Fabricação de biomodelos virtuais através de softwares

Fabricao de Biomodelos Virtuais
Atravs de Softwares
Trabalho de Concluso de Curso
Orientando: Matheus Augusto Manelcci

Orientador: Prof. Dr. Romeu Rony Cavalcante da Costa
Cornlio Procpio, 06 de maro de 2015
1. INTRODUO
Figura 1 - Fluxograma das etapas do processo
1. INTRODUO
1. INTRODUO
Conceitos:
A tomografia computadorizada: raio-X ultrassensvel de uma

determinada parte do corpo. Os ossos aparecem em branco, gases e
lquidos em preto, tecidos so vistos numa graduao de cinza.
A ressonncia magntica cria um campo magntico que envia ondas

de rdio ao corpo e mede a liberao de energia das clulas com uso do
computador.
1. INTRODUO
Arquivo DICOM significa Digital Imaging and Communications in

Medicine.
O arquivo DICOM uma srie (geralmente centenas) de seces

transversais, chamada fatias, que foram tomadas de uma rea do corpo
de um paciente atravs de tomografia computadorizada ou ressonncia
magntica.
Biomodelos so modelos anatmicos de partes do corpo humano.
1. INTRODUO
O caso mais popular a separao das gmeas siamesas, conhecidas
como Pequenas Marias que nasceram na Guatemala, em 2001,
unidas pelo crnio e com os rostos virados em direes opostas.
Figura 2 (a) Gmeas unidas pela cabea; (b) Biomodelo; (c) Definio do plano de corte;
(d) Gmeas aps a separao.
2. OBJETIVOS
Passo a passo de alguns programas responsveis por realizar leituras de

imagens 2D, provenientes de ressonncias magnticas (RM).
Transformar as imagens de interesse em formato de linguagem de
impresso.
Apontar os principais recursos dos programas InVesalius, Seg3D e

ImageVis3D.
Atravs de um exemplo, diferenciar e comparar as caractersticas de

cada programa atravs de manipulao de imagens em duas dimenses
at a superfcies 3D pronta para impresso.
3. METODOLOGIA
Para o desenvolvimento do trabalho requer a aquisio das RM ou TC.
Para isso, necessita-se solicitar a liberao desses arquivos em um

centro clnico ou mdico com as devidas autorizaes, tanto do centro
mdico como do paciente, isto faz parte das boas prticas da pesquisa.
H tambm a possibilidade de adquirir esses arquivos na web.
3. METODOLOGIA
Aps a aquisio da imagem concentra-se na rea de interesse para

proceder a manipulao e gerao do arquivo tridimensional no formato
.stl.
O desenvolvimento desse projeto foi exclusivamente o uso de

computador, computador munido dos softwares: InVesalius, Seg3D e
ImageVis3D.
Descrio de um tutorial ilustrativo sobre o funcionamento desses

softwares utilizando um exemplo disponvel na WEB.
4. PROGRAMAS
Para realizar a impresso de biomodelos a partir de [RM] ou [TC]

necessrio seguir o fluxograma mostrado na figura 1. Existem muitos
softwares para realizar esse trabalho.
Mostrar o funcionamento dos programas atravs de um exemplo que

possibilita a visualizao das imagens 2D at a gerao dos biomodelos
em .stl.
4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

INVESALIUS
um software pblico da rea da sade que realiza anlise de modelos

anatmicos virtuais possibilitando a confeco de modelos fsicos.
O software desenvolvido pelo CTI (Centro de Tecnologia de Informao

Renato Archer).

INVESALIUS
O software InVesalius uma homenagem ao mdico belga Andreas Vesalius (1514

1564).
Figura 3 - Andreas Vesalius

INVESALIUS
ABRINDO O INVESALIUS
Ao instalar o software, um cone criado na rea de trabalho, para iniciar clicar duas vezes
sobre o cone.
BARRA DE FERRAMENTAS
Figura 4 Barra de Ferramentas

INVESALIUS

INVESALIUS
INICIANDO UM PROJETO
Clicar em arquivo e em seguida em importar DICOM, ou clicar sobre o

boto .
Figura 5 Importar DICOM

INVESALIUS
Depois de carregada as fatias do exame, uma tela
apresentar dados sobre o paciente e do exame
realizado. Explorando a aba, novas linhas aparecem
com detalhes das imagens aquisitadas. Na imagem
6 so apresentadas 18 imagens.
Tamanho da imagem que o aparelho mdico foi
configurado (512x512)
Reproduzir, apresentar uma sequencia animada de
todas as fatias contidas na pasta.
Figura 6 Informaes dos pacientes e imagens das

fatias

INVESALIUS
O usurio pode optar por trabalhar com todas as fatias
apresentadas ou ento somente com uma seleo de
interesse.
Carregando as fatias o software apresentar a seguinte tela,
estando apto para incio da segmentao, figura 7.

INVESALIUS
Figura 7 Tela inicial de segmentao

INVESALIUS
SEGMENTAO DE UMA ESTRUTURA ANATMICA
A figura 7 representa onde realiza-se a segmentao das imagens mdicas.
Entende-se por segmentao, a ao de separar as estruturas anatmicas de
interesse das reas adjacentes.
Quatro principais ferramentas para a segmentao:
(Canto superior esquerdo)
1- importao das imagens mdicas ou aberturas de projetos.

2- definio da rea de interesse.
3- configurao da superfcie 3D.
4- exportao dos dados para outros softwares.

INVESALIUS
Continuando na figura 7, a direita, trs janelas (planos AXIAL, SAGITAL e

CORONAL) e uma quarta janela que apresenta a reconstruo tridimensional
volumtrica das fatias, esta rea est vazia porque ainda no foi construda
a superfcie ou seja a parte tridimensional das fatias que ser mostrada
adiante.
CRIANDO E MANIPULANDO MSCARAS
Para segmentar uma estrutura inicia-se pelos quatro passos ao lado esquerda
da tela principal.
No caso da importao das imagens mdicas j terem sido iniciada, procedese o segundo passo.

INVESALIUS
No segundo passo define-se a regio de interesse a ser segmentada mscara.
possvel criar diversas mscaras para um mesmo trabalho.
Configuraes pr-estabelecidas, figura 8.
Limiar.
Figura 8 Opes de segmentao pr-estabelecidas

INVESALIUS
Escolhida as opes;
Para visualizao, a opo da mscara deve estar ativa. Figura 9 (Mscara 2 ativa)
Para melhor organizao ao clicar sobre o nome da mscara ser possvel alterar o
nome.
Figura 9 Selecionar e renomear mscaras

INVESALIUS
Continuando nas configuraes das mscaras, que serviro para criao de superfcies
tridimensionais, observa-se a opo FERRAMENTAS AVANADAS DE EDIO: Desenhar,
apagar e limiar.
Desenhar: utilizada para construir partes que sero projetadas tridimensionalmente.
Apagar: utilizamos essa ferramenta para apagar estruturas adjacentes regio de interesse.
Limiar: ao definir o limiar o software destacar as estruturas que obedecem densidade

representada por esse limiar.

INVESALIUS
Aps selecionar uma mscara e CRIAR SUPERFCIE, automaticamente o

usurio ser direcionado para o passo 3, CONFIGURE A SUPERFCIE.
Na figura 10, observa-se os planos (Axial, Sagital, Coronal) e agora a

superfcie 3D.

INVESALIUS
Figura 10 Planos (Axial, Sagital, Coronal) e superfcie 3D.

INVESALIUS
Caso existam 2 ou mais superfcies e todas estiverem ativas a visualizao ficar sobreposta, figura 11.
Assim pode-se analisar a disposio de estruturas sobrepostas como msculos e ossos.
Figura 11 Sobreposio de imagens

INVESALIUS
EXPORTAR DADOS
Etapa 4, aps a superfcie estar configurada e ter criado o modelo virtual, o

usurio pode export-lo para outros softwares para edio ou diretamente em
formato STL para prototipagem do modelo. Tambm existe a opo de
exportar imagens do modelo para software de edio de imagens, figura 12.
Figura 12 Aba para exportar

imagens ou superfcies 3D

SEG3D
Seg3D uma ferramenta gratuita e desenvolvida pelo SCI (Scientific

Computing and Imaging) na universidade de Utah, disponvel somente
em ingls.
O software realiza basicamente as mesmas funes do InVesalius mas

no cria o arquivo stl, ele segmenta as imagens, necessitando assim de
auxlio de outra ferramenta.

SEG3D
INICIAR UM PROJETO
Depois de abrir o software clicar em File; Start New Project, escolher um

nome e avanar.
A figura 13 software e para carregar as imagens de extenso DICOM clicar em

File, Import Layer from Image Series, Import. Iniciar o carregamento das
imagens.

SEG3D
Figura 13 Carregando imagens

SEG3D
SEGMENTAO
Carregada as imagens, axial, coronal e sagital do lado direito. No centro que

ser criado o volume. De incio apresenta-se apenas projees dessas
imagens nos planos, figura 14.
Figura 14 Cortes axial, coronal, sagital

e imagens projetadas nos planos.

SEG3D
RENDERIZAO DO VOLUME
Na janela, Window, Volume View Window as opes de Volume

Rendering aparecero. E atravs de criao de features cria-se o volume.

SEG3D
Figura 15 - Superfcie 3D

SEG3D
EXPORTAR ARQUIVO
Exportar o arquivo em: File; Export Active Data Layer... o arquivo ser
salvo em nrrd. Extenso compatvel com o software ImageVis3D, que ser
apresentado a seguir.

IMAGEVIS3D
Programa de Renderizao de volume.
Necessita de uma placa grfica de alto desempenho.
INTERFACE INICIAL DO SOFTWARE
Na tela inicial abrir o arquivo Open data set from file, figura 16.

IMAGEVIS3D
Figura 16 Interface inicial do software ImageVis3D

IMAGEVIS3D
JANELA DE TRABALHO
Com o arquivo carregado, na aba superior habilita-se no
Workspace a opo Isosurface Settings, nessa opo
altera-se os valores de Isosurface Enable.
EXPORTAR ARQUIVO
Para exportar Export as Mesh, figura 17, arquivo em
formato .stl de resoluo 512x512x460 maior disponvel no
programa.

IMAGEVIS3D
Figura 17 Arquivo para ser salvo em .stl
5. RESULTADOS
Utilizou-se duas formas para chegar ao modelo 3D em .stl a partir das

imagens de ressonncias magnticas, a finalidade a mesma buscar
biomodelos virtuais.
O programa InVesalius possui a opo em Portugus-BR e tambm

mais intuitivo com uma interface mais simples, consequentemente um
software mais leve que no exige tantas propriedades grficas.
5. RESULTADOS
O Seg3D um programa disponvel apenas em Ingls no um software

to simples como o InVesalius mas para funes bsicas, por exemplo,
realizar as alteraes dos volumes, possvel realizar alguns trabalhos
interessantes com os recursos disponveis mostrados anteriormente.
Desvantagem: este programa no possvel chegar a extenso

requerida pelas impressoras 3D, necessitando assim do auxlio de outro
programa e placa grfica de alto desempenho.
5. RESULTADOS
Figura 18 Renderizada atravs do software InVesalius
5. RESULTADOS
Figura 19 Renderizada atravs dos software ImageVis3D
5. RESULTADOS
O InVesalius gera arquivos menores e portanto com menos qualidade

grfica computacionalmente falando. Assim, o software Seg3D gera
arquivos com melhores qualidades em contrapartida exige mais
propriedades grficas numa anlise computacional.
Portanto, depende da finalidade e dos equipamentos disponvel do

usurio a escolha do melhor software.
6. SUGESTES PARA TRABALHOS

FUTUROS
Realizar a impresso desses biomodelos utilizando matrias variados.
Utilizar as mesmas imagens, criar os mesmos conceitos aplicados no

trabalho e imprimir vindo de softwares distintos.
Implementao em universidades com ramo biolgico.
7. CONCLUSO
Atravs desses tutoriais possvel usurios desses softwares criarem

biomodelos virtuais e usurios portadores de uma impressora de
prototipagem rpida chegarem a criar biomodelos seja a ttulo de
curiosidade, estudo ou profissional.
Vale ressaltar que impressoras 3D possuem limitaes e as utilizadas

para planejamentos cirrgicos so mais caras por conseguirem uma
melhor preciso e detalhamento do que outras de usurios domsticos.
7. CONCLUSO
A escolha de utilizar um software ou outro est na adequao do

usurio e na limitao do computador, tendo cada um seus benefcios e
limitaes.
Em escolas de medicina, biologia e etc... de grande valia a criao

desses biomodelos. Permitindo uma didtica mais prxima da realidade
no exigindo um detalhamento to aprofundado como em casos
cirrgicos.
7. CONCLUSO
Os biomodelos no demonstram ser de grande necessidade no tratamento de
deformidades simples, onde tcnicas cirrgicas padronizadas obtm bons
resultados.
Contudo, nos casos em que procedimentos cirrgicos complexos so
necessrios os biomodelos que facilitam as cirurgias, melhores resultados,
diminui os riscos, complicaes, tempo cirrgico.
Enfim os pacientes portadores de deformidades para que possam ser
beneficiados com esta tecnologia, existe a necessidade de investimentos em
pesquisas.
REFERNCIAS
AL-CHUEYR, T. AMORIN, P. H. J. DE MORAES, T. F. InVesalius 3.0a Pr-Manual pelo Usurio

Verso 1.0 (26/11/2009)
AMARO
JUNIOR,
Edson.
YAMASHITA,
Helio.
Aspectos
bsicos
de
tomografia
computadorizada
e
ressonncia
magntica.
Disponvel
em:
<http://www.scielo.br/scielo.php?pid=S1516-44462001000500002%094&script=sci_arttext>.
Acesso 10 dez. 2014
AMORIM, P.H.J. DE MORAES, T. DE SOUZA AZEVEDO, F. LOPES DA SILVA, J.V. Software InVesalius
Guia do Usurio. Centro de Tecnologia da Informao Renato Archer.
FOGGIATTO, Jos Aguiomar; O Uso da Prototipagem Rpida na rea Mdico-Odontolgica

Disponvel
em:
<http://pessoal.utfpr.edu.br/foggiatto/arquivos/O_Uso_da_Prototipagem_na_area_medicoodontologica.pdf>. Acesso: 28 mai. 2014.
REFERNCIAS
FREDDO, ngelo Luiz. HAUSER, Eliete Biasotto. DE OLIVEIRA, Marlia Gerhardt. Anlise Biomecnica
de
Osso
Submetido
a
Distrao
Osteognica
e
LLLT.
Disponvel
em:
<http://www.rvacbo.com.br/ojs/index.php/ojs/article/view/5/5>. Acesso: 30 mai. 2014.
GORNI, Antnio Augusto; Introduo Prototipagem Rpida e Seus Processos. Disponvel em:
<http://www.ucg.br/site_docente/fabio/design/mat3/aula15/RP.pdf>. Acesso 28 mai. 2014.
GOUVEIA, Maria de Ftima de, Aplicao da Prototipagem Rpida no Planejamento de Cirurgias

Craniofaciais, Campinas: Faculdade de Engenharia Mecnica, Universidade Estadual de Campinas,
2009. 157 p. Dissertao (Doutorado).
MEURER, E. GERHARDT DE OLIVEIRA, M. MEURER, M. I. LOPES DA SILVA, J. V. SANTA BRBARA, A.

HEITZ, C. Os Biomodelos de Prototipagem Rpida em Cirurgia e Traumatologia
Bucomaxilofacial.
Disponvel
em:
<http://www.actiradentes.com.br/revista/2007/textos/18RevistaATO-Prototipagem-2007.pdf>. Acesso
28 mai. 2014.
REFERNCIAS
MEURER, M. I. MEURER, LOPES DA SILVA, J.V. SANTA BRBARA, A. NOBRE, L .F.
GERHARDT DE OLIVEIRA, SILVA, D. N. Aquisio e manipulao de imagens
por tomografia computadorizada da regio maxilofacial visando
obteno
de
prottipos
biomdicos.
Disponvel
em:
<http://www.scielo.br/scielo.php?pid=S010039842008000100013&script=sci_arttext#back>. Acesso: 10 dez. 2014.
RAMOS, Paulo Csar de Freitas; Contribuio ao Projeto de Implantes
Personalizados Atravs de Sistemas CAD e Prototipagem Rpida.
Dissertao Mestrado em Engenharia Mecnica. Universidade de So Paulo.
VOLPATO, Neri; Prototipagem rpida: tecnologia e aplicaes. So Paulo:
Edgard Blcher; 2007.
OBRIGADO

Fabricação de biomodelos virtuais através de softwares

Uploaded by

Document Information

Original Description:

Original Title

Copyright

Available Formats

Share this document

Share or Embed Document

Sharing Options

Did you find this document useful?

Is this content inappropriate?

Copyright:

Available Formats

Fabricação de biomodelos virtuais através de softwares

Uploaded by

Copyright:

Available Formats

Fabricao de Biomodelos Virtuais

Orientando: Matheus Augusto Manelcci

Cornlio Procpio, 06 de maro de 2015

Figura 1 - Fluxograma das etapas do processo

A tomografia computadorizada: raio-X ultrassensvel de uma

A ressonncia magntica cria um campo magntico que envia ondas

Arquivo DICOM significa Digital Imaging and Communications in

O arquivo DICOM uma srie (geralmente centenas) de seces

Biomodelos so modelos anatmicos de partes do corpo humano.

Passo a passo de alguns programas responsveis por realizar leituras de

Apontar os principais recursos dos programas InVesalius, Seg3D e

Atravs de um exemplo, diferenciar e comparar as caractersticas de

Para o desenvolvimento do trabalho requer a aquisio das RM ou TC.

Para isso, necessita-se solicitar a liberao desses arquivos em um

H tambm a possibilidade de adquirir esses arquivos na web.

Aps a aquisio da imagem concentra-se na rea de interesse para

O desenvolvimento desse projeto foi exclusivamente o uso de

Descrio de um tutorial ilustrativo sobre o funcionamento desses

Para realizar a impresso de biomodelos a partir de [RM] ou [TC]

Mostrar o funcionamento dos programas atravs de um exemplo que

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

um software pblico da rea da sade que realiza anlise de modelos

O software desenvolvido pelo CTI (Centro de Tecnologia de Informao

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

O software InVesalius uma homenagem ao mdico belga Andreas Vesalius (1514

Figura 3 - Andreas Vesalius

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

Figura 4 Barra de Ferramentas

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

Clicar em arquivo e em seguida em importar DICOM, ou clicar sobre o

Figura 5 Importar DICOM

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

Figura 6 Informaes dos pacientes e imagens das

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

Figura 7 Tela inicial de segmentao

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

1- importao das imagens mdicas ou aberturas de projetos.

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

Continuando na figura 7, a direita, trs janelas (planos AXIAL, SAGITAL e

CRIANDO E MANIPULANDO MSCARAS

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

No segundo passo define-se a regio de interesse a ser segmentada mscara.

possvel criar diversas mscaras para um mesmo trabalho.

Configuraes pr-estabelecidas, figura 8.

Figura 8 Opes de segmentao pr-estabelecidas

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

Figura 9 Selecionar e renomear mscaras

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

Desenhar: utilizada para construir partes que sero projetadas tridimensionalmente.

Limiar: ao definir o limiar o software destacar as estruturas que obedecem densidade

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

Aps selecionar uma mscara e CRIAR SUPERFCIE, automaticamente o

Na figura 10, observa-se os planos (Axial, Sagital, Coronal) e agora a

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

Figura 10 Planos (Axial, Sagital, Coronal) e superfcie 3D.

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

Assim pode-se analisar a disposio de estruturas sobrepostas como msculos e ossos.

Figura 11 Sobreposio de imagens

4.1 MANIPULAO DO SOFTWARE

Etapa 4, aps a superfcie estar configurada e ter criado o modelo virtual, o