2,5-dicetopiperazina.

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Figura 4 Mas an, la hidrlisis de uno de los enlaces amida en una 2,5-dicetopiperazina es uno de los mtodos para preparar dipptidos sencillos.

Figura 5

1.2.2. Carbohidratos 1.2.2.1. Estructura Clasificacion y propiedades.

Los carbohidratos este nombre viene de la frmula emprica de estos compuestos (CH2O)n son aldehdos y cetonas de polialcoholes. Se clasifican en funcin del tipo y nmero de productos que se forman al hidrolizarse en medio cido: Monosacridos: carbohidratos que no pueden hidrolizarse. Disacridos: al hidrolizarse producen dos monosacridos (iguales o diferentes). Oligosacridos: al hidrolizarse dan de tres a diez molculas de monosacridos. Polisacridos: al hidrolizarse producen ms de diez molculas de monosacridos. Los monosacridos pueden subdividirse en grupos segn el nmero de tomos de carbono que poseen: Triosas (CH2O)3 Tetrosas (CH2O)4 Pentosas (CH2O)5 Hexosas (CH2O)6 Heptosas (CH2O)7 Octosas (CH2O)8 Carbohidratos simples: Los hidratos de carbono simples son los monosacridos, entre los cuales podemos mencionar a la glucosa y la fructosa que son los responsables del sabor dulce de muchos frutos. Con estos azcares sencillos se debe tener cuidado ya que tienen atractivo sabor y el organismo los absorbe rpidamente. Su absorcin induce a que nuestro organismo secrete la hormona insulina que estimula el apetito y favorece los depsitos de grasa. Pgina 12

El azcar, la miel, el jarabe de arce (maple syrup), mermeladas, jaleas y golosinas son hidratos de carbono simples y de fcil absorcin. Otros alimentos como la leche, frutas y hortalizas los contienen aunque distribuidos en una mayor cantidad de agua. Algo para tener en cuenta es que los productos industriales elaborados a base de azucares refinados es que tienen un alto aporte calrico y bajo valor nutritivo, por lo que su consumo debe ser moderado. Carbohidratos complejos: Los hidratos de carbono complejos son los polisacridos; formas complejas de mltiples molculas. Entre ellos se encuentran la celulosa que forma la pared y el sostn de los vegetales; el almidn presente en tubrculos como la patata y el glucgeno en los msculos e hgado de animales. El organismo utiliza la energa proveniente de los carbohidratos complejos de a poco, por eso son de lenta absorcin. Se los encuentra en los panes, pastas, cereales, arroz, legumbres, maz, cebada, centeno, avena, etc.

1.2.2.2.

Glucosidos (enlaces, clasificacion caracteristicas, metodos de obtencion e hidrlisis)

Los glucsidos son molculas compuestas por un glcido (generalmente monosacridos) y un compuesto no glucdico. Los glucsidos desempean numerosos papeles importantes en los organismos vivos. Muchas plantas almacenan los productos qumicos importantes en forma de glucsidos inactivos; si estos productos qumicos son necesarios, se hidrolizan en presencia de agua y una enzima, generando azcares importantes en el metabolismo de la planta. Muchos glucsidos de origen vegetal se utilizan como medicamentos. Formalmente, un glucsido segn la IUPAC (Unin Internacional de Qumica Pura y Aplicada), es cualquier molcula en la cual un glcido se enlaza a travs de su carbono anomrico a otro compuesto de diferente naturaleza qumica, mediante un enlace O-glucosdico o un enlace S-glucosdico; a estos ltimos se los conoce como tioglucsidos. Muchos autores requieren adems que el glcido est enlazado a una molcula que no sea glcido, para que la molcula califique como glucsido. El glcido del glucsido se conoce como glicona y el grupo ajeno al glcido, aglicona o genina del glucsido. La glicona puede consistir en un solo monosacrido o varios unidos entre s oligosacrido. Enlace glucosdico La glicona y porciones de aglicona se pueden separar qumicamente por hidrlisis cida. Numerosas enzimas pueden formar y romper enlaces glucosdicos. Las enzimas ms importantes de este tipo son las glucsido hidrolasas, y las enzimas sintticas ms importantes de la naturaleza son las glucosiltransferasas. Las enzimas mutantes llamadas glucosintetasas, sintetizan glucsidos con un rendimiento mayor.

Clasificacin
Los glucsidos se clasifican dependiendo de la estructura de la glicona y de la aglicona, siendo la ltima, la ms importante y til en bioqumica y farmacologa:

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Glucsidos antraquinnicos Los glucsidos antraquinnicos contienen una aglicona derivada de la antraquinona. Estn presentes el ruibarbo y los gneros Aloe y Rhamnus; tienen un efecto laxante y purgante. Glucsidos fenlicos simples La aglicona tiene una estructura fenlica simple. Un ejemplo es la arbutina, encontrada en la gayuba comn. Tiene un efecto antisptico urinario. Glucsidos alcohlicos Un ejemplo de glucsido alcohlico es la salicina, que se encuentra en plantas del gnero Salix. La salicina al ser ingerida, se convierte en cido saliclico, relacionada directamente con la aspirina y tiene efecto analgsico, antipirtico, antiinflamatorio y anticoagulante( para casos de infartos). Glucsidos flavonicos Aqu el aglicona es un derivado de los flavonoides. Es un grupo muy grande de glucsidos. Algunos ejemplos son la hesperidina, la naringina, la rutina y la quercetina. Estos glucsidos tienen un efecto antioxidante. Tambin se sabe que disminuyen la fragilidad capilar. Glucsidos cardacos En su estructura, la aglicona es un ncleo esteroideo. Estos glucsidos cardacos se encuentran en plantas de los gneros Digitalis, Scilla y Strophanthus y de la familia Apocynaceae. Se utilizan en el tratamiento de las enfermedades cardacas como arritmia y fallo cardiaco. Glucsidos cumarnicos Aqu el aglicona es un derivado de la cumarina. Un ejemplo es la apterina que se utiliza para dilatar las arterias coronarias, as como, para bloquear los canales del calcio Glucsidos cianognicos En este caso, la aglicona contiene un grupo cianuro y el glucsido puede generar el venenoso cido cianhdrico. Un ejemplo de stos es la amgdalina, un glucsido particular de las almendras. Los glucsidos cianognicos se pueden encontrar en las semillas de los frutos (y en las hojas marchitas) de la familia Rosaceae (Cerezas, Manzanas, Ciruelas, Almendras, Duraznos, Albaricoques, etc.). La mandioca, una planta de valor alimenticio en frica y Sudamrica, contiene glucsidos cianognicos, por lo que, la planta tiene que ser lavada y molida con agua a altas velocidades para que se pueda consumir. Saponinas Estos compuestos generan espuma permanente cuando estn en contacto con agua. Causan hemlisis debido a la destruccin de los eritrocitos. Las saponinas se encuentran en plantas como el regaliz, cuyo principio activo es la glicirricina. Tienen un efecto expectorante y se han estudiado sus efectos sobre el control del colesterol en la sangre

Funcin
Las funciones que los glcidos cumplen en el organismo son, energticas, de ahorro de protenas, regulan el metabolismo de las grasas y estructural.
y

Energeticamente, los carbohidratos aportan 4 KCal (kilocaloras) por gramo de peso seco. Esto es, sin considerar el contenido de agua que pueda tener el alimento en el cual se encuentra el carbohidrato. Cubiertas las necesidades energticas, una pequea parte se almacena en el hgado y msculos como glucgeno (normalmente no ms de 0,5% del peso del individuo), el resto se transforma en grasas y se acumula en el organismo como tejido adiposo. Se suele recomendar que minimamente se efecte una ingesta diaria de 100 gramos de hidratos de carbono para mantener los procesos metablicos.

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y y

Ahorro de protenas: Si el aporte de carbohidratos es insuficiente, se utilizarn las protenas para fines energticos, relegando su funcin plstica. Regulacin del metabolismo de las grasas: En caso de ingestin deficiente de carbohidratos, las grasas se metabolizan anormalmente acumulndose en el organismo cuerpos cetnicos, que son productos intermedios de este metabolismo provocando as problemas (cetosis). Estructuralmente, los carbohidratos constituyen una porcin pequea del peso y estructura del organismo, pero de cualquier manera, no debe excluirse esta funcin de la lista, por mnimo que sea su indispensable aporte.

1.2.3. Lipidos 1.2.3.1. Estructura clasificacion y propiedades

Los lpidos, son un grupo de compuestos qumicamente diversos, solubles en solventes orgnicos (como cloroformo, metanol o benceno), y casi insolubles en agua. La mayora de los organismos, los utilizan como reservorios de molculas fcilmente utilizables para producir energa (aceites y grasas). Los mamferos, los acumulamos como grasas, y los peces como ceras; en las plantas se almacenan en forma de aceites protectores con aromas y sabores caractersticos. Los fosfolpidos y esteroles constituyen alrededor de la mitad de la masa de las membranas biolgicas. Entre los lpidos tambin se encuentran cofactores de enzimas, acarreadores de electrones, pigmentos que absorben luz, agentes emulsificantes, algunas vitaminas y hormonas, mensajeros intracelulares y todos los componentes no protecos de las membranas celulares. Los lpidos, pueden ser separados fcilmente de otras biomolculas por extraccin con solventes orgnicos y pueden ser separados por tcnicas experimentales como la cromatografa de adsorcin, cromatografa de placa fina y cromatografa de fase reversa. La funcin biolgica ms importante de losa lpidos es la de formar a las membranas celulares, que en mayor o menor grado, contienen lpidos en su estructura. En ciertas membranas, la presencia de lpidos especficos permiten realizar funciones especializadas, como en las clulas nerviosas de los mamferos. La mayora de las funciones de los lpidos, se deben a sus propiedades de autoagregacin , que permite tambin su interaccin con otras biomolculas. De hecho, los lpidos casi nunca se encuentran en estado libre, generalmente estn unidos a otros compuestos como carbohidratos (formando glucolpidos) o a protenas (formando lipoprotenas). Estas importantes biomolculas se clasifican generalmente en: Lpidos saponificables y no saponificables. Adems de los anteriores, existen lpidos anfipticos en cuya molcula existe una regin polar opuesta a otra apolar. Estos lpidos forman las bicapas lipdicas de las membranas celulares y estabilizan las emulsiones (liquido disperso en un lquido). Los cidos grasos de importancia biolgica, son cidos monocarboxlicos (ej. c laurico: CH3(CH2)10COOH) de cadenas alifticas de diverso tamao y que pueden contener o no insaturaciones: Los cidos grasos naturales insaturados (lquidos a temperatura ambiente), son ismeros geomtricos cis que pueden ser monoinsaturados (ej. cido oleco (cido 9octadecenoco) CH3(CH2)7CH=CH(CH2)7COOH) o poliinsaturados (ej. cido araquidnico (cido 5,8,11,14-eicosatetraenoico) CH3(CH2)4(CH=CHCH2)4(CH 2)2COOH).

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Figura 6: representacin del cido oleico. Los cidos grasos poliinsaturados, desde el punto de vista nutricional se consideran como esenciales pues no son sintetizados por los mamferos; fisiolgicamente, se encuentran formando sales o jabones (formando micelas). Los cidos grasos de cadena larga, insolubles en agua, forman steres con alcoholes y tiosteres con la coenzima A. Compuestos de importancia biolgica como las prostaglandinas, tromboxanos y leucotrienos, son derivados de cidos grasos poliinsaturados de 20 carbonos como el cido araquidnico. En los acilgliceroles (o acilglicridos), uno o ms de los grupos hidroxilo (OH) de la molcula de glicerol, estn esterificados de ah que se dividan en monoacil, diacil y triacilgliceroles; en estos ltimos, todos los hidroxilos del glicerol (3), estn esterificados con cidos grasos. Estos cidos grasos pueden ser iguales entre ellos o diferentes y dependiendo de la longitud de las cadenas que esterifican al glicerol y de su grado de insaturacin, los triacilgliceroles (triacilglicridos), se dividen en grasas (slidas) o aceites (lquidos). Estas molculas, son hidrofbicas y no forman micelas.

 Glicerofosfolpidos, fosfoglicridos, fosfolpidos o fosfoacilgliceroles  Esfingolpidos  Ceras  Terpenos  Esteroides

1.2.4. Acidos Nucleicos 1.2.4.1. Estructura clasificacion y propiedades

De acuerdo a la composicin qumica, los cidos nucleicos se clasifican en cidos desoxiribonucleicos (ADN) que se encuentran residiendo en el ncleo celular y algunos organelos, y en cidos ribonucleicos (ARN) que actan en el citoplasma. Se conoce con considerable detalle la estructura y funcin de los dos tipos de cidos. Estructura. El conocimiento de la estructura de los cidos nucleicos permiti la elucidacin del cdigo gentico, la determinacin del mecanismo y control de la sntesis de las protenas y el mecanismo de transmisin de la informacin gentica de la clula madre a las clulas hijas. Pgina 16

A las unidades qumicas que se unen para formar los cidos nucleicos se les denominan nucletidos y al polmero se le denomina polinucletido o cido nucleico. Los nucletidos estn formados por una base nitrogenada, un grupo fosfato y un azcar; ribosa en caso de ARN y desoxiribosa en el caso de ADN. Las bases nitrogenadas son las que contienen la informacin gentica y los azcares y los fosfatos tienen una funcin estructural formando el esqueleto del polinucletido. En el caso del ADN las bases son dos purinas y dos pirimidinas. Las purinas son A (Adenina) y G (Guanina). Las pirimidinas son T (Timina) y C (Citosina) . En el caso del ARN tambin son cuatro bases, dos purinas y dos pirimidinas. Las purinas son A y G y las pirimidinas son C y U (Uracilo).

Figura 7 Estructura de las Bases Nitrogenadas. Las bases se unen al carbono 1' del azcar y el fosfato en el carbn 5' para formar el nucletido.

Figura 8 Estructura de un Nucletido. Los nucletidos se unen para formar el polinucletido por uniones fosfodiester entre el carbono 5' de un nucletido y el carbono 3' del siguiente.

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Figura 9 Unin Fosfodiester en los cidos Nucleicos. Un dinucletido en el que se unieron un nucletido con la base A con un nucletido con la base G y el enlace fosfodiester se form entre el carbono 3'del nucletido con base A y el 5'del nucletido con base G, se representa simplemente como AG. Si a este dinucletido se le agrega otro nucletido en el carbono 3' y este nucletido tiene una base T, el trinucletido resultante se representar por AGT. sta es la forma simplificada en que se acostumbra representar los polinucletidos. El ADN est formado por dos cadenas muy largas de polinucletidos unidas entre s por puentes de hidrgeno especficos entre las bases de las dos cadenas. La base de una cadena que se une por los puentes de hidrgeno con la base de la otra cadena se dice que forman un par de bases. A se parea con T y G con C (Figura 1.1.1.G.). Las dos cadenas se encuentran arregladas en una estructura helicoidal alrededor de un eje comn por lo que recibe el nombre de doble hlice. Las bases se encuentran acomodadas hacia el eje de la doble hlice, mientras que el azcar y los fosfatos se encuentran orientados hacia el exterior de la molcula.

Figura 10 Estructura de los Pares de Bases. El dimensiones de la hlice, independientemente de la especie, son las siguientes: dimetro 20 Angstrom y la longitud del paso 34 Angstrom el cual est constituido por 10 residuos de nucletidos. El tamao de la molcula de ADN de doble hlice se expresa en miles de bases o kb. La longitud de 1kb es entonces 0.34 micras. Una molcula de ADN de un milmetro de longitud estar formado de 3 mil kb o sea tres millones de bases. As pues la molcula de ADN es un largo filamento de 20 Angstrom de dimetro cuya longitud depende del nmero de kb, el cual a su vez depende de la especie. El rango de tamao va desde 2 micras (5 kb) en el virus SV40, hasta casi un metro (3 x 106 kb) en cromosomas humanos. El genoma de E. coli, no tiene extremos, o sea forma un crculo, y el permetro tiene una longitud de 1.4 mm (4000kb). El genoma de los animales superiores no forma crculos, es una estructura lineal abierta. Pgina 18

Figura 11 Estructura de la Doble Hlice En los cromosomas estas molculas se arreglan en estructuras ms compactas en las que la doble hlice se enrolla sobre s misma. En el caso de las bacterias, la molcula de ADN de ms de un milmetro de longitud se arregla dentro de la bacteria que slo tiene una longitud de una micra (o sea es una longitud mil veces menor). El ARN es un filamento de una sola cadena, no forma doble hlice. La presencia de un oxgeno en la posicin 2' de la ribosa impide que se forme la doble cadena de la manera en que se forma en el ADN. El filamento de ARN se puede enrollar sobre s mismo mediante la formacin de pares de bases en algunas secciones de la molcula. Existen varios tipos de ARN cada uno con funcin distinta. Los que forman parte de las subunidades de los ribosomas se les denomina ARN ribosomal (rARN), los ARN que tienen la funcin de transportar los aminocidos activados, desde el citosol hasta el lugar de sntesis de protenas en los ribosomas; se les conoce por ARN de transferencia (tARN) y los ARN que son portadores de la informacin gentica y la transportan del genoma (molcula de ADN en el cromosoma) a los ribosomas son llamados ARN mensajero (mARN). El tamao de las molculas de ARN es mucho menor que las del ADN. En el caso de E. coli va de menos de 100 nucletidos en los tARN hasta casi 4000 (4kb) en rARN. Informacin gentica. La estructura de la doble hlice para el ADN fue originalmente propuesta por Watson y Crick (WyC) en 1953, postulando que la secuencia en la cual se encuentran las bases a lo largo de la molcula de ADN es lo que contiene la informacin gentica. No existe ningn impedimento estrico que limite la secuencia de bases, cualquier base puede seguir a cualquier otra. Transmisin.- Con estas bases, WyC propusieron el mecanismo de duplicacin del ADN por medio del cual, las dos clulas hijas provenientes de una divisin celular contienen copias idnticas del ADN presente en la clula que se dividi. A la duplicacin del ADN se le conoce con el nombre de replicacin. Durante la replicacin, las dos cadenas se van separando y cada una de ellas sirve de patrn para la sntesis de su cadena complementaria. Las bases se van agregando una a una y la seleccin de cul base entra en un sitio especfico de la cadena en formacin, queda determinada por la base en la cadena patrn con la que se va a aparear. Donde hay una A en la cadena patrn, se inserta una T en la cadena en proceso de formacin y, donde hay una T se inserta una A, y lo mismo sucede con el apareamiento de G y C. La nueva cadena tiene una secuencia de bases complementaria a la cadena original.

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El modelo de duplicacin del ADN se dice que es semi-conservado, porque la mitad del ADN de un cromosoma, una cadena completa, proviene de la clula paterna y la otra mitad, la otra cadena, se sintetiza durante el proceso de replicacin. Este es el mecanismo propuesto por Watson y Crick para explicar la transmisin de la informacin gentica de una generacin a otra. La formacin de las uniones fosfodiester est catalizada por la ADN polimerasa. La ADN polimerasa no formar la unin fosfodiester, a menos que la base que est entrando a la molcula, sea complementaria a la base existente en la cadena patrn. La frecuencia con la que se inserta una base equivocada es menor a 1 en 100 millones. Flujo. El apareamiento de bases es tambin el mecanismo para enviar la informacin gentica desde el ncleo hasta los ribosomas y dirigir la sntesis de protenas. En este caso una porcin de una de las cadenas del ADN sirve de patrn para la sntesis de ARN y la secuencia de bases en el ARN es complementaria a la que se presenta en la porcin de la cadena que se est copiando. Al ARN que se sintetiza en esta forma se le denomina ARN mensajero o mARN. La sntesis del ARN es catalizada por la ARN polimerasa, que al igual que la ADN polimerasa es una enzima patrn-dependiente. El mARN se une, en el citoplasma, a las dos subunidades ribosomales, constituyendo el ribosoma activo, que es la estructura celular responsable de la sntesis de protenas. Es en este organelo donde el mARN especifica la secuencia en que deben de insertarse los aminocidos en la sntesis de polipptidos. sta es la forma en que la informacin contenida en los cromosomas se traduce en la especificacin de la estructura primaria de las protenas. Como ya se mencion, la estructura primaria determina la estructura tridimensional de la protena, la que a su vez determina su funcionalidad. Al proceso de copiado de la informacin gentica contenida en el ADN cromosomal durante la sntesis del mARN se le llama transcripcin. Al proceso de lectura, en el ribosoma, de la informacin transportada por mARN, durante la sntesis de protena, se le conoce como traduccin.

Figura 12 Mecanismo de replicacin, transcripcin y traduccin La porcin de ADN que contiene la informacin para codificar una protena determinada se le da el nombre de gene y normalmente recibe el mismo nombre de la protena que codifica, usando casi siempre, una abreviacin de tres letras. A la porcin de ADN que codifica un conjunto de protenas que entran en un paso del metabolismo se le llama opern. Por ejemplo; al conjunto de genes que intervienen en la codificacin de las protenas que intervienen en la utilizacin de lactosa se les llama lac opern.

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El lenguaje utilizado para describir el proceso de direccin de la sntesis de protenas por los genes del cromosoma refleja la interpretacin de que se trata de un flujo de informacin.

Tabla 2 El Cdigo Gentico

U U Phe Phe Leu Leu Leu Leu Leu Leu Ile Ile Ile Met (Inicio) Val Val Val Val Segunda Posicin C Ser Ser Ser Ser Pro Pro Pro Pro Thr Thr Thr Thr Ala Ala Ala Ala A Tyr Tyr Alto Alto His His Gln Gln Asn Asn Lys Lys Asp Asp Glu Glu G Cys Cys Alto Trp Arg Arg Arg Arg Ser Ser Arg Arg Gly Gly Gly Gly U C A G U C A G U C A G U C A G Tercera Posicin (3'-)

Primera Posicin (5'-)

El mensaje que est contenido en el genoma se encuentra escrito en un lenguaje de 4 letras (las cuatro bases), el cual se transcribe usando el mismo lenguaje, al sintetizar el mARN. La sntesis de protenas se le denomina traduccin porque ahora se pasa del lenguaje de 4 letras a otro con 20 letras (los 20 aminocidos). Para pasar de un lenguaje a otro se necesita un cdigo para hacer la traduccin y se le denomina cdigo gentico. Las equivalencias entre los dos lenguajes se presentaron en la tabla anterior. Tres bases contiguas (un triplete) codifican un aminocido, as como tambin para la puntuacin del mensaje. Se determin qu tripletes codifican cada aminocido y qu tripletes indican el inicio y la terminacin del mensaje. Al triplete se le dio el nombre de codn. Se encontr que algunos aminocidos podan ser codificados por ms de un codn, o sea hay codones que son sinnimos. Por esta razn se dijo que el cdigo gentico es degenerado. Modificaciones. Al estudio de las bases moleculares de la herencia se le conoce como gentica molecular o biologa molecular y a las modificaciones artificiales del ADN con el fin de cambiar el mensaje gentico que contiene se le conoce como ingeniera gentica. Se pueden agregar porciones de ADN que contienen genes que no estn presentes en el cromosoma incrementando el nmero de genes de la clula, o bien se pueden inducir cambios que eliminen genes activos presentes en la clula haciendo en este caso que la clula pierda cierta capacidad gentica. Cuando se modifica la molcula de ADN de un organismo agregndole porciones de ADN provenientes de otro organismo se dice que se hizo una recombinacin del ADN y al resultado se le llama ADN recombinante. Esta tcnica se usa para producir organismos capaces de hacer funciones que el organismo original no tena. Por ejemplo se puede introducir en una bacteria el gene de la insulina humana y la bacteria adquirir la capacidad de sintetizar ese polipptido. Pgina 21

Tabla 3 Mutaciones del ADN. Tipo de mutacin Secuencia del ADN Secuencia del polipptido Cadena superior Ninguna AAT CGG GAG Asn Arg Val TTA GCC CTC Transversin AAT CCG TAG Asn Arg (fin) (GC:TA) TTA GCC ATC Transicin GC:AT AAT ACC AAG Asn Arg Lis TTA GCC TTC Incercin, cambio de marco AXA TCG GGA T T AGC CCT Produce la sig. secuencia ATA TCG CCT Ileu Ser Gli TAT AGC CCT

En prrafos anteriores se mencion que la replicacin del ADN se hace con gran fidelidad, con una frecuencia de errores del orden de 10-8, sin embargo, s ocurren errores. Si se substituye una purina por otra, o una pirimidina por otra, al cambio se le llama transicin; si se substituye una purina por una pirimidina al cambio se le llama transversin; si se agrega o elimina una base entonces se produce lo que se llama un cambio de marco. En este ltimo caso, se lee en forma errnea todo el mensaje que sigue al punto de cambio. En algunas ocasiones, cuando se modifica una de las bases y la ADN polimerasa no la identifica, entonces introduce una A y el cambio final ser la introduccin de una T en la cadena patrnLa clula tiene mecanismos para eliminar los errores o cambios que ocurren en el ADN, bien sea durante la sntesis o cuando ya est formado. Si la clula no repara los cambios y entra en el proceso de duplicacin con el ADN modificado, el cambio se fija y se vuelve permanente. El gene modificado puede ahora codificar una protena diferente, y si este es el caso, se dice que tuvo lugar una mutacin. En la Tabla 1.1.1.B se presenta el efecto de los cambios en el ADN sobre la estructura primaria del polipptido que codifica. Existen varias substancias que incrementan significativamente la frecuencia con la que ocurren cambios en las bases que se introducen en el ADN que se est sintetizando y se les denomina mutgenos. La mayora de los cancergenos son mutgenos. Tabla 4 Mutgenos y su Efecto sobre el ADN.

Mutgeno Mecanismo Agentes alquilantes Se une covalentemente (nitrosourea,nitrosoguanidina) y forma sitios apurnicos Agentes desaminantes Adenina-hipoxantina (cido nitroso) y citosina-uracilo Base anloga Substitucin durante (2-aminopurina) la replicacin del ADN Agente intercalante Insercin o eliminacin

Resultado en el ADN Transicin y transversin Transicin Transicin Cambio de cuadro

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(antridinas, antraciclinas) Fraccionadores de cadenas (radiaciones ionisantes)

de pares de bases las Translocacin cromosomal

Cambio de una o ms bases

Si la substitucin, insercin o eliminacin de una base tuvo lugar en alguna parte del ADN que codifica una protena, entonces puede cambiar un codn y dar lugar a una modificacin que produzca la introduccin de un aminocido diferente o se codifique por terminacin de la cadena peptdica. Las mutaciones se clasifican de acuerdo al efecto que tienen sobre el producto del gene modificado. Se dice que la mutacin es: 1) sin sentido, si el producto es inactivo o incompleto, 2) de prdida del sentido, si el producto es defectuoso y 3) silenciosa, si no se altera ni la funcin ni la cantidad del producto activo. Conclusion: Para mi esta primera unidad es interesante ya que se empieza a saber la bese de lo que es la materia en especifico, en esto se puede tener en cuenta que cada termino que se trata se va ligando poco a poco en cada desglose de terminos, ya que para que se pueda realizar cierto tipo de proceso en el cual cada uno tiene su funcion en especifico como el de los amino asidos y las proteinas ya que se pede ver que los aminoacidos son esenciales para poder obtener una buena proteina, sin dudar que tambien se nesecita de la ayuda de otras ciencias ligadas a la bioqumica para poder saber un poco mas de los tipos de proceedimientos que se llevan acavo en todos los procesos antes mencionados.

 Rferencias Cibergraficas http://bioqumica-yesi.blogspot.com/2009/01/bioqumica-concepto-y-ramas.html

http://es.wikipedia.org/wiki/Bioqu%C3%ADmica
http://www.futbolcarrasco.com/apartados/inef/1curso/6.pdf http://www.zonadiet.com/nutricion/amacido.htm http://depa.pquim.unam.mx/proteinas/estructura/EPamm3.html http://www.monografias.com/trabajos26/peptidos/peptidos.shtml#sintesis http://www.zonadiet.com/nutricion/hidratos.htm http://gmein.uib.es/moleculas/carbohidratosjmol/carbohidratosjmol.html http://es.wikipedia.org/wiki/Gluc%C3%B3sido http://es.wikipedia.org/wiki/L%C3%ADpido http://superfund.pharmacy.arizona.edu/toxamb/c1-1-1-3.html Pgina 23

Indice de terminos. Unidad 1 Fundamentos de la Bioqumica-------------------------------------------------------pag.2

1.1

Fundamentos --------------------------------------------------------------------------------------pag.2
1.1.1 2.1.1 3.1.1

Antecedentes --------------------------------------------------------------------------------pag.2 Ciencias auxiliares -------------------------------------------------------------------------pag.4 Actualidades ---------------------------------------------------------------------------------pag.5

2.1

Bases moleculares ------------------------------------------------------------------------------pag.6

1.1.1

Protenas -------------------------------------------------------------------------------------pag.6

1.2.1.1. Aminocidos (estructura, clasificacin, propiedades,

estereoqumica y mtodos de obtencin) --------------------------------------pag.11

1.2.1.2 Pptidos (estructura, nomenclatura, sntesis e importancia) -------------pag.11 1.2.1.2 Protenas (Estructura, funcin e importancia) ----------------------------------pag.11 2.1.1

Carbohidratos ----------------------------------------------------------------------------pag.12

1.2.2.1 Estructura, clasificacin, propiedades --------------------------------------------pag.12 1.2.2.2 Glicosidos (enlaces, clasificacin,

Caractersticas, mtodos de obtencin, hidrlisis-------------------------pag.13

3.1.1

Lipidos --------------------------------------------------------------------------------------pag.15

1.2.3.1 Estructura, clasificacin y propiedades -----------------------------------------pag.15

1.2.4 Acidos

Nucleicos ------------------------------------------------------------------------------pag.16

1.2.4.1 Estructura, clasificacin y propiedades ------------------------------------------pag.16

Conclucin------------------------------------------------------------------------------------------------------pag.23 Referencia Bibliografica----------------------------------------------------------------------------------pag.23

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Indice de figuras
Figura 1---------------------------------------------pag.5 Figura 2 --------------------------------------------pag.5 Figura 3 --------------------------------------------pag.9 Figura 4 --------------------------------------------pag.11 Figura 5 --------------------------------------------pag.11 Figura 6 --------------------------------------------pag.16 Figura 7 -------------------------------------------- pag.17 Figura 8 -------------------------------------------- pag.17 Figura 9 -------------------------------------------- pag.18 Figura 10 ------------------------------------------ pag.18 Figura 11 ------------------------------------------ pag.19 Figura 12 ------------------------------------------pag.20

Indice de Tablas
Tabla 1 Estructura tridimencional de los aminoacidos ------------------------------ pag. 8

Tabla 2 El Cdigo Gentico --------------------------------------------------------------- pag. 21

Tabla 3 Mutaciones del ADN -------------------------------------------------------------- pag. 22

Tabla 4 Mutgenos y su Efecto sobre el ADN ------------------------------------------ pag.22

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