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Nucleicos
Blgo. Csar Alexander Ortiz Rojas
Laboratorio de Bioqumica y Biologa
Molecular
Facultad de Medicina - UNFV
ACIDO
DESOXIRIBONUCLEICO
(ADN)
Complementariedad
Antiparalelo
Curvaturas mayor y
menor
Naturaleza de un nucletido:
Se libera una molcula
de agua para la
formacin de un enlace
fosfoster.
H2
O
Nucletid
o
Creado por
la unin de
uno o ms
fosfatos
H2O
La liberacin de una
molcula de agua
permite la formacin de
un enlace glucosdico
No posee
grupo hidroxil
en la posicin
2
Nuclesid
o
Azcar +
base
Nuclesidos y nucletidos
Desoxitimidina
Desoxicitidina 5
Guanosin
ENLACE
FOSFODISTER
Unin entre:
3 hidroxilo de la 2desoxiribosa.
Grupo fosfato del 5
hidroxilo.
El esqueleto azcar-fosfato
es una caracterstica regular
de la estructura del ADN.
APAREAMIENTOS WATSON
-CRICK
GUANINA-CITOSINA
o Carbonilo C6
(aceptor)
o Nitrgeno en 1
(dador)
o Amino en C2
Amino en C4 (dador)
Nitrgeno en 3
(aceptor)
Carbonilo en C2
(aceptor)
APAREAMIENTOS WATSON
-CRICK
ADENINA-TIMINA
o Amino en C6
(dador)
Carbonilo en C4
(aceptor)
o Nitrgeno en 1
(dador)
Nitrgeno en 3
(aceptor)
Tautomerizacin
de la citosina
La disposicin de dadores y
aceptores de puentes de
hidrgeno impiden la
compatibilidad de citosina
con adenina.
Dnasa I: cliva
enlaces
fosfodister
Qu origina la curvatura
mayor y menor del ADN?
El ngulo entre los enlaces glucosdico
que los azcares de ambos nucletidos
forman en un par de bases es de
alrededor de 120, exponiendo las bases
a una cara de la hlice (curvatura
mayor).
G:C A A D H
C:G H D A A
A:T A D A M
T:A M A D A
Donde:
A: Aceptor de puentes de
hidrgeno
D: Donador de puentes de
hidrgeno
Estructura A
Observado a baja humedad
Adoptado en ciertos complejos
protena-ADN
Posee 11 pares de bases por vuelta
(rayos X)
Su curvatura mayor no es tan amplia
y ms profunda, mientras que la
menor es menos estrecha y menos
profunda
La inclinacin de las bases respecto al
Tambin observado en
eje es mayor.
hbridos ADN-ARN y
ARN-ARN
Estructura Z
El giro de este ADN es hacia la izquierda
La unin glucosdica entre azcar y base est
en conformacin syn en los residuos de purina.
La alternancia de repeticiones purina-pirimidina
(syn-anti) favorece esta estructura.
En solucin se forma en presencia de altas
concentraciones de cationes.
anti
syn
Proceso explicado
por la
hipocromicidad
de la doble hlice
Baja
concentracin
de sal
Alta
concentracin
de sal
Torsin toroidal
Torsin
plectonmica
Tericamente existe el
superenrollamiento negativo (Lk < 0)
y el superenrollamiento positivo (Lk >
0).
En bacterias y arqueas el
superenrollamiento est encargado de la
ADN girasa (topoisomerasa II).
Algunos antibiticos que actuan sobre
bacterias como quinolonas,
fluoroquinolonas y novobiocina, inhiben la
accin de la ADN girasa.
Topoisomeras
a II
(requiere ATP)
Topoisomeras
aI
(no requiere
ATP)
ACIDO RIBONUCLEICO
(ARN)
Contiene ribosa (OH en el
2).
Contiene uracilo (sin 5-metil
de la timina).
Usualmente de cadena
simple.
Estructuras Stem-Loop
Hairpin
Horquill
a
Bulge
Protuberanci
a
Loop
Bucle
Pseudoknots
3
6
1
La causa principal es
la libertad de rotacin de
los enlaces fosfosdister
en estas molculas.
Esto puede favorecer
apareamientos no
convencionales, como
un triple apareamiento
de bases.
Llamadas ribozimas.
Poseen un sitio activo.
Un sitio de unin al
sustrato.
Sitio de unin a
cofactores.
Rnasa P