Sejarah Penemuan DNA sbg

Materi Genetik
Penelitian Fred.Griffit
Penelitian Avery Mc.Leod & Mc.Charty
Penelitian Hershey-Chase.
1928 Fred Griffith
1928 Fred Griffith
Experiments of Avery (1944)
The Hershey-Chase Experiment (1952)
DNA sebagai materi genetik ?
Apakah hanya DNA saja sebagai materi
genetik ?
Ya atau tidak
Kalau tidak, apa materi genetik yang
lain ?
DNA
DNA intra nuklear = Kromosom
DNA Extra nuklear:
DNA Mitokondria
DNA Kloroplast
DNA
Fungsi DNA:
DNA memberi kode atau instruksi untuk
mengarahkan sintesis berbagai protein struktural dan
enzimatik spesifik di dalam sel.
Nucleus secara tidak langsung mengatur sebagian
besar aktivitas sel dan berfungsi sebagai pusat
kontrol sel.
DNA berfungsi sebagai cetak biru genetik selama
replikasi sel untuk memastikan bahwa sel
menghasilkan sel anak persis seperti induknya,
sehingga dapat terus dihasilkan jenis sel yang identik
dalam tubuh.
RNA
RNA Genetis = RNA yang ada pada
virus
RNA nongenetis:
mRNA
tRNA
rRNA
Bentuk DNA
Doble Helix
Umumnya pada sel
eukaryota
Circuler
Umumnya pada sel
Prokayota
Mitokondria
Kloroplast
Bacteri.
DNA
Dobel helix
Putar kanan
Anti paralel
Ikatan Hidrogen
antar Basa
Basa-basa
komplementer
Gulanya
Deoxyribosa
Basanya A, T, G, C.
Struktur basa Nitrogen
PASANGAN BASA NITROGEN
. DNA Composition (1869) nucleotides (ATCG)
Struktur DNA
Materi Genetik
Materi Genetik
Nukleotida & Back bone
Nukleotida terdiri dari:
Basa Nitrogen
Gula Deoxyribosa
Poly Posfat (PO4)
Nukleosida
Basa Nitrogen
Gula Deoxyribosa
Back Bone
Gula Deoxyribosa
Poly posfat
DNA-Materi genetik
Stabil
Ada ikatan H
Dobel helix
Super Coiled
Terikat dengan protein
Replikasi
Informasi genetik
Mutasi
Bagian DNA
Terdiri atas bagian Exon dan Intron
Microsatelit; pengulangan nukleotida (AC)n
Minisatelit; pengulangan lebih besar dari
mikrosatelit
Macrosatelit; letaknya dekat dengan
sentromer dan telomer, ukuranya mega basa
Interspersed; ada Alu repeat &Kpn repeat.
Genom
Informasi genetik yang lengkap pada suatu
organisme/Seluruh informasi genetik yang
terkandung pada kromosom haploid suatu
organisme (22+x/y).
E.Coli 4 juta bp
Sel Ragi 20 juta bp
Nematoda 50 juta bp
Lalat buah 100 juta bp
Manusia 3 milyar bp
Virus DNA 4 ribu bp.
Perbedaan RNA dari DNA
RNA single strand
Gulanya jenis Ribosa
Basa Thymin digantikan Urasil
Woble fenomenon
Analisa oleh Crick
Kedua basa anti kodon pada tRNA dapat
mengadakan ikatan hidrogen scr spesifik
dengan kedua basa kodon pada mRNA scr
antiparalel, yaitu yang satu dengan arah 5 ke
3 pada mRNA sedangkan pada lainnya dari
arah 3 ke 5 pada tRNA. Sedangkan basa
antikodon yang ke tiga tRNA dapat
mengadakan ikatan dengan basa lain yang
tidak lazim/bergoyang/berganti-ganti (Woble)
Contoh woble
Anti codon pada triplet codon
pada
I (inositol) A, U, C
G C, U
C G
A U
U A,G
HUKUM CHARGAFF
Pasangan Adenin-Thymin dan Guanin-
Cytosin
5-ATGCCAG-3
3-TACGGTC-5
Jadi sequen diatas complementary
dengan sequen yang di bawah.
Kode Genetik
Codogen.
Tiga pasangan basa pada rantai DNA
Codon
Tiga pasangan basa pasa rantai mRNA
Anticodon
Tiga pasangan basa pada rantai tRNA
Kode genetik
1. Kode triplet (Gamow,1954)20 as.amino dari 64 kombinasi.
2. Kode Degenerate(niremberg & Ochoa,1963)menemukan
semua deretan kodon dari nukleotida.
3. Kode nonoverlaping,
4. Arah pembacaan 5 ke 3 (5NH2____>COOH-3)
5. Kode nonsense (starting & Stop codon)
6. Fenomena Woble
7. Kode Universal, kodon informasi genetik akan mengkode
suatu as.amino spesifik yang sama untuk semua organisme
(virus-mammalia),jadi hanya ada 1 kode genetik untuk semua
organisme didunia ini.
Dogma sentra
DNA DNA = Replikasi
DNA RNA = Transkripsi
RNA Protein = Translasi
DNA Protein = ?
RNA DNA = Reverse Transkripsi
DNA Profiling
Identifikasi kasus kriminal
Identifikasi mayat
Identifikasi fosil
dll
KROMOSOM MANUSIA
Human Karyotipe
Human Chromosome
Normal Male & Female karyotipe
 ORIGIN (salmonella)
1 atggcacaag tcattaatac aaacagcctg tcgctgttga cccagaataa cctgaacaaa
61 tcccagtccg cactgggcac tgctatcgag cgtttgtctt ccggtctgcg tatcaacagc
121 gcgaaagacg atgcggcagg acaggcgatt gctaaccgtt ttaccgcgaa catcaaaggt
181 ctgactcagg cttcccgtaa cgctaacgac ggtatctcca ttgcgcagac cactgaaggc
241 gcgctgaacg aaatcaacaa caacctgcag cgtgtgcgtg aactggcggt tcagtctgcg
301 aatggtacta actcccagtc tgacctcgac tccatccagg ctgaaatcac ccagcgcctg
361 aacgaaatcg accgtgtatc cggccagact cagttcaacg gcgtgaaagt cctggcgcag
421 gacaacaccc tgaccatcca ggttggtgcc aacgacggtg aaactatcga tattgattta
481 aaagaaatca gctctaaaac actgggactt gataagctta atgtccaaga tgcctacacc
541 ccgaaagaaa ctgctgtaac cgttgataaa actacctata aaaatggtac agatcctatt
601 acagcccaga gcaatactga tatccaaact gcaattggcg gtggtgcaac gggggttact
661 ggggctgata tcaaatttaa agatggtcaa tactatttag atgttaaagg cggtgcttct
721 gctggtgttt ataaagccac ttatgatgaa actacaaaga aagttaatat tgatacgact
781 gataaaactc cgttggcaac tgcggaagct acagctattc ggggaacggc cactataacc
841 cacaaccaaa ttgctgaagt aacaaaagag ggtgttgata cgaccacagt tgcggctcaa
901 cttgctgcag caggggttac tggcgccgat aaggacaata ctagccttgt aaaactatcg
961 tttgaggata aaaacggtaa ggttattgat ggtggctatg cagtgaaaat gggcgacgat
1021 ttctatgccg ctacatatga tgagaaaaca ggtgcaatta ctgctaaaac cactacttat
1081 acagatggta ctggcgttgc tcaaactgga gctgtgaaat ttggtggcgc aaatggtaaa
1141 tctgaagttg ttactgctac cgatggtaag acttacttag caagcgacct tgacaaacat
1201 aacttcagaa caggcggtga gcttaaagag gttaatacag ataagactga aaacccactg
1261 cagaaaattg atgctgcctt ggcacaggtt gatacacttc gttctgacct gggtgcggtt
1321 cagaaccgtt tcaactccgc tatcaccaac ctgggcaata ccgtaaataa cctgtcttct
1381 gcccgtagcc gtatcgaaga ttccgactac gcaaccgaag tctccaacat gtctcgcgcg
1441 cagattctgc agcaggccgg tacctccgtt ctggcgcagg cgaaccaggt tccgcaaaac
1501 gtcctctctt tactgcgtta a
BLASTN 2.2.17 (Jun-24-2007)
RID: CRCY0ZSJ014 Database: All GenBank+EMBL+DDBJ+PDB sequences (but no EST,
STS,GSS,environmental samples or phase 0, 1 or 2 HTGS sequences) 5,751,035
sequences; 21,423,106,532 total letters
If you have any problems or questions with the results of this search
please refer to the BLAST FAQs
 Protein flagellin

ORIGIN
1 atggcacaag tcattaatac aaacagcctg tcgctgttga cccagaataa cctgaacaaa
61 tcccagtccg cactgggcac tgctatcgag cgtttgtctt ccggtctgcg tatcaacagc
121 gcgaaagacg atgcggcagg acaggcgatt gctaaccgtt ttaccgcgaa catcaaaggt
181 ctgactcagg cttcccgtaa cgctaacgac ggtatctcca ttgcgcagac cactgaaggc
241 gcgctgaacg aaatcaacaa caacctgcag cgtgtgcgtg aactggcggt tcagtctgcg
301 aatggtacta actcccagtc tgacctcgac tccatccagg ctgaaatcac ccagcgcctg
361 aacgaaatcg accgtgtatc cggccagact cagttcaacg gcgtgaaagt cctggcgcag
421 gacaacaccc tgaccatcca ggttggtgcc aacgacggtg aaactatcga tattgattta
481 aaagaaatca gctctaaaac actgggactt gataagctta atgtccaaga tgcctacacc
541 ccgaaagaaa ctgctgtaac cgttgataaa actacctata aaaatggtac agatcctatt
601 acagcccaga gcaatactga tatccaaact gcaattggcg gtggtgcaac gggggttact
661 ggggctgata tcaaatttaa agatggtcaa tactatttag atgttaaagg cggtgcttct
721 gctggtgttt ataaagccac ttatgatgaa actacaaaga aagttaatat tgatacgact
781 gataaaactc cgttggcaac tgcggaagct acagctattc ggggaacggc cactataacc
841 cacaaccaaa ttgctgaagt aacaaaagag ggtgttgata cgaccacagt tgcggctcaa
901 cttgctgcag caggggttac tggcgccgat aaggacaata ctagccttgt aaaactatcg
961 tttgaggata aaaacggtaa ggttattgat ggtggctatg cagtgaaaat gggcgacgat
1021 ttctatgccg ctacatatga tgagaaaaca ggtgcaatta ctgctaaaac cactacttat
1081 acagatggta ctggcgttgc tcaaactgga gctgtgaaat ttggtggcgc aaatggtaaa
1141 tctgaagttg ttactgctac cgatggtaag acttacttag caagcgacct tgacaaacat
1201 aacttcagaa caggcggtga gcttaaagag gttaatacag ataagactga aaacccactg
1261 cagaaaattg atgctgcctt ggcacaggtt gatacacttc gttctgacct gggtgcggtt
1321 cagaaccgtt tcaactccgc tatcaccaac ctgggcaata ccgtaaataa cctgtcttct
1381 gcccgtagcc gtatcgaaga ttccgactac gcaaccgaag tctccaacat gtctcgcgcg
1441 cagattctgc agcaggccgg tacctccgtt ctggcgcagg cgaaccaggt tccgcaaaac
1501 gtcctctctt tactgcgtta a