The Citric Acid Cycle

• Three processes play central roles in aerobic 
metabolism
• Citric acid cycle (TCA cycle, Krebs cycle) Know all 
structures!
• Electron transport chain
• Oxidative phosphorylation
Metabolism: the chemical changes in living cells by which energy 
is provided for vital processes and activities and new material is 
assimilated, consists of…
• catabolism: the oxidative breakdown of nutrients
catabolism:
• anabolism: the reductive synthesis of biomolecules
anabolism:
• The citric acid cycle is amphibolic; that is, it 
amphibolic
plays a role in BOTH catabolism and anabolism
16­1
The Citric Acid Cycle: overview
Pyruvate
NAD+ Responsible for 
NADH producing NADH 
Acetyl­CoA Coenzyme A that is used for 
NADH ATP production by 
electron transport
NAD+ Citric NAD+
acid
cycle NADH
FADH2
(8 steps)
CO2 Remember, for 
FAD NAD+ every glucose, this 
GTP
NADH cycle occurs twice!
GDP CO2
16­2
 Pyruvate to Acetyl­CoA
• Oxidation by NAD+ and formation of a thioester
pyruvate made up of
O dehydrogenase 5 enzymes
CH3 CCOO- + CoA-SH + NAD+ complex

Pyruvate Coenzyme A
O
CH3 C-SCoA + CO2 + NADH
Acetyl­CoA
First NADH produced
in TCA cycle!

• this 5 step conversion requires NAD+, FAD, Mg2+, 
thiamine pyrophosphate, coenzyme A, and lipoic acid
• ∆G°’ = ­33.4 kJ•mol­1    drives formation of acetyl­CoA
16­3
 The Citric Acid Cycle
• Step 1: condensation of acetyl­CoA with 
oxaloacetate; ∆G°’ = ­32.8 kJ•mol­1 (results from
high energy thioester bond)
O condensation refers to
CH3 C-SCoA new C­C bond formation
Acetyl­CoA citrate CH2 ­COO­
synthase + Co A­S H
+ HO C­COO­
­ Coenzyme A
O C­COO CH2 ­COO­
CH2 ­COO­ Citrate
Oxaloacetate

• citrate synthase is an allosteric enzyme, inhibited by 
NADH, ATP, and succinyl­CoA
16­4
 The Citric Acid Cycle
• Step 2: dehydration and rehydration gives 
isocitrate; catalyzed by aconitase

example of an isomerization

CH2 -COO- CH2 ­COO­ CH2 ­COO­

HO C-COO- C­COO­ H C­COO­
CH2 -COO- CH­ COO­ HO CH­ COO­
Citrate Aconitate Isocitrate
H2O H2O

16­5
 The Citric Acid Cycle
• Step 3: oxidation of isocitrate followed by 
decarboxylation
Second NADH
CH2 -COO- NAD+ NADH
Produced in TCA cycle!
H C-COO-

HO CH-COO- 
Isocitrate
CH2 ­COO­   CH2 ­COO­
H C­COO­ H C­H
 C­COO­  C­COO­
 α

•  isocitrate dehydrogenase is an allosteric enzyme; it is 
inhibited by ATP and NADH, activated by ADP and 
NAD+
16­6
The Citric Acid Cycle
• Step 4: oxidative decarboxylation of 
α­ketoglutarate to succinyl­CoA
third NADH produced
Co A­S H in TCA cycle!

CH2 -COO- NAD+ NADH CH2 ­COO­

CH2 CH2 + CO2
a­ketoglutarate
O C-COO -
dehydrogenase O C SCo A
complex Succinyl­CoA thioester
α­Ketoglutarate

• like pyruvate dehydrogenase, α­ketoglutarate 
dehydrogenase is a multienzyme complex and requires 
coenzyme A, thiamine pyrophosphate, lipoic acid, FAD, 
and NAD+
• ∆G0’ = ­33.4 kJ•mol­1   drives formation of succinyl­CoA
16­7
 The Citric Acid Cycle
• Step 5: formation of succinate
CH2 -COO- succinyl­CoA
synthetase CH2 ­COO­
CH2 + GDP  +   P i ­
+ GTP + Co A­S H
CH2 ­COO
O C SCoA
Succinyl­CoA Succinate ATP

• this is the first energy­yielding step of the cycle
• breakage of the thioester drives GTP formation
∆ 

Succinyl­CoA + H2 O + CoA-SH
Succinate 
GDP + Pi GTP + H2 O 
          
16­8
 The Citric Acid Cycle
• Step 6: oxidation of succinate to fumarate
goes to electron
transport chain
FAD FADH2 H COO­
CH2 -COO- C
CH2 -COO- succinate ­ C
OOC H
dehydrogenase
Succinate Fumarate

• Step 7: hydration of fumarate to form malate

H COO-
C H2 O HO CH­ COO­
-
OOC
C
H fumarase CH2 ­COO­
Fumarate L­Malate

16­9
 The Citric Acid Cycle
• Step 8: oxidation of malate to oxaloacetate

fourth NADH produced
in TCA cycle

HO CH­ COO­ NAD+ NADH O C-COO

-

CH2 ­COO­ CH2 -COO-

malate
L­Malate dehydrogenase Oxaloacetate

• Completes TCA cycle to produce oxaloacetate
for condensation with new acetyl­CoA 16­10
The TCA cycle at a glance
Pyruvate dehydrogenase complex
Pyruvate+ CoA­SH + NAD+
Acetyl-CoA+ NADH + CO2 + H+

Citric acid cycle

Acetyl-CoA+ 3NAD+ + FAD + GDP + Pi + 2H2 O
2CO2 + CoA-SH + 3NADH + 3H++ FADH2 + GTP

Pyruvate+ 4NAD+ + FAD + GDP + Pi + 2H2 O

+
3CO2 + 4NADH + FADH2 + GTP + 4H

Since glycolysis results in 2 pyruvate per glucose,
this reaction should be doubled to tell you how much

you get from 1 glucose.  
16­11
Control of the TCA Cycle
Figure 16.7 Conversion of pyruvate to acetyl­CoA

High ATP, NADH,
                        and TCA cycle
intermediates 
indicate surplus 
energy in the cell.  

The opposite Is
true for high ADP
and NAD+.

16­12
Control continued
• Cells in a resting metabolic state
• need and use comparatively little energy
• high ATP, low ADP imply high ATP/ADP ratio
• high NADH, low NAD+ imply high NADH/NAD+ ratio
• results in inactivation of metabolism

• Cells in an active metabolic state
• need and use more energy than resting cells
• low ATP, high ADP imply low ATP/ADP ratio
• low NADH, high NAD+ imply low NADH/NAD+ ratio
• results in stimulation of metabolism
16­13
TCA Cycle in Catabolism
• The breakdown products of proteins, 
carbohydrates, and fatty acids all feed into the 
citric acid cycle at one or more points
  
Generation of energy
 Pyruvate from proteins does not
require glycolysis and
 should result in less
ATP production than
from glucose.
α
 
 
 

16­14
 CA Cycle in Catabolism
Figure 16.9 A summary of catabolism

                              
                               

16­15
The TCA Cycle in Anabolism
• The citric acid cycle is also a source of starting 
materials for the biosynthesis of other 
compounds
• examples include:

O NH3 +
 ­
-
OOCCH2 CH2 CCOO -
OOCCH2 CH2 CHCOO­
α 

O NH3 +
­ ­
transamination ­
OOCCH2 CCOO OOCCH2 CHCOO­
 

16­16
 CA Cycle and Anabolism
• If a component of the citric acid cycle is taken out 
for biosynthesis, it must be replaced to keep the 
cycle going

• oxaloacetate, for example, is replaced by the 
carboxylation of pyruvate (no energy produced from 
this molecule of pyruvate)

O O
biotin
CH3 CCOO- + CO2 + ATP CH2 CCOO- + ADP + Pi
pyruvate
Pyruvate carboxylase COO-
Oxaloacetate

16­17
The TCA Cycle in Anabolism
The supply of metabolic intermediates

                        If intermediates are
removed from the
TCA cycle, acetyl­CoA
will build up and trigger
the production of
oxaloacetate from 
pyruvate and CO2.  This
replenishes the pathway.

16­18
The TCA Cycle in Anabolism
Transfer of materials in gluconeogenesis

                             Occurs when energy level
in the cell causes catabolism
to be shut down.  Pyruvate 
will be shuttled out of the
mitochondrion either in
the form of PEP or malate. 

16­19
 The TCA Cycle in Anabolism
• Lipid anabolism (production) begins with acetyl­
CoA and takes place in the cytosol
acetyl­CoA is produced mainly in mitochondria from 
pyruvate by breakdown of fatty acids and 
carbohydrates
an indirect transfer mechanism, involving citrate, 
exists to get acetyl­CoA into the cytoplasm for 
anabolism­ citrate can freely cross the membrane
Citrate + CoA-SH + ATP
Acetyl-CoA+ Oxaloacetate D + Pi
+ ATP

FA biosynthesis
16­20
The TCA Cycle in Anabolism
Oxaloacetate + NADH + H+ Malate+ NAD+

Malate+ NADP+ Pyruvate+ CO2 + NADPH + H+

• the net effect of these two reactions is replacement of 
NADH by NADPH, which may be used for reductive
biosyntheses
• while there is some NADPH produced by this means, 
its principal source is the pentose phosphate pathway
• The anabolic reactions that produce amino acids 
and many other biomolecules begin with TCA 
cycle molecules that are transported into the 
cytosol
16­21
 TCA Cycle and Anabolism
Summary of anabolism

                     

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