Un péptido es una molécula formada por la unión de aminoácidos a través de enlaces peptídicos. El conocimiento de la secuencia de aminoácidos de una proteína permite predecir su función, clasificarla en familias y detectar secuencias relacionadas con funciones importantes. La secuencia de una proteína puede determinarse mediante la rotura de los enlaces, identificación de los extremos y fragmentos peptídicos, y ordenamiento de los fragmentos.
Un péptido es una molécula formada por la unión de aminoácidos a través de enlaces peptídicos. El conocimiento de la secuencia de aminoácidos de una proteína permite predecir su función, clasificarla en familias y detectar secuencias relacionadas con funciones importantes. La secuencia de una proteína puede determinarse mediante la rotura de los enlaces, identificación de los extremos y fragmentos peptídicos, y ordenamiento de los fragmentos.
Un péptido es una molécula formada por la unión de aminoácidos a través de enlaces peptídicos. El conocimiento de la secuencia de aminoácidos de una proteína permite predecir su función, clasificarla en familias y detectar secuencias relacionadas con funciones importantes. La secuencia de una proteína puede determinarse mediante la rotura de los enlaces, identificación de los extremos y fragmentos peptídicos, y ordenamiento de los fragmentos.
- UNA PROTEINA SON LA UNION DE MUCHOS PEPTIDOS- 1.-Dipéptidos 2.Tripéptidos 3.Tetrapéptidos 4.Polipeptido El conocimiento de la secuencia de aminoácidos permite: Predecir la función de la proteína. Clasificar las proteínas en familias. Detectar secuencias de aminoácidos relacionadas con funciones importantes (localización celular, interacciones, etc.). Conocer relaciones genéticas y evolutivas. 1. Rotura de todos los enlaces disulfuro. 2. Determinación de los aminoácidos N- terminal y C-terminal. 3. Rotura del polipéptido en fragmentados. 4. Determinación de las secuencias de los fragmentos peptídicos. 5. Ordenamiento de los fragmentos peptídicos. 1. Se determina el amino-terminal (que reacciona con FDNB). En esta posición hay una glicina. 2. Se determina el contenido en aminoácidos (mediante hidrólisis acida). Se seleccionan los reactivos para romper (digerir) la secuencia según la presencia de residuos diana idóneos. 3. Se corta la proteína para obtener polipéptidos mas cortos (por ejemplo con tripsina). Luego se secuencia cada polipéptido. 4. Se determina el orden de los polipéptidos en la proteína. El péptido 3 se encuentra en el extremo amino. El péptido 2 esta en el extremo carboxílico (no termina con un aminoácido que defina el punto de corte de la tripsina). 5. Se ordenan los otros péptidos mediante solapamientos con secuencias de péptidos obtenidos por digestión de la proteína con un reactivo diferente, como por ejemplo bromuro de cianógeno o la quimotripsina.
Ponemos esto o la imagen del lehninger que esta mas
chila y mejor explicada La espectrometría de masas Consiste en la degradación repetitiva de los péptidos a partir de una reacción con el grupo amino terminal libre y con fenilisotiocianato (PITC) en condiciones alcalinas suaves formando feniltiocarbamilo, el producto es entonces tratado con ácido fluorhídrico para liberar el aminoácido que ha reaccionado del resto de la cadena peptídica mediante la formación de un derivado de tiazolinona, el cual es convertido a un derivado más estable (un aminoácido PHT) por la adición de TFA. Como consecuencia el péptido tiene ahora un nuevo residuo amino terminal listo para repetir el ciclo. La identificación de los PHT-aminoácidos es usualmente llevada a cabo por RP-HPLC. El procedimiento de la degradación de Edman o secuenciación de Edman marca y elimina sólo el residuo N- terminal de un polipéptido, dejando el resto de enlaces peptídicos intactos. Para ello, se hace reaccionar el péptido con PITC (fenilisotiocianato) eliminándose el residuo N-terminal en forma de derivado de fenilhidantoína (PTH). Después de la eliminación e identificación del residuo N-terminal mediante HPLC, el nuevo residuo N- terminal puede ser marcado, eliminado e identificado por repetición de la misma serie de reacciones. Este procedimiento se repite hasta que se ha determinado toda la secuencia.