Metabolismo microbiano

1. Conceitos bsicos 2. Classes microbianas 3. Quimiotrofia 4. Fototrofia 5. Quimiolitotrficos 6. Integrao metablica

1.Conceitos bsicos
Metabolismo
Do grego metabole = mudana, transformao

METABOLISMO Conjunto das reaes bioqumicas que ocorrem dentro da clula

Catabolismo

Anabolismo

BIODEGRADAO

BIOSSNTESE

Obteno de energia

A partir de: compostos orgnicos Energia

luz compostos inorgnicos

Estocagem da energia
A energia liberada das reaes deve ser conservada para utilizao pelas clulas. A energia armazenada em ligaes qumicas de alta energia (fosfato) em molculas simples, de forma a ser prontamente utilizvel.

O ATP o composto de alta energia mais importante nos seres vivos.

Apesar disso sua concentrao nas clulas relativamente baixa, sendo consumido ao mesmo tempo em que produzido. Para o armazenamento de energia por perodos longos, os microrganismos produzem polmeros insolveis que podem ser oxidados posteriormente. Ex.: polmeros de glicose (amido e glicognio), polmeros lipdicos, PHAs (biopolister).

Ralstonia eutropha

Utilizao de energia
A clula produz energia para:
Sntese de seus componentes: parede, membrana, etc.
sntese de enzimas, cidos nuclicos, polissacardeos, etc. reparos e manuteno crescimento e multiplicao

acumulao de nutrientes e excreo de produtos indesejveis

motilidade

Vias metablicas
a) As reaes metablicas ocorrem de forma gradual (etapas) nas
quais os tomos dos intermedirios so re-arranjados at a formao do produto final. b) Cada etapa requer uma enzima especfica c) A sequncia das reaes, comeando pelos primeiros ingredientes at ao produto final, se denomina VIA METABLICA.

As reaes de oxi-reduo (redox)

Nas vias metablicas importante considerar as reaes de oxidao e reduo: - Um composto se torna reduzido quando: 1. Ganha eltrons 2. Se liga a um tomo menos eletronegativo 3. E geralmente isto ocorre quando se liga ao hidrognio

- Um conposto se torna oxidado quando:

1. Perde eltrons 2. Se liga a um tomo mais eletronegativo 3. Isto geralmente ocorre quando se liga ao oxignio

Formas reduzidas de C (carbohidratos, metano, lipdios, lcoois) so responsveis por importantes estocagens de energia em suas ligaes. Formas oxidadas de C (cetonas, aldedos, cidos carboxlicos e CO2) dispem de pequeno potencial energtico em suas ligaes.

OXIDAO-REDUO DE COMPOSTOS DE ALTA ENERGIA

O doador de eltrons referido como fonte de energia. A quantidade liberada de energia depende da natureza do doador quanto do receptor.

Transportadores de eltrons
As Enzimas que catalizam as reaes requerem o transporte de eltrons de uma parte para a outra da via metablica.
Molculas relativamente pequenas realizam o transporte. Classes: - Que se difundem livremente: NAD+, NADP+ - Associados membrana: Flavoprotenas FMN/FAD Protenas com Fe e S Quinonas Citocromos

NAD+ + 2 e- + 2 H+ NADH + H alto potencial redutor

As clulas contm uma quantidade limitada de NAD, sendo que sua forma reduzida NADH2 precisa ser continuamente re-oxidada para manter o processo metblico.

TRANSPORTADORES DE ELTRONS So intermedirios nas reaes de oxidao-reduo em clulas:

NAD - nicotinamida adenina dinucleotdeo (coenzima) FAD flavina-adenina mononucleotdeo (flavoprotena) FMN flavina mononucleotdeo (flavoprotena) Citocromos (protico) Quinonas (no protico)

So responsveis pela eficincia na obteno de energia.

Estgios das reaes:

1 - remoo dos eltrons 2 - transferncia 3 - adio ao aceptor final

2. Classes microbianas

Fluxo da energia

Rendimento de at 45%

A concentrao de ATP na clula baixa. Numa clula em plena atividade chega a 2 mM

Mecanismos para conservao de energia

(sntese de ATP)

Os Quimiotrficos apresentam dois mecanismos conhecidos:

1. RESPIRAO: atuam aceptores externos de eltrons (fosforilao oxidativa) Podendo ser: Aerbia: o aceptor externo o oxignio Anaerbia: aceptores diferentes do oxignio (nitrato, sulfato, carbonato, ...) 2. FERMENTAO: ocorre na ausncia de aceptores externos de eltrons (fosforilao em nvel de substrato)

1. Respirao aerbia: o procedimento mais comum s clulas e compreende 3 etapas:

1) Piruvato (gliclise quando o substrato a glicose) 2) Ciclo do cido ctrico (ciclo de Krebs) 3) Cadeia respiratria

1 etapa: Via Glicoltica ou Gliclise

considerada a via metablica mais primitiva, presente em todas as formas de vida atuais. Ocorre no citoplasma das clulas.

Caractersticas: 1. Oxidao parcial da glicose a cido pirvico 2. Pequena quantidade de ATP produzida 3. Pequena quantidade de NAD reduzida a NADH

Diversas vias glicolticas

Quatro vias glicolticas importantes nos diferentes microrganismos:
1. Via Embden-Meyerhoff-Parnas (EMP) Gliclise clssica Presente em todos os organismos vivos 2. Via Hexose monofosfato (HMP) Presente em quase todos os organismos Responsvel pela sntese das pentoses usadas na sntese de nucleotdios 3. Via Entner-Doudoroff (ED) Encontrada nas Pseudomonas e gneros relacionados 4. Via Fosfoketolase (FK) Encontrada no gnero Bifidobacterium e Leuconostoc

2 etapa: Ciclo de Krebs

Ocorre no citoplasma (procariotos) e nas mitocndrias (eucariotos).

Reaes preparatrias: formao de composto chave do processo

Produo direta de 1 GTP guanosina trifosfato (equivalente ao ATP)

Alm do papel-chave nas reaes catablicas, o ciclo de Krebs importante nas reaes biossintticas.

Os intermedirios so desviados para vias biossintticas quando necessrio:

Exemplos: -cetoglutarato: precursor de aminocidos Oxalacetato: precursor de aminocidos Succinil-CoA: formao de citocromos e da clorofila, entre outros Acetil-CoA: biossntese de cidos graxos

3 etapa: Cadeia respiratria (sistema de transporte de eltrons)

Ocorre ao nvel da membrana das mitocndrias (eucariotos) e na membrana citoplasmtica (procariotos)

Os prtons e eltrons recolhidos na gliclise pelo NAD e no Ciclo de Krebs pelo NAD e FAD so transportados ao longo de uma cadeia de citocromos em nveis sucessivamente mais baixos de energia de modo que seja melhor aproveitada na formao de ATP.

As 3 etapas da via respiratria

Fosforilao oxidativa
Gerao da fora protomotiva

Sistema O/R: prximo membro do sistema tem maior capacidade para receber eltrons

Sntese da respirao aerbia

Reaes de oxidao e reduo em presena de um aceptor de eltrons externo, o O2 A molcula inteira do substrato oxidada at CO2 Alto potencial de energia Grande quantidade de ATP gerada: at 38 ATPs
Produo de ATP: Na cadeia respiratria: 4 NADH formados na gliclise geram 6 NADH formados no ciclo de Krebs geram 2 FADH formados no ciclo de Krebs geram Formao direta na Gliclise Formao direta no Ciclo de Krebs 12 ATP 18 ATP 4 ATP 2 ATP 2 GTP

Total de at .................................................... 38 ATP

Respirao anaerbia
uma variao alternativa da respirao aerbia: o aceptor de eltrons no o oxignio. Uma implicao que rendimento energtico inferior: nenhum dos aceptores alternativos apresenta potencial to oxidante quanto o oxignio. Em contrapartida, o uso de aceptores alternativos permitiram os microrganismos respirarem em ambientes sem oxignio, sendo de extrema importncia ecolgica. Uma aplicao importante que ganhou muita ateno nos dias atuais a utilizao de processos anaerbios no tratamento de efluentes:

A respirao anaerbia, exclusividade dos procariotos, s ocorre em ambientes onde o oxignio escasso, como nos sedimentos ou prximo de nascentes hidrotermais submarinas.

Aceptor final de eltrons diferente do O2

Exemplos:

C6H12O6 + 12 NO3- 6CO2 + 6H2O + 12NO2 2 lactato + SO4= + 4H+ 2CO2 + S= + H2O + 2 acetato

2. Fermentao

(tambm uma forma de respirao anaerbia)

Reao de oxidao-reduo internamente balanceada. Ausncia de aceptores externos.

A concentrao de NADH nas clulas baixo, precisando ser re-oxidado para no cessar a via glicoltica. A reduo do piruvato a etanol ou outros produtos de restabelece o NAD e permite a continuidade da gliclise . Produo lquida de apenas 2 ATP.

Caractersticas da fermentao:
cido pirvico reduzido a cidos orgnicos e lcoois NADH oxidado a forma NAD: essencial para operao continuada da via glicoltica O2 no necessrio

No h obteno adicional de ATP.

Gases (CO2 e/ou H2) podem ser produzidos

As vias fermentativas so teis na identificao bioqumica:

Fermentao de mltiplos cidos

Escherichia coli Base para teste Vermelho de Metila (VM)

Fermentao 2,3-Butanodiol

Enterobacter aerogenes Base para o teste de Voges-Proskauer (VP)

Tambm so utilizadas na indstria:

Snteses de compostos orgnicos importantes

Fototropia
A utilizao da energia da luz - Fotossntese

a. Fotossntese oxignica

Cloroplasto

Presente nas cianobactrias e nos cloroplastos dos eucariontes (microalgas por ex.) Doador de eltrons H2O: sua oxidao gera o O2 como subproduto. Dois fotossistemas: PSI e PSII Maior funo produzir NADPH e ATP para a fixao de C (produo de matria orgnica)
Cianobactrias
Fotossistemas em lamelas

Fotossntese oxignica

Cianobactrias

Fotofosforilao
A energia da luz utilizada para a sntese de ATP

O NADPH utilizado para reduzir o CO2 no processo de fixao do CO2

Fotossntese anoxignica
Doadores de eltrons variam: H2S or So nas bactrias verdes e prpuras sulfurosas H2 ou compostos orgnicos em bactrias verdes e prpuras no sulfurosas Apenas um fotossistema Bactrias verdes tem foto-sistema semelhante ao PSI Bactrias prpuras tem foto-sistema semelhante ao PSII Principal funo produzir ATP via fotofosforilao

Bactrias verdes

Bacterioclorofilas e carotenides

Yellowstone Park,USA

Fotossntese anoxignica (bactrias prpuras)

Fotofosforilao ciclica

Gerao de poder redutor para a reduo do CO2.

Quimiolitotrofia

Caractersticas

Eltrons so removidas de doadores inorgnicos. Os eltrons passam atravs de uma membrana ligada a um sistema de transporte de eltrons geralmente acoplado a sntese de ATP e NADH.

Os eltrons finalmente passam para um receptor final ATP e NADH so usados para converter CO2 em carboidrato

Exemplos de doadores de eltrons:

Amnia (NH4+) Nitrito (NO2-) nas Nitrosomonas Nitrito (NO2-) Nitrato (NO32-) nas Nitrobacter Sulfeto de hidrognio (H2S) Enxofre (So) em Thiobacillus, Beggiatoa, Thiomargarita

Enxofre (So) Sulfato (SO42-) em Thiobacillus

Hidrognio (H2) gua (H2O) em Alcaligenes

Thiomargarita namibiensis: uma bactria gigante

Exemplos de receptores de eltrons

Oxignio (O2) gua (H2O)

em diversos organismos

Dixido de carbono (CO2) Metano (CH4)

nas bactrias metanognicas

4H2 + CO2 => CH4 + 2H2O Delta G = -31 kcal/mol

Utilizao da energia

Generalidades: As vias comeam com a sntese das unidades estruturais simples. As unidades estruturais so ativadas com a energia de molculas como o ATP e GTP. As unidades estruturais so unidas para formar substncias complexas da clula.

Acares Aminocidos Nucleotdeos cidos graxos

Integrao do catabolismo e anabolismo

Ex. Fornecimento de precursores para biossntese aminocidos